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Les chercheurs recensent des sous-types et des indices neufs de cancer de rein pour améliorer le diagnostic, demande de règlement

Dans on pense que ce qui est la caractérisation moléculaire la plus complète jusqu'à présent du plus courant - et souvent demande de règlement-résistant - forme du cancer de rein, des chercheurs aux services de Johns Hopkins de la pathologie et de l'oncologie, du centre de lutte contre le cancer de Johns Hopkins Kimmel, et de la preuve d'état d'École de Médecine d'Université John Hopkins pour au moins trois sous-types distincts de cancer à cellules rénales de cellule claire (ccRCC), avec des révélations neuves au sujet des protéines qui les définissent. Leurs découvertes ont pu aviser la survie des malades et la réaction générales à la demande de règlement.

Les chercheurs recensent des sous-types et des indices neufs de cancer de rein pour améliorer le diagnostic, demande de règlement
Crédit : Jennifer E. Fairman

Leur enquête de plongée en eau profonde sur le ccRCC, décrite dans la question du 31 octobre de la cellule de tourillon, échantillons impliqués de tumeur provenant de 110 patients qui n'avaient pas encore reçu la demande de règlement, telle que la chimiothérapie et la radiothérapie, et 84 échantillons de tissu sain entourant les tumeurs.

Les chercheurs avaient l'habitude les technologies génomiques et proteomic les plus avancées procurables pour taquiner à l'extérieur leurs caractéristiques proteogenomic, définies en tant que le renivellement génétique (génomique), les modifications chimiques à ADN (epigenomics), l'ARN messager situé dans les cellules qui sert de matrice pour effectuer des protéines (transcriptomics), et les protéines (protéomique) et leur modification près du groupe de phosphate (phosphoproteomics), une modification connue pour régler des fonctionnements de protéine par le changement mise en marche/arrêt. Les travaux ont été terminés en tant qu'élément du consortium clinique d'analyse de tumeur de Proteomic de l'Institut national du cancer (CPTAC), un effort national pour comprendre mieux des cancers par le proteogenomics.

Parmi leurs découvertes, les chercheurs disent, étaient que la perte du chromosome 3p est un cachet apparent de ccRCC, se produisant dans presque tous les échantillons de tumeur dans l'étude.

De plus, les chercheurs ont recensé quatre sous-types basés sur immunisé distincts de ccRCC basés sur leurs différences de cellule immunitaire qui potentiellement pourraient être employées pour aider à prévoir la survie générale et la réaction des patients à la demande de règlement.

Parmi tous les cancers de rein, le ccRCC représente 75%, égalisant à environ 65.000 cas neufs annuellement. L'ablation chirurgicale demeure le seul traitement efficace pour les cancers qui n'ont pas écarté au delà du rein, mais pour 30% de patients présents avec la maladie avancée au diagnostic.

Historiquement, le ccRCC a été considéré résistant à la chimiothérapie et à la radiothérapie conventionnelles, et la réaction à plusieurs médicaments approuvés par le FDA a été limitée. L'atlas de génome du cancer de l'Institut national du cancer (TCGA) a catalogué des altérations génétiques responsables de beaucoup de cancers comprenant le ccRCC, mais s'interroge resté. »

Daniel W. Chan, Ph.D., professeur de pathologie et d'oncologie, et directeur du centre pour la découverte et la traduction de biomarqueur à l'École de Médecine d'Université John Hopkins

« Nos résultats illustrent la complexité du développement du cancer, et cela nous pouvons employer la protéomique et phosphoproteomics en plus de la génomique pour apprendre plus au sujet des phénotypes de cancer et de leur hétérogénéité, » dit Hui Zhang, Ph.D., chercheur Co-principal de l'étude, professeur de pathologie et d'oncologie, et directeur de l'installation de faisceau de spectrométrie de masse à l'École de Médecine d'Université John Hopkins.

« L'utilisation d'un type d'étude moléculaire de comprendre le cancer est assez plus. Une approche multi-omic est nécessaire pour caractériser entièrement le cancer, » dit l'auteur et le boursier post-doctoral David J. Clark, Ph.D. d'étude de fil.

Actuel, Clark ajoute, demande de règlement de ligne du front pour le ccRCC qui ne peut pas être corrigé chirurgicalement est concentré sur l'angiogenèse inhibante, le procédé par lesquels les cancers développent les vaisseaux sanguins neufs pour mettre à jour l'alimentation et l'accroissement, et viser un mTOR appelé de protéine kinase que les aides règlent la survie et la division de cellules. Le recouvrement des caractéristiques proteomic et phosphoproteomic permet, il dit, aux chercheurs pour trouver une plus grande sélection d'objectifs potentiels pour le développement neuf de médicament.

D'autres recherches de clés de l'analyse ont trouvé cela :

Il y avait quatre sous-types distincts de ccRCC basés sur leurs signatures de micro-environnement de tumeur :

  1. Les tumeurs enflammées de CD8-positive ont eu beaucoup de cellules immunitaires de CD8-positive et répondentes aux voies de signalisation de cellules liées à une réaction immunitaire.
  2. Les tumeurs enflammées de CD8-negative ont eu une absence proche des cellules immunitaires de CD8-positive mais ont eu des cellules telles que les fibroblastes, qui introduisent la cicatrisation, et les macrophages, qui combattent des cancers et d'autres corps étrangers.
  3. Les tumeurs immunisées de désert (VEGF) de facteur de croissance endothélial vasculaire n'ont eu aucune cellule immunitaire mais ont eu une forte présence de cellules endothéliales liées au développement de l'accroissement neuf de vaisseau sanguin de la progression tumorale.
  4. Les cellules immunisées métaboliques de désert étaient des cellules tumorales plus pures avec presque aucune cellules immunitaires et très peu de fibroblastes.

Basé sur les caractéristiques d'atlas de génome de cancer, Clark dit, il s'est avéré que ceux avec des tumeurs enflammées de CD8-positive auraient une plus mauvaise survie générale tandis que ceux avec des tumeurs immunisées de désert de VEGF auraient la meilleure survie générale. Les modèles prévisionnels neufs par les chercheurs ont constaté que ceux avec des tumeurs de CD8-positive auraient la meilleure réaction aux traitements immunisés de point de reprise, alors que ceux avec des tumeurs immunisées de désert de VEGF montreraient la meilleure réaction aux traitements d'anti-angiogenèse, les demandes de règlement visées qui ont coupé des tumeurs hors circuit de leur approvisionnement en sang.

« De façon générale, cette étude indique les seules analyses biologiques qui sont gagnées seulement en combinant proteomic complémentaire et des analyses génomiques, » dit Zhang. « Notre analyse multiniveaux d'omics a recensé les mécanismes moléculaires fondamentaux qui ne sont pas entièrement captés au niveau génomique, et définit la phosphorylation de protéine et les signatures immunisées nécessaires pour stratifier des patients de ccRCC dans le but de se développer mieux, intervention thérapeutique plus visée. »

Les prochains régimes d'équipe pour employer les méthodes assimilées à caractérisent plus entièrement les cancers pancréatiques et principaux et de col.

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