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Os pesquisadores identificam subtipos e indícios novos do cancro do rim para melhorar o diagnóstico, tratamento

Em o que é acreditada para ser a caracterização molecular a mais detalhada até agora do mais comum - e frequentemente tratamento-resistente - forma do cancro do rim, dos pesquisadores nos departamentos de Johns Hopkins da patologia e da oncologia, do centro do cancro de Johns Hopkins Kimmel, e da evidência do relatório da Faculdade de Medicina da Universidade Johns Hopkins no mínimo três subtipos distintos da carcinoma renal da pilha da pilha clara (ccRCC), junto com revelações novas sobre as proteínas que as definem. Seus resultados podiam informar a sobrevivência paciente e a resposta totais ao tratamento.

Os pesquisadores identificam subtipos e indícios novos do cancro do rim para melhorar o diagnóstico, tratamento
Crédito: Jennifer E. Fairman

Sua investigação do mergulho profundo do ccRCC, descrita na introdução do 31 de outubro da pilha do jornal, amostras involvidas do tumor de 110 pacientes que não tinham recebido ainda o tratamento, tal como a quimioterapia e a radiação, e as 84 amostras de tecido saudável que cercam os tumores.

Os pesquisadores usaram as tecnologias genomic e proteomic as mais avançadas disponíveis para amolar para fora suas características proteogenomic, definidas como a composição genética (genómica), alterações químicas a ADN (epigenomics), RNA de mensageiro situado nas pilhas que serve como o molde para fazer proteínas (transcriptomics), e nas proteínas (proteomics) e sua alteração pelo grupo do fosfato (phosphoproteomics), uma alteração conhecida para regular funções da proteína comutando de ligar/desligar. O trabalho foi terminado como parte do consórcio clínico da análise do tumor do Proteomic do instituto nacional para o cancro (CPTAC), um esforço nacional para compreender melhor cancros com o proteogenomics.

Entre seus resultados, os investigador dizem, era que a perda do cromossoma 3p é uma indicação aparente do ccRCC, ocorrendo em quase todas as amostras do tumor no estudo.

Além, os pesquisadores identificaram quatro subtipos imune-baseados distintos do ccRCC baseados em suas diferenças da pilha imune que potencial poderiam ser usadas para ajudar a prever a sobrevivência total e a resposta dos pacientes ao tratamento.

Entre todos os cancros do rim, o ccRCC esclarece 75%, igualando a aproximadamente 65.000 novos casos anualmente. A remoção cirúrgica permanece o único tratamento eficaz para os cancros que não espalharam além do rim, mas os 30% dos pacientes actuais com doença avançada no diagnóstico.

Historicamente, o ccRCC foi considerado resistente à quimioterapia e à radiação convencionais, e a resposta a diversas drogas aprovados pelo FDA foi limitada. O atlas do genoma do cancro do instituto nacional para o cancro (TCGA) catalogou as alterações genéticas responsáveis para muitos cancros que incluem o ccRCC, mas questiona-as restante.”

Daniel W. Chan, Ph.D., professor da patologia e da oncologia, e director do centro para a descoberta e a tradução do Biomarker na Faculdade de Medicina da Universidade Johns Hopkins

“Nossos resultados ilustram a complexidade da revelação do cancro, e isso nós podemos usar o proteomics e phosphoproteomics além do que a genómica para aprender mais sobre fenótipos do cancro e sua heterogeneidade,” diz Hui Zhang, Ph.D., investigador co-principal do estudo, professor da patologia e da oncologia, e director da facilidade do núcleo da espectrometria em massa na Faculdade de Medicina da Universidade Johns Hopkins.

“O uso de um tipo de estudo molecular compreender o cancro é já não bastante. Uma multi-omic aproximação é necessário caracterizar inteiramente o cancro,” diz o autor do estudo do chumbo e o companheiro pos-doctoral David J. Clark, Ph.D.

Actualmente, Clark adiciona, tratamento da linha da frente para o ccRCC que não pode ser curado cirùrgica é focalizado na angiogênese de inibição, no processo por que os cancros desenvolvem vasos sanguíneos novos para manter a nutrição e o crescimento, e em visar uma quinase de proteína chamada o mTOR que ajuda a sobrevivência e a divisão da pilha do controle. Cobrir os dados proteomic e phosphoproteomic torna possível, diz, para que os pesquisadores detectem uma disposição mais larga de alvos potenciais para a revelação nova da droga.

Outros resultados chaves da análise encontraram aquele:

Havia quatro subtipos distintos do ccRCC baseados em suas assinaturas do microambiente do tumor:

  1. Os tumores inflamados CD8-positive tiveram uma quantidade alta de pilhas imunes de CD8-positive e respondida aos caminhos da sinalização da pilha associados com uma resposta imune.
  2. Os tumores inflamados CD8-negative tiveram uma ausência próxima de pilhas imunes de CD8-positive mas tiveram pilhas tais como os fibroblasto, que promovem a cura esbaforido, e os macrófagos, que lutam cancros e outras substâncias estrangeiras.
  3. Os tumores imunes endothelial vasculares (VEGF) do deserto do factor de crescimento não tiveram nenhuma pilha imune mas tiveram uma presença forte de pilhas endothelial associadas com a revelação do crescimento novo do vaso sanguíneo na progressão do tumor.
  4. As pilhas imunes metabólicas do deserto eram umas pilhas mais puras do tumor com quase nenhumas pilhas imunes e muito poucos fibroblasto.

Baseado nos dados do atlas do genoma do cancro, Clark diz, pareceu que aqueles com os tumores inflamados CD8-positive teriam uma sobrevivência total mais ruim quando aqueles com os tumores imunes do deserto de VEGF teriam a melhor sobrevivência total. Os modelos com carácter de previsão novos pelos pesquisadores encontraram que aqueles com tumores de CD8-positive teriam a melhor resposta às terapias imunes do ponto de verificação, visto que aqueles com os tumores imunes do deserto de VEGF mostrariam a melhor resposta às terapias da anti-angiogênese, os tratamentos visados que cortaram tumores fora de seu fluxo sanguíneo.

“Total, este estudo revela as introspecções biológicas originais que são ganhadas somente ao combinar proteomic complementar e análises genomic,” diz Zhang. “Nossa análise do omics do multi-nível identificou os mecanismos moleculars sendo a base que não são capturados inteiramente a nível genomic, e define a fosforilação da proteína e as assinaturas imunes necessárias estratificar pacientes do ccRCC com o objectivo de tornar-se melhor, intervenções terapêuticas mais visadas.”

Os planos seguintes da equipe para usar métodos similares a caracterizam mais inteiramente cancros pancreáticos e principais e de pescoço.

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