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Los investigadores determinan nuevos subtipos y pistas del cáncer del riñón para mejorar la diagnosis, tratamiento

En qué se cree para ser la caracterización molecular más completa hasta la fecha del más común - y a menudo tratamiento-resistente - forma de cáncer del riñón, de investigadores en los departamentos de Johns Hopkins de la patología y de la oncología, de centro del cáncer de Johns Hopkins Kimmel, y de las pruebas del parte de la Facultad de Medicina de la Universidad John Hopkins por lo menos tres subtipos distintos del carcinoma renal de la célula de la célula sin obstrucción (ccRCC), junto con nuevas revelaciones sobre las proteínas que las definen. Sus conclusión podían informar a supervivencia paciente y a la reacción totales al tratamiento.

Los investigadores determinan nuevos subtipos y pistas del cáncer del riñón para mejorar la diagnosis, tratamiento
Haber: Jennifer E. Fairman

Su investigación del buceo de profundidad del ccRCC, descrita en la aplicación del 31 de octubre la célula del gorrón, muestras implicadas del tumor a partir de 110 pacientes que todavía no habían recibido el tratamiento, tal como quimioterapia y radiación, y 84 muestras de tejido sano que rodeaban los tumores.

Los investigadores utilizaron las tecnologías genomic y proteomic más avanzadas disponibles para tomar el pelo fuera sus características proteogenomic, definidas como el maquillaje genético (genómica), modificaciones químicas a la DNA (epigenomics), el ARN de mensajero situado en células que sirve como patrón hacer las proteínas (transcriptomics), y proteínas (proteomics) y su modificación por el grupo del fosfato (phosphoproteomics), una modificación sabida para regular funciones de la proteína cambiando con./desc. El trabajo fue terminado como parte del consorcio clínico del análisis del tumor de Proteomic del Instituto Nacional del Cáncer (CPTAC), un esfuerzo nacional de entender mejor cánceres con proteogenomics.

Entre sus conclusión, los investigadores dicen, era que la baja del cromosoma 3p es un sello evidente del ccRCC, ocurriendo en casi todas las muestras del tumor en el estudio.

Además, los investigadores determinaron cuatro subtipos inmune-basados distintos del ccRCC basados en sus diferencias de la célula inmune que potencialmente se podrían utilizar para ayudar a predecir la supervivencia total y la reacción de los pacientes al tratamiento.

Entre todos los cánceres del riñón, el ccRCC explica el 75%, comparando a cerca de 65.000 nuevos casos anualmente. El retiro quirúrgico sigue siendo el único tratamiento efectivo para los cánceres que no se han extendido más allá del riñón, solamente el 30% de pacientes presentes con enfermedad avanzada en la diagnosis.

Históricamente, el ccRCC se ha considerado resistente a la quimioterapia y a la radiación convencionales, y la reacción a varias drogas aprobadas por la FDA se ha limitado. El atlas del genoma del cáncer del Instituto Nacional del Cáncer (TCGA) ha catalogado los cambios genéticos responsables de muchos cánceres incluyendo ccRCC, pero los pregunta permanecido.”

Daniel W. Chan, Ph.D., profesor de la patología y de la oncología, y director del centro para el descubrimiento y la traslación del Biomarker en la Facultad de Medicina de la Universidad John Hopkins

“Nuestros resultados ilustran la complejidad del revelado del cáncer, y eso podemos utilizar proteomics y phosphoproteomics además de la genómica para aprender más sobre fenotipos del cáncer y su heterogeneidad,” dice a Hui Zhang, Ph.D., investigador co-principal del estudio, profesor de la patología y de la oncología, y director de la instalación de la base de la espectrometría de masa en la Facultad de Medicina de la Universidad John Hopkins.

“El uso de un tipo de estudio molecular de entender el cáncer es no más bastante. Una aproximación multi-omic es necesaria caracterizar completo el cáncer,” dice el autor y al becario postdoctoral David J. Clark, Ph.D. del estudio del guía.

Actualmente, Clark agrega, tratamiento de la frente para el ccRCC que no se puede curar quirúrgico se centra en el angiogenesis de inhibición, el proceso por los cuales los cánceres desarrollan los nuevos vasos sanguíneos para mantener el alimento y el incremento, y el alcance de una cinasa de proteína llamada el mTOR que ayuda a supervivencia y a la división de la célula del mando. La sobreposición de los datos proteomic y phosphoproteomic permite, él dice, para que los investigadores descubran una gama más amplia de los objetivos potenciales para el nuevo revelado de la droga.

Otras conclusión dominantes del análisis encontraron eso:

Había cuatro subtipos distintos del ccRCC basados en sus firmas del microambiente del tumor:

  1. Los tumores inflamados CD8-positive tenían una alta cantidad de células inmunes de CD8-positive y respondida a los caminos de la transmisión de señales de la célula asociados a una inmunorespuesta.
  2. Los tumores inflamados CD8-negative tenían una ausencia cercana de células inmunes de CD8-positive pero tenían células tales como fibroblastos, que ascienden la herida que cura, y macrófagos, que luchan cánceres y otras substancias no nativas.
  3. Los tumores inmunes endoteliales vasculares (VEGF) del desierto del factor de incremento no tenían ninguna célula inmune sino tenían una presencia fuerte de células endoteliales asociadas al revelado del nuevo incremento del vaso sanguíneo en la progresión del tumor.
  4. Las células inmunes metabólicas del desierto eran células más puras del tumor con casi ningunas células inmunes y muy pocos fibroblastos.

De acuerdo con los datos del atlas del genoma del cáncer, Clark dice, aparecía que ésos con los tumores inflamados CD8-positive tendrían una supervivencia total peor mientras que ésos con los tumores inmunes del desierto de VEGF tendrían la mejor supervivencia total. Los nuevos modelos proféticos de los investigadores encontraron que ésos con los tumores de CD8-positive tendrían la mejor reacción a las terapias inmunes del punto de verificación, mientras que ésos con los tumores inmunes del desierto de VEGF mostrarían la mejor reacción a las terapias del anti-angiogenesis, los tratamientos apuntados que cortaron tumores lejos de su abastecimiento de sangre.

“Total, este estudio revela los discernimientos biológicos únicos se ganan que solamente al combinar proteomic complementario y los análisis genomic,” dice a Zhang. “Nuestro análisis de niveles múltiples del omics determinó los mecanismos moleculares que eran la base que no se capturan completo en el nivel genomic, y define la fosforilación de la proteína y las firmas inmunes necesarias estratificar a pacientes del ccRCC con el objetivo de convertirse mejor, intervenciones terapéuticas apuntadas.”

Los planes siguientes de las personas para utilizar métodos similares a caracterizan más completo pancreático y cánceres de cabeza y cuellos.

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