Protéomique et spectroscopie de masse de diamètre dans la recherche de la maladie de Neurodegenerative

insights from industryNicholas DupuisDirector of Scientific Business DevelopmentBiognosys

Biognosys a récent présenté des caractéristiques de ses flux de travail actualisés de protéomique basés par diamètre dans le CSF à la société pour la neurologie 2019 Chicago, IL. Les sciences de la vie Nouvelles-Médicales ont rattrapé avec Nicholas Dupuis après que le contact pour discuter ce qu'il y a de neuf en protéomique et spectrométrie de masse de diamètre.

Pourquoi la protéomique devrait-elle être la technologie choisie dans des études multiplexées de quantification de protéine ?

La protéomique multiplex basée sur spectrométrie de masse est juste un outil qui peut être appliqué pour la quantification impartiale de protéine dans les modifications complexes telles que le plasma, l'urine, le CSF, et le tissu, qui sont riches en analytes biologiques. Mais elle offre les seuls avantages qui sont devenus plus apparents car la technologie a prolongé à avancer.

En particulier, l'approche de spectrométrie de masse peut effectuer la meilleure utilisation des échantillons précieux, mesurant maintenant un grand pourcentage du protéome exprimé (par exemple, jusqu'à beaucoup de milliers de protéines), avec des conditions très modestes d'échantillon.

Supplémentaire, l'ordonnancement de peptide assure sa spécificité élevée pour éviter certains des défis réputés avec les agents de retenue basés sur affinité. Dans une expérience correctement conçue, le régime trompeur de découverte (FDR) est contrôlable à un 1% normal.

Pour finir, et peut-être avant tout, la méthode est hautement quantitative (parent ou absolu), où cv médian en travers des milliers de protéines est en général bien en-dessous de 10%, ainsi il signifie que des modifications subtiles au protéome global d'échantillon sont facilement trouvées et mesurées avec la confiance élevée.

Sergei Drozd/Shutterstock

Comment les expériences de diamètre fournissent-elles un avantage par rapport aux études de DDA ?

Le diamètre augmente les capacités de l'instrumentation moderne de spectrométrie de masse. Ceci a été récent expliqué quand nous avons prouvé que le diamètre a basé l'acquisition nous a permis de surpasser la limite théorique pour l'acquisition basée par DDA dans les acquisitions à un seul coup. Le résultat est que le diamètre s'assure qu'il y a très peu de valeurs manquantes dans un ensemble de données, maximisant le nombre de protéines pour l'analyse de biomarqueur et améliorant l'installation générale d'une expérience.

Ces avantages alimentent directement dans l'évolutivité de l'approche de diamètre, qui active éventuel une analyse des jeux beaucoup plus grands témoin sur l'ordre de 100s ou même de 1000s des échantillons.

À l'aide de la spectrométrie de masse de diamètre, comment allons-nous capables développer et améliorer la recherche d'Alzheimer ?

L'AD est une maladie neurodegenerative extrêmement complexe où beaucoup de facteurs, tels que la prédisposition génétique (génome) et l'exposition aux stimulus externes (exposome), peut jouer un rôle indispensable dans le début et le développement de la maladie. Ces facteurs résultent également en hautement population hétérogène des patients d'AD des différentes étapes de la maladie, qui rendent leur remise en question de stratification extrêmement basée sur unique ou une petite Commission des biomarqueurs.

Nous avons récent actualisé nos flux de travail de DIA-MS, qui activent le haut-débit et la quantification robuste des milliers de protéines en travers de 10s à 100s des échantillons provenant du µl seulement 100 du CSF. Nos travaux récents, publiés à la société pour la rencontre annuelle de neurologie, points culminants le pouvoir de ces flux de travail dans une validation de principe l'étude sur des patients d'AD.

Nous croyons que cet outil, qui augmente de manière significative le nombre de protéines visibles dans le CSF, activera une caractérisation phénotypique plus précise des patients en travers de beaucoup de maladies neurodegenerative et supportera le développement des médicaments de droite pour les patients droits.

Que rend Biognosys et ses produits seuls ?

Orientation de Biognosys la' au cours de ces dernières années a été sur la croissance continue de la spectrométrie de masse sans données d'acquisition (DIA-MS), et nous tâchons de rester sur le bord d'attaque de la quantification de protéine par des modalités multiples d'acquisition. Cependant, pendant que les méthodes et la technologie fondamentales ont mûri, nous avons augmenté notre orientation pour améliorer la robustesse et le débit de méthode, entendant améliorer l'écaille des analyses d'échantillon, tout en mettant à jour les numéros et la précision à haute valeur protéique.

Ceci est rendu possible par l'étroite collaboration entre notre R&D et services après vente de recherches de contrat, avec de principaux constructeurs de spectrométrie de masse et groupes scolaires dans les protéomiques. Comme résultat, quand les propriétaires examinent pour appliquer une approche de protéomique dans leur recherche, ils pourront atteindre la protéomique de pointe dans un laboratoire robuste et évolutif.


Au sujet de Nicholas Dupuis

M. Nicholas Dupuis a joint Biognosys en 2017 en tant que directeur de développement commercial scientifique.

Nicholas a sur 15 ans d'expérience sous les formes multiples de la spectrométrie de masse et des applications à l'étude des systèmes biologiques. Récemment, Nicholas s'est concentré sur mettre en application des technologies de spectrométrie de masse pour des études diagnostiques et de translation de biomarqueur.

Chez Biognosys il est particulièrement intéressé à s'appliquer des méthodes proteomic impartiales à l'analyse de biomarqueur en oncologie, neurologie, et immunologie.  

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Biognosys AG. (2019, November 21). Protéomique et spectroscopie de masse de diamètre dans la recherche de la maladie de Neurodegenerative. News-Medical. Retrieved on December 15, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20191119/Proteomics-DIA-Mass-Spectroscopy-in-Neurodegenerative-Disease-Research.aspx.

  • MLA

    Biognosys AG. "Protéomique et spectroscopie de masse de diamètre dans la recherche de la maladie de Neurodegenerative". News-Medical. 15 December 2019. <https://www.news-medical.net/news/20191119/Proteomics-DIA-Mass-Spectroscopy-in-Neurodegenerative-Disease-Research.aspx>.

  • Chicago

    Biognosys AG. "Protéomique et spectroscopie de masse de diamètre dans la recherche de la maladie de Neurodegenerative". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20191119/Proteomics-DIA-Mass-Spectroscopy-in-Neurodegenerative-Disease-Research.aspx. (accessed December 15, 2019).

  • Harvard

    Biognosys AG. 2019. Protéomique et spectroscopie de masse de diamètre dans la recherche de la maladie de Neurodegenerative. News-Medical, viewed 15 December 2019, https://www.news-medical.net/news/20191119/Proteomics-DIA-Mass-Spectroscopy-in-Neurodegenerative-Disease-Research.aspx.