Proteomics & espectroscopia em massa do diâmetro na pesquisa da doença de Neurodegenerative

insights from industryNicholas DupuisDirector of Scientific Business DevelopmentBiognosys

Biognosys apresentou recentemente dados de seus trabalhos baseados diâmetro actualizados do proteomics no CSF na sociedade para a neurociência 2019 em Chicago, IL. As ciências da vida Notícia-Médicas alcançaram com o Nicholas Dupuis depois que a reunião para discutir o que é novo no proteomics e na espectrometria em massa do diâmetro.

Por que deve o proteomics ser a tecnologia escolhida em estudos multiplexados da quantificação da proteína?

O proteomics multiplex espectrometria-baseado massa é apenas uma ferramenta que pode ser aplicada para a quantificação imparcial da proteína nas matrizes complexas tais como o plasma, a urina, o CSF, e o tecido, que são ricas em analytes biológicos. Mas oferece as vantagens originais que se tornaram mais aparentes enquanto a tecnologia continuou a avançar.

Em particular, a aproximação da espectrometria em massa pode fazer o melhor uso de amostras preciosas, determinando agora uma grande porcentagem do proteome expressado (por exemplo, até muitos milhares de proteínas), com exigências muito modestas da amostra.

Adicionalmente, arranjar em seqüência do peptide assegura sua especificidade alta para evitar alguns dos desafios conhecidos com os agentes de captura afinidade-baseados. Em uma experiência correctamente projetada, a taxa falsa da descoberta (FDR) é verificável em um 1% padrão.

Última, e talvez mais importante ainda, o método é altamente quantitativo (relativo ou absoluto), onde o CV mediano através dos milhares de proteínas está tipicamente bem abaixo de 10%, assim que significa que as mudanças subtis ao proteome global da amostra facilmente estão detectadas e determinadas com confiança alta.

Sergei Drozd/Shutterstock

Como as experiências do diâmetro fornecem uma vantagem sobre estudos de DDA?

O diâmetro expande as capacidades da instrumentação moderna da espectrometria em massa. Isto foi demonstrado recentemente quando nós mostramos que o diâmetro baseou a aquisição nos permitiu de ultrapassar o limite teórico para a aquisição baseada DDA em aquisições do único-tiro. O resultado é que o diâmetro se assegura de que haja muito poucos valores faltantes em uma série de dados, maximizando o número de proteínas para a análise do biomarker e melhorando o serviço público total de uma experiência.

Estas vantagens alimentam directamente na escalabilidade da aproximação do diâmetro, que permite finalmente uma análise de grupos muito maiores da amostra na ordem de 100s ou mesmo de 1000s das amostras.

Usando a espectrometria em massa do diâmetro, como podemos nós desenvolver e melhorar a pesquisa de Alzheimer?

O ANÚNCIO é uma doença neurodegenerative extremamente complexa onde muitos factores, tais como a predisposição genética (genoma) e a exposição aos estímulos externos (exposome), pode jogar um papel vital no início e na revelação da doença. Estes factores igualmente conduzem a uma população altamente heterogênea de pacientes do ANÚNCIO das fases diferentes da doença, que rendem seu desafio da estratificação extremamente baseado em único ou em um painel pequeno dos biomarkers.

Nós temos recentemente actualizado nossos trabalhos de DIA-MS, que permitem a alto-produção e a quantificação robusta dos milhares de proteínas através de 10s a 100s das amostras do µl somente 100 do CSF. Nosso trabalho recente, publicado na sociedade para a reunião anual da neurociência, destaca a potência destes trabalhos em uma prova do estudo do conceito em pacientes do ANÚNCIO.

Nós acreditamos que esta ferramenta, que aumenta significativamente o número de proteínas visíveis no CSF, permitirá uma caracterização fenotípica mais exacta dos pacientes através de muitas doenças neurodegenerative e apoiará a revelação das drogas do direito para os pacientes adequados.

Que faz Biognosys e seus produtos originais?

O foco de Biognosys' durante estes últimos anos estêve na revelação continuada da espectrometria em massa da aquisição sem dados (DIA-MS), e nós esforçamo-nos para ficar na vanguarda da quantificação da proteína com as modalidades múltiplas da aquisição. Contudo, como os métodos e a tecnologia subjacentes se amadureceram, nós expandimos nosso foco para melhorar o vigor e a produção do método, pretendendo aumentar a escala de análises da amostra, ao manter a elevação - a proteína numera e precisão.

Isto é tornado possível pela colaboração próxima entre nossos R&D e departamentos de serviços da pesquisa do contrato, junto com vendedores principais da espectrometria em massa e grupos académicos no proteomics. Em conseqüência, quando os clientes estão olhando para aplicar uma aproximação do proteomics em sua pesquisa, poderão alcançar o proteomics da vanguarda em um laboratório robusto e evolutivo.


Sobre Nicholas Dupuis

O Dr. Nicholas Dupuis juntou-se a Biognosys em 2017 como um director do desenvolvimento de negócios científico.

Nicholas tem sobre 15 anos de experiência em formulários múltiplos da espectrometria em massa e das aplicações ao estudo de sistemas biológicos. Recentemente, Nicholas centrou-se sobre a aplicação de tecnologias da espectrometria em massa para estudos diagnósticos e translational do biomarker.

Em Biognosys está particularmente interessado em aplicar métodos proteomic imparciais à análise do biomarker na oncologia, na neurociência, e na imunologia.  

Citations

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    Biognosys AG. (2019, November 21). Proteomics & espectroscopia em massa do diâmetro na pesquisa da doença de Neurodegenerative. News-Medical. Retrieved on December 15, 2019 from https://www.news-medical.net/news/20191119/Proteomics-DIA-Mass-Spectroscopy-in-Neurodegenerative-Disease-Research.aspx.

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