La découverte dans la biologie difficile de C. ouvre l'hublot neuf aux demandes de règlement se développantes pour des infections dangereuses

Une sporulation appelée de processus qui aide le Clostridium difficile dangereux de bactérie (C. difficile) à survivre des conditions inhospitalières et l'écart est réglé par epigenetics, facteurs qui affectent l'expression du gène au delà de code génétique d'ADN, chercheurs à l'École de Médecine d'Icahn à l'état de mont Sinaï. C'est la première découverte que l'epigenetics règlent la sporulation dans toutes les bactéries. Leur recherche, 25 novembre publiéth en microbiologie de nature, ouvre un hublot neuf aux demandes de règlement se développantes pour cette infection dévastatrice.

Le C. difficile infecte presque le demi million de personnes tous les ans, entraînant la diarrhée sévère et la détruisant juste au-dessous de 10 pour cent de ceux plus de 65 qui contrat il. Les spores des bactéries, qui sont écartées par des fèces, sont extrêmement résilientes et peuvent survivre en dehors du fuselage pour des semaines ou des mois, infectant les personnes qui contactent les surfaces contaminées.

Puisque l'infection est si courante et dévastatrice, le génome difficile de C. a été bien étudié, mais crochet de bande, PhD, professeur agrégé de génétique et sciences génomiques à l'institut d'Icahn du mont Sinaï pour la Science de caractéristiques et à l'auteur de technologie et supérieur génomique de l'étude, dit que lui et ses collègues ont adopté une approche différente dans leur recherche. « Nous avons voulu étudier au delà de code génétique des bactéries et examiner quelles modifications chimiques étaient apportées au génome, » a dit M. Fang. Tandis que ces modifications chimiques épigénétiques, méthylation appelée, ne modifient pas la séquence d'un gène, elles peuvent modifier une activité de gène particulière pour la rendre plus ou moins active, qui a des chocs profonds sur le fonctionnement de l'organisme.

L'équipe de M. Fang's a frayé un chemin l'utilisation du troisième génération ADN ordonnançant pour tracer des facteurs épigénétiques dans les bactéries en 2012 et a commencé à étudier l'epigenetics difficile de C. en 2015. D'abord, l'équipe a isolé le C. difficile des groupes fécaux de 36 patients dans l'unité de soins intensifs (ICU) à l'hôpital de mont Sinaï qui avait été infecté avec elle. Ils ont analysé les échantillons et ont trouvé une configuration épigénétique particulière qui a été hautement économisée dans tous tous les échantillons. Ensuite, ils ont vérifié environ 300 génomes difficile de C. de GenBank, une banque de données des séquences génétiques faites fonctionner par les instituts de la santé nationaux, et ont constaté que tous ont partagé le même gène responsable de la configuration épigénétique trouvée dans les patients d'ICU.

Le soupicon de cette configuration épigénétique jouait un rôle essentiel dans le fonctionnement des bactéries, équipe de M. Fang's a collaboré sur encore deux études de la sporulation difficile et des souris de C. infectées avec le C. difficile, avec le laboratoire d'Aimee Shen, PhD, professeur agrégé de biologie moléculaire et de microbiologie à la Faculté de Médecine d'université de touffes et un auteur de Co-sénior de l'étude, et avec le laboratoire de Rita Tamayo, PhD, professeur agrégé de la microbiologie et immunologie à l'université de la Caroline du Nord, Chapel Hill. Dans une étude avec des souris, les chercheurs ont constaté que quand ils ont empêché le gène responsable de la configuration épigénétique, pas moins 100 fois moins de bactéries étaient présentes après 6 jours de comparé aux bactéries inchangées.

M. Fang dit que les découvertes dans ces études soulignent la signification de l'epigenetics dans l'étude des bactéries et du développement de médicament pour l'infection.

En plus d'offrir des aperçus épigénétiques neufs de l'étude des objectifs difficile et possibles de C. pour le développement de médicament, M. Fang espère que cette recherche encouragera d'autres études des caractéristiques épigénétiques des bactéries.

C'est juste le début de notre compréhension de règlement épigénétique dans les bactéries ; il restent tant de questions à répondre encore. Nous espérons que cette découverte passionnante encouragera encore d'autres collaborations interdisciplinaires à vérifier l'epigenetics des bactéries et comment nous pouvons employer ces analyses neuves pour développer des demandes de règlement de sauvetage pour l'infection. »

M. Gang Fang, auteur supérieur de l'étude