Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

Los científicos de ICR realizan la primera evaluación completa de los recursos químicos de la antena

Un nuevo parte impulsa a investigadores biomédicos utilizar recursos en línea de la membrana muy cuidadosamente, teniendo en cuenta sus ventajas y debilidades complementarias, al seleccionar antenas químicas de la pequeño-molécula para ayudar a contestar a sus preguntas de la investigación.

En un “parte especial” publicado hoy en la química medicinal futura del gorrón hoy (jueves), los científicos en el instituto de la investigación de cáncer, Londres, realizaron la primera evaluación completa de todos los público - recursos disponibles en antenas químicas.

El parte recomienda fuertemente que los investigadores deben evitar la información de catálogo general de los motores y del vendedor de la búsqueda y en lugar de otro utilizar dos clases de recurso en línea - revistas expertas y aproximaciones grandes de cómputo de los datos - para tomar las mejores decisiones sobre las cuales las antenas químicas a utilizar en la investigación biomédica, y también para evitar la selección pobre de herramientas que pueden llevar a las conclusiones incorrectas.

las antenas químicas de la Pequeño-molécula son las herramientas importantes que son ampliamente utilizadas por los científicos modificar - generalmente inhibir - la actividad de proteínas individuales en células u organismos aislados y por lo tanto determinar su función. Las antenas químicas también se utilizan para probar el papel de una proteína determinada en enfermedades tales como cáncer, y para ayudar a validar esa proteína como objetivo para las drogas futuras.

las antenas de la Pequeño-molécula ofrecen un enfoque alternativo a las tecnologías genéticas tales como interferencia del ARN y CRISPR - de hecho la substancia química y las aproximaciones genéticas son muy complementarias y altamente efectivas cuando está utilizada en aparejo juntas.

Lamentablemente, muchas composiciones de la pequeño-molécula se han demandado que mientras que la substancia química sonda, y de uso frecuente muy extensamente, no son suficientemente específicas para la proteína del interés - y usarlas pueden generar resultados incorrectos. Algunas composiciones pegaron algunos objetivos extras de la proteína mientras que otras pegaron muchos otras.

Hay una necesidad acuciante de suministrar a científicos biomédicos la información apropiada de modo que puedan seleccionar las antenas químicas mejor para sus experimentos, ayudando a asegurarse de que sus conclusión de la investigación son robustas.

Un reto importante es que la información sobre antenas químicas potenciales está dispersada a través de muchas diversas publicaciones científicas y de otras fuentes, haciéndolo difícil para que a los científicos tomen una decisión completo informada - especialmente si el investigador no es un experto en biología, farmacología o descubrimiento química de la droga. Afortunadamente, la ayuda ha estado próxima en los últimos años con el revelado público - de recursos en línea disponibles en antenas químicas.

Las personas de los investigadores químicos de la antena en el instituto de la investigación de cáncer (ICR) discuten los diversos diversos recursos de la membrana que suministran la información para conducir la opción de herramientas químicas - encontrándolos ese todos tienen sus propias fuerzas y limitaciones. Asesoran convivial en cómo navegar estos recursos para seleccionar las antenas químicas mejor para las necesidades de un investigador.

El parte esfuerzo el valor de los recursos que ofrecen las revistas escritas por los expertos químicos de la antena. Destaca especialmente el portal químico de las antenas en donde los expertos químicos de la biología ofrecen actualmente evaluaciones en 192 antenas químicas para 181 diversas proteínas de interés y ofrece consejo sobre cómo mejor utilizarlas. El portal también tiene información conectado alrededor 200 otras composiciones de la pequeño-molécula que deban ser empleadas no más, aunque muchos de éstos se pudieron haber utilizado extensivamente en el pasado.

Pero hay también algunas limitaciones a los recursos que confían en la revisión paritaria experta. Por ejemplo, la mayor parte de las antenas fijadas en el acto porta de las antenas químicas en las familias determinadas de la proteína (cinasas, receptores G-proteína-acoplados, fosfodiesterasas, proteínas epigenéticas y miembros de la familia BCL2) y muchas otras familias de la proteína todavía no se revisten. Además, no es tan fácil mantener tales recursos actualizados, puesto que confían en de entrada manual de los revisores voluntarios. Los cambios están en curso dirigir estos puntos y hacer otros aumentos al portal.

El parte también acentúa la utilidad de los recursos que ofrecen la evaluación objetivo de antenas químicas usando análisis de cómputo en grande, cuantitativo. Destaca al minero de la antena, un recurso en Internet público que fue puesto en marcha por el equipo de investigación de ICR en 2017 con el financiamiento de Wellcome. El minero de la antena tiene varias ventajas dominantes. Es objetivo, dato-impulsado, cuantitativo y muy completo - basado en los datos de la bioactividad para más de 300.000 pequeñas moléculas que actúan en más de 2.300 proteínas humanas. Las bases de datos subyacentes se ponen al día con frecuencia, asegurándose de que los análisis están realizados usando la información más reciente.

Pero los investigadores también advirtieron que las fuentes de un ciertos datos y las antenas químicas se podrían faltar de estos sistemas de cómputo - y también que las graduaciones de antenas podrían ser difíciles de interpretar para los biólogos que faltaban experiencia detallada en biología química.

El parte concluye que el aumento continuado de recursos en línea perfeccionará la selección de antenas químicas de alta calidad y aumentará la robustez de la investigación biomédica. Recomienda que los recursos dato-impulsados experto-revisados y de cómputo complementarios se deben utilizar junto a uno a para asegurar las mejores decisiones sobre qué substancia química trabaja con herramienta para utilizar - y que esto podría ir un camino largo a abordar los problemas graves con el uso erróneo actual de antenas químicas en descubrimiento de la ciencia biomédica y de la droga.

Los autores también reconocen que hay un reto importante para hacer a biólogos enterados de los recursos disponibles y para animar su uso. Animan la difusión amplia de las recomendaciones en el parte y la absorción de los investigadores, de los proveedores de fondos de la investigación, de los gorrones y de los vendedores de perfeccionar la calidad y la robustez de la investigación biomédica.

Estudie al profesor Bissan Al-Lazikani, jefe de los codirigentes de la ciencia de los datos en el instituto de la investigación de cáncer, Londres, dijo:

Las antenas químicas son herramientas vitales en la investigación biomédica, desempeñando un papel dominante en la comprensión de cómo las proteínas trabajan y de qué impacto tienen en células cancerosas. Estas herramientas de la substancia química también mueven por motor con frecuencia el comienzo de campañas para descubrir los nuevos medicamentos para el cáncer. Es tan primordial que los científicos son cuidadosos y completos al elegir la substancia química sondan para sus experimentos. La falla de hacer tan puede dar lugar a resultados no fiables o engañosos.

En los últimos cinco años, hemos visto una subida de esfuerzos de tirar juntos de todos los datos disponibles sobre las características y la calidad de las antenas de la substancia química en bases de datos público accesibles, incluyendo nuestro propio recurso dato-impulsado, minero de la antena.

En nuestra revista de los diversos recursos químicos en línea de la antena disponibles encontramos que todas tienen sus propios méritos, y que las aproximaciones grandes de los datos consisten un paso importante adelante en la reunión de las pruebas más actualizadas. Necesitamos realmente combinar las diferentes fuentes de información de modo que los investigadores puedan conseguir la información mejor sobre antenas químicas.”

Estudie al Dr. Albert Antolin, becario postdoctoral de los codirigentes de sir Henry Wellcome en farmacología de los sistemas en el instituto de la investigación de cáncer, Londres, dijo:

Para ser útiles para la investigación, las antenas químicas real tienen que ser más selectivas para un objetivo que muchas drogas usadas para tratar a pacientes, donde están las consideraciones la eficacia y el seguro del tratamiento más importantes. Si los investigadores quieren descubrir el papel exacto de una proteína determinada en la carrocería, o en enfermedad, después la acción en varios objetivos puede ser engañosa o totalmente inaceptable.

Hay un volumen extenso de información sobre antenas químicas potenciales pero esta información se extiende alrededor en diversos formatos, así que los investigadores biomédicos necesitan ayuda encontrar las mejores herramientas químicas de alta calidad para su investigación.”

Estudie al profesor Paul Workman, ejecutivo de los codirigentes del instituto de la investigación de cáncer, Londres, dijo:

La selección y el uso pobres de antenas químicas pueden llevar a los resultados incorrectos y engañosos. Ha habido los casos donde el uso de composiciones de mala calidad ha llevado a científicos hacia abajo totalmente el carril incorrecto, perdiendo tiempo y el financiamiento preciosos, e incluso a veces retraso del descubrimiento de las drogas para el tratamiento de pacientes.

Es increíblemente importante que extendemos la palabra sobre la importancia prudente de elegir las antenas químicas mejor en la investigación biomédica, así que podemos poner fin al uso en curso de herramientas anticuadas, y nos aseguramos de que la ciencia biomédica lleva a los resultados robustos, seguros.

Usando los recursos químicos de la antena curated por los expertos junto a ésos movidos por motor por aproximaciones grandes de los datos es la mejor manera de seleccionar la antena correcta en base de las pruebas más recientes. Impulsamos investigadores, proveedores de fondos, los gorrones científicos y a los vendedores utilizar las recomendaciones en el parte.”