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I ricercatori dell'università di Kanazawa descrivono digitare genetico del putida delle pseduomonas

Il putida delle pseduomonas è un batterio che accade nel terreno, negli ambienti acquatici e negli impianti. Sebbene la virulenza delle pseduomonas P. -- la capacità del batterio di infettare il suo host e di infliggere una malattia -- è considerato come basso, infezione in pazienti severamente malati può essere letale. Gli sforzi di putida del P. (anche chiamati isolati) sono stati trovati in ospedali, per esempio in urina, scarico della ferita o di sangue dai pazienti e tali isolati clinici sono stati trovati per video la resistenza alle droghe. Ora, Kohei Ogura dall'università di Kanazawa ed i colleghi hanno eseguito il gene che ordina per vari isolati di putida del P. che provengono sia dai siti ambientali che clinici.

Digitare genetico degli sforzi differenti di putida del P. permette a di determinare quale sono più virulenti quei. Ciò è importante perché il putida del P. ha alto valore biotecnologico. Effettivamente, il putida del P. è una piattaforma microbiologica perfetta per “assistenza tecnica metabolica„, in cui ha selezionato i trattamenti biochimici all'interno delle celle di un organismo sono stimolati in modo che le celle producano più di una sostanza particolare. (Esempi di assistenza tecnica metabolica comprendono la produzione industriale della birra, del vino e del formaggio.)

I ricercatori hanno applicato una tecnica conosciuta come la sequenza di multilocus che digitano (MLST), un metodo impiegato nella biologia molecolare per digitare genetico di più di un luogo -- un luogo si riferisce alla posizione su un cromosoma in cui un gene specifico è individuato.

La tecnica di MLST è basata sull'ottenere le sequenze del DNA di parecchi cosiddetti “geni del governo della casa„: geni che sono necessari per il mantenimento del funzionamento di base di una cella. Per arrivare ad uno schema valido di MLST, in genere 100 isolati sono richiesti. Ogura ed i colleghi hanno usato 106 isolati, con 16 che hanno un'origine ambientale e 90 che vengono dai siti clinici. Per lo schema di MLST, gli scienziati hanno usato 8 geni del governo della casa.

Gli scienziati non solo hanno ottenuto il primo schema di MLST per il putida del P., essi egualmente potevano dedurre che gli isolati studiati del batterio sono clonali, significando che dividono l'ascendenza comune. Allo stesso tempo, i ricercatori hanno trovato che “il nostro schema di MLST riflette la diversità genetica del gruppo di putida del P. isolato sia dai siti clinici che ambientali„.

Source:
Journal reference:

Ogura, K. et al. (2019) A multilocus sequence typing scheme of Pseudomonas putida for clinical and environmental isolates. Scientific Reports. doi.org/10.1038/s41598-019-50299-6