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Os pesquisadores da universidade de Kanazawa descrevem a dactilografia genética do putida dos Pseudomonas

O putida dos Pseudomonas é uma bactéria que ocorre no solo, em ambientes aquáticos e em plantas. Embora a virulência dos Pseudomonas P. -- a capacidade da bactéria para contaminar seu anfitrião e para impr uma doença -- é considerado para ser baixo, infecção em pacientes severamente doentes pode ser letal. As tensões do putida do P. (igualmente chamadas isolados) foram encontradas nos hospitais, por exemplo na urina, sangue ou descarga esbaforido dos pacientes, e tais isolados clínicos foram encontradas para indicar a resistência às drogas. Agora, Kohei Ogura da universidade de Kanazawa e os colegas executaram o gene que arranja em seqüência para os vários isolados do putida do P. que originam dos locais ambientais e clínicos.

A dactilografia genética de tensões diferentes do putida do P. permite de determinar quais são mais virulentos. Isto é importante porque o putida do P. tem o valor biotecnológico alto. Certamente, o putida do P. é uma plataforma microbiológica perfeita para “a engenharia metabólica”, em que seleccionou processos bioquímicos dentro das pilhas de um organismo são estimulados de modo que as pilhas produzissem mais de uma substância particular. (Os exemplos da engenharia metabólica incluem a produção industrial de cerveja, de vinho e de queijo.)

Os pesquisadores aplicaram uma técnica conhecida como a seqüência do multilocus que datilografam (MLST), um método usado na biologia molecular para a dactilografia genética de mais de um locus -- um locus refere a posição sobre um cromossoma onde um gene específico seja encontrado.

A técnica de MLST é baseada em obter seqüências do ADN de diversos das “genes assim chamados tarefas domésticas”: genes que são necessários para a manutenção do funcionamento básico de uma pilha. A fim chegar em um esquema válido de MLST, tipicamente 100 isolados são exigidos. Ogura e os colegas usaram 106 isolados, com os 16 que têm uma origem ambiental e os 90 que vêm dos locais clínicos. Para o esquema de MLST, os cientistas usaram 8 genes das tarefas domésticas.

Os cientistas obtidos não somente o primeiro esquema de MLST para o putida do P., igualmente podiam deduzir que os isolados estudados da bactéria são clonal, significando que compartilham da ascendência comum. Ao mesmo tempo, os pesquisadores encontraram que “nosso esquema de MLST reflecte a diversidade genética do grupo do putida do P. isolado dos locais clínicos e ambientais”.

Source:
Journal reference:

Ogura, K. et al. (2019) A multilocus sequence typing scheme of Pseudomonas putida for clinical and environmental isolates. Scientific Reports. doi.org/10.1038/s41598-019-50299-6