L'analyse considérable de protéine de tumeur indique les lecteurs neufs potentiels dans le cancer

Examinant pour gagner une compréhension plus profonde de cancer, une équipe aboutie par des chercheurs à l'université de Baylor du médicament a réalisé une analyse de calcul considérable des similitudes et des différences dans le jeu complet de protéines, appelé le protéome, de plus de 500 cancers de cinq sites différents de tissu. Publié dans les transmissions de nature de tourillon, le travail a mené à la catégorie des cancers dans 10 sous-types, chacune comprenant les cancers qui ont partagé les protéines courantes qui ont semblé être impliquées dans la maladie.

L'analyse protéomique a confirmé les lecteurs moléculaires avant lesquels avait été impliqué dans le cancer, mais, d'une manière primordiale, a indiqué d'autres qui n'étaient pas apparus dans des analyses précédentes basées sur différentes composantes moléculaires. Les découvertes proposent des voies moléculaires nouvelles à considérer pour davantage d'étude concernant leur participation potentielle dans le cancer.

Le cancer est actuel compris pas comme maladie unique, mais comme collection des maladies. Le cancer peut se développer par l'altération dans différentes voies moléculaires, et dans cette étude nous avons appliqué des caractéristiques à partir des technologies de profilage moléculaires pour trier l'altération de protéine qui pourrait être liée au cancer. »

M. Tchad Creighton, auteur correspondant, professeur agrégé de médicament et codirecteur de la bio-informatique de cancer du Dan L centre de lutte contre le cancer complet de Duncan à l'université de Baylor du médicament

Creighton et ses collègues et d'autres groupes ont traditionnellement approché le profilage moléculaire en analysant l'ARNm plutôt que des caractéristiques de protéine. L'ARN messager (ARNm) est le matériel génétique qui est traduit réellement en protéines.

« Quand regardant des caractéristiques d'ARNm, il a supposé qu'elles représentent ce qui se produit au taux de protéine réel, mais ce n'est pas toujours le cas, » Creighton a dit. Des « protéines peuvent être modifiées après qu'elles soient synthétisées, par exemple, et c'est que quelque chose des caractéristiques d'ARNm ne montrerait pas. Cependant, la plupart des études n'acquièrent pas des caractéristiques de protéine. Dans l'étude actuelle nous avons analysé des caractéristiques de protéine, examinant pour recenser les voies moléculaires que les analyses de caractéristiques précédentes d'ARNm pourraient avoir manquées. »

Creighton et collègues ont travaillé avec des caractéristiques du consortium clinique d'analyse de tumeur de Proteomic (CPTAC), qui a conduit le profilage proteomic de plus de 10.000 protéines dans les centaines de cancers. Ils ont également examiné la protéine de cancer et les ensembles de données d'ARNm en dehors de CPTAC. Au total, les chercheurs ont analysé des caractéristiques de plus de 500 cancers représentant cinq types de cancer : sein, côlon, ovarien, rénal et utérin.

Le profilage de protéine indique les lecteurs neufs potentiels dans le cancer

Analyse des caractéristiques de protéine menées à la catégorie des cancers dans 10 sous-types, chacune avec un ensemble distinct d'altération de protéine. Les sous-types ont compris les sites multiples de tissu d'organe partageant des voies moléculaires modifiées par terrain communal. Connaissant les voies propose des opportunités thérapeutiques potentielles.

« Nous avons constaté que plusieurs des sous-types que nous avions trouvés basés sur les observations d'ARNm que nous avons effectuées avant supporté quand nous avons regardé le taux de protéine, » Creighton a dit. « Intéressant, quatre de ces 10 sous-types réellement ne font pas participer les cellules cancéreuses elles-mêmes. Ils représentent les différences en micro-environnement de tumeur, cellules et tissus qui entourent la tumeur, et ces sous-types sont très distincts entre eux. »

Deux des quatre composantes immunisées impliquées de sous-types liées au micro-environnement de tumeur. Le premier sous-type immunisé a été caractérisé par la présence des cellules de T immunisées. Le deuxième sous-type immunisé, d'autre part, a mis en valeur la voie d'activation de complément, qui est un élément important de tumeur-introduire l'inflammation pensé pour jouer un rôle dans l'amorçage et l'étape progressive de cancer. Les études précédentes semblent avoir manqué la voie de complément comme étant associé aux sous-types de cancer.

Une autre conclusion de roman était la découverte de trois sous-types qui n'avaient pas été recensés dans des analyses basées sur ARNm précédentes.

« Certaines des voies que nous avons trouvées qu'associé à ces trois sous-types ne peut pas être couramment associé aux cancers humains, mais des tiges à eux ont été trouvées, » Creighton a dit. « Un sous-type impliqué l'appareillage de Golgi de la cellule. Les états ont lié le Golgi à la transformation maligne, par exemple. Un autre sous-type, qui était spécifique au carcinome rénal, a été associé aux augmentations d'hémoglobine. En conclusion, le troisième sous-type impliqué le réticulum endoplasmique, une composante intracellulaire. »

Les chercheurs espèrent que les études comme ceci jetteront une certaine lumière sur certaines de ces voies qui ne sont pas bonnes étudiées par rapport au cancer et stimuleront davantage de recherche qui peut mener aux traitements améliorés ou aux demandes de règlement nouvelles qui pourraient bénéficier les patients qui ne répondent pas au traitement.