El análisis extenso de la proteína del tumor revela a nuevos jugadores potenciales en cáncer

Observando para ganar una comprensión más profunda del cáncer, las personas llevadas por los investigadores en la universidad de Baylor del remedio conducto un análisis de cómputo extenso de las semejanzas y de las diferencias en el equipo entero de proteínas, llamado el proteome, de más de 500 cánceres a partir de cinco diversos sitios del tejido. Publicado en las comunicaciones de la naturaleza del gorrón, el trabajo llevó a la clasificación de los cánceres en 10 subtipos, cada uno incluyendo los cánceres que compartieron las proteínas comunes que parecían estar implicadas en la enfermedad.

El análisis proteomic confirmó a los jugadores moleculares antes de quienes había estado implicado en cáncer, pero, importantemente, revelado otros que no habían aparecido en análisis anteriores basó en diversos componentes moleculares. Las conclusión sugieren los caminos moleculares nuevos que se considerarán para el estudio adicional con respecto a su implicación potencial en cáncer.

Entienden al cáncer actualmente no como única enfermedad, sino como una colección de enfermedades. El cáncer puede convertirse con cambios en diversos caminos moleculares, y en este estudio aplicamos datos de tecnologías de perfilado moleculares para arreglar los cambios de la proteína que se podrían conectar al cáncer.”

El Dr. República eo Tchad Creighton, autor correspondiente, profesor adjunto del remedio y codirector de la bioinformática del cáncer del Dan L cáncer completo de Duncan centra en la universidad de Baylor del remedio

Creighton y sus colegas y otros grupos se han acercado tradicionalmente a perfilado molecular analizando el mRNA bastante que datos de la proteína. El ARN de mensajero (mRNA) es el material genético que se traduce real a las proteínas.

“Cuando observa los datos del mRNA, él ha asumido que representan qué suceso en el nivel real de la proteína, pero éste no es siempre el caso,” Creighton dijo. Las “proteínas pueden ser modificadas después de que se sinteticen, por ejemplo, y éste es que algo los datos del mRNA no mostraría. Sin embargo, la mayoría de los estudios no detectan datos de la proteína. En el estudio actual analizábamos los datos de la proteína, observando para determinar los caminos moleculares que los análisis de datos anteriores del mRNA pudieron haber faltado.”

Creighton y los colegas trabajaron con datos del consorcio clínico del análisis del tumor de Proteomic (CPTAC), que conducto el perfilado proteomic de más de 10.000 proteínas en centenares de cánceres. También examinaron la proteína del cáncer y grupos de datos del mRNA fuera de CPTAC. En total, los investigadores analizaban datos de más de 500 cánceres que representaban cinco tipos de cáncer: pecho, colon, ovárico, renal y uterino.

El perfilado de la proteína revela a nuevos jugadores potenciales en cáncer

Análisis de los datos de la proteína llevados a la clasificación de los cánceres en 10 subtipos, cada uno con un equipo distinto de cambios de la proteína. Los subtipos incluyeron los sitios múltiples del tejido del órgano que compartían caminos moleculares alterados campo común. Conociendo los caminos sugiere oportunidades terapéuticas potenciales.

“Encontramos que muchos de los subtipos que habíamos encontrado basados en las observaciones del mRNA que hicimos antes de soportado cuando observábamos el nivel de la proteína,” Creighton dijo. “Interesante, cuatro de estos 10 subtipos no implican real a las células cancerosas ellos mismos. Representan las diferencias en el microambiente del tumor, las células y los tejidos que rodean el tumor, y estos subtipos son muy distintos de uno a.”

Dos de los cuatro subtipos implicaron los componentes inmunes asociados al microambiente del tumor. El primer subtipo inmune fue caracterizado por la presencia de células de T inmunes. El segundo subtipo inmune, por otra parte, destacó el camino de la activación del complemento, que es un componente importante de la inflamación tumor-que asciende pensado para desempeñar un papel en el lanzamiento y la progresión del cáncer. Los estudios anteriores aparecen haber faltado el camino de complemento como siendo asociado a subtipos del cáncer.

Otro encontrar de la novela era el descubrimiento de tres subtipos que no habían sido determinados en análisis mRNA-basados anteriores.

“Algunos de los caminos que encontramos que asociado con estos tres subtipos no puede ser asociado común a los cánceres humanos, pero los eslabones a ellos se han encontrado,” Creighton dijo. “Un subtipo implicó el aparato de Golgi de la célula. Los partes han conectado el Golgi a la transformación mala, por ejemplo. Otro subtipo, que era específico al carcinoma renal, fue asociado a aumentos de la hemoglobina. Finalmente, el tercer subtipo implicó el retículo endoplásmico, un componente intracelular.”

Los investigadores esperan que los estudios como esto viertan una cierta luz en algunos de estos caminos que no estén bien estudiados en relación a cáncer y estimulen la investigación adicional que puede llevar a las terapias perfeccionadas o a los tratamientos nuevos que podrían beneficiar a los pacientes que no responden a la terapia.