Superordenadores del uso de los científicos para verter la luz en mecanismo de la formación del cáncer de piel

El cáncer de piel, determinado el melanoma, que es el tipo más mortal y más serio de cáncer de piel humano, comienza como una pequeña lesión o imperfección. Generalmente, estos imperfecciones comienzan como acumulación inofensiva de melanocytes, que dan a piel su color. Mientras que progresa la enfermedad, puede extenderse en la carrocería.

Las personas de científicos en la Universidad de Texas en Austin ahora están utilizando los superordenadores y los algoritmos para revelar el mecanismo que estimula las mutaciones de la célula encontradas por la mitad alrededor de todos los casos del melanoma.

El cáncer de piel es el cáncer más común de los Estados Unidos y a través del globo. Se prevee que cerca de uno en cinco personas en el país desarrolle el cáncer de piel cuando alcanzan la edad de 70 y más de dos personas mueren de cáncer de piel en los E.E.U.U. cada hora.

Aunque el melanoma es el menos tipo común de cáncer de piel, es el más mortal. En 2019, se proyecta que habrá cerca de 96.480 nuevos casos del cáncer de piel en los Estados Unidos, y cerca de 7.230 personas morirán de la enfermedad.

Cáncer de piel y mutación B-Royal Air Force

Los investigadores encontraron una asociación del cáncer de piel con ciertas mutaciones (Fibrosarcoma rápidamente acelerado) de la cinasa B-Royal Air Force, que es una proteína que es parte de la cadena de la señal que comienza fuera de la célula y va dentro a accionar el incremento de la célula. El Ras/camino de la cinasa de la Royal Air Force/del Mek/de Erk es vital para la investigación del cáncer, buscando respuestas para entender más lejos cómo las células crecen fuera de mando. El estudio reveló que una mitad estimada de los casos del melanoma tiene una única mutación determinada en B-Royal Air Force, aparada como el residuo de la valina 600 al glutamato (V600E).

La mutación se ha convertido en desde entonces un objetivo crucial de diversas drogas y con los años, ciertos inhibidores de la mutación fueron desarrollados. Estas drogas usadas para inhibir la mutación a lo largo del camino, una acción extraña ocurrieron. La inhibición de la mutación tiene una desventaja, puesto que estimuló haber unmutated, el tipo salvaje cinasas de proteína de B-Royal Air Force, que accionó otra vez el revelado del cáncer de piel mortal.

“En este contexto, trabajamos en estudiar la estructura de esta proteína importante, B-Royal Air Force. Apuntamos estudiar más nativo-como el estado de la proteína para entender cómo ha regulado en las células, porque la mayor parte de los estudios se han centrado en el dominio aislado de la cinasa y cómo las drogas atan al dominio de la cinasa,” Yasushi Kondo, investigador postdoctoral en el laboratorio de Juan Kuriyan en Uc Berkeley y un co-autor del estudio, dijo.

Yin y símbolo de la circular de yang

Los investigadores compararon el dimero B-Royal Air Force al yin y al símbolo de la circular de yang. Utilizaron los modelos de ordenador y las simulaciones para confirmar encontrar válido. Conducto las simulaciones dinámicas moleculares del dimero B-Royal Air Force para probar su estabilidad de la conformación asimétrica.  Las personas no están seguras porqué la conformación era asimétrica o imbalanced, o cuál es objetivos a hacer en el mantenimiento del estado activo de la enzima.

Los científicos están utilizando los superordenadores potentes para destapar el mecanismo que activa las mutaciones de la célula encontradas en el cerca de 50 por ciento de melanomas. Las simulaciones de la dinámica molecular en el superordenador del Stampede2 de TACC probaron la estabilidad de la estructura de B-Royal Air Force:14-3-3 complejo, que cuando es transformado se conecta al cáncer de piel. Los autores del estudio comparan el dimero B-Royal Air Force al símbolo circular chino de yin-Yang de los contrarios interconectados ensamblados en la cola. Haber de imagen: Karandur y otros, TACC
Los científicos están utilizando los superordenadores potentes para destapar el mecanismo que activa las mutaciones de la célula encontradas en el cerca de 50 por ciento de melanomas. Las simulaciones de la dinámica molecular en el superordenador del Stampede2 de TACC probaron la estabilidad de la estructura de B-Royal Air Force: 14-3-3 complejo, que cuando es transformado se conecta al cáncer de piel. Los autores del estudio comparan el dimero B-Royal Air Force al símbolo circular chino de yin-Yang de los contrarios interconectados ensamblados en la cola. Haber de imagen: Karandur y otros, TACC

Encontraron que en el sistema que no tiene ningún segmento distal de la cola, el complejo era totalmente inestable. Otro encontrar principal de las demostraciones del estudio está descubriendo el mecanismo de la acción que gira el complejo de la cinasa B-Royal Air Force de dos cinasas B-Royal Air Force y de dos 14-3-3 proteínas del andamio, en donde la cinasa B-Royal Air Force es el estimulador o el activador, mientras que el otro es el receptor.

Los investigadores admitieron que su estudio tiene limitaciones. Para uno, los pequeños sistemas ofrecen resultados de observación rápidos mientras que en sistemas grandes, ciertos cambios ocurren en nanosegundo, microsegundo, y calendarios del milisegundo. El superordenador Stampede2 realizó todas las simulaciones y ofreció resultados rápidos y eficientes.

El nuevo estudio pavimentará la manera para el revelado futuro de nuevos tratamientos y terapias para el melamoma. El estudio fue publicado en la asociación americana para el adelanto del gorrón de la ciencia, ciencia.

Journal reference:

Cryo-EM structure of a dimeric B-Raf:14-3-3 complex reveals asymmetry in the active sites of B-Raf kinases, Yasushi Kondo, Jana Ognjenović, Saikat Banerjee, Deepti Karandur, Alan Merk, Kayla Kulhanek, Kathryn Wong, Jeroen P. Roose, Sriram Subramaniam, John Kuriyan, Science 04 Oct 2019: Vol. 366, Issue 6461, pp. 109-115 DOI: 10.1126/science.aay0543, https://science.sciencemag.org/content/366/6461/109

Angela Betsaida B. Laguipo

Written by

Angela Betsaida B. Laguipo

Angela is a nurse by profession and a writer by heart. She graduated with honors (Cum Laude) for her Bachelor of Nursing degree at the University of Baguio, Philippines. She is currently completing her Master's Degree where she specialized in Maternal and Child Nursing and worked as a clinical instructor and educator in the School of Nursing at the University of Baguio.

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