Os pesquisadores descobrem motoristas genéticos novos do cancro

A descoberta de motoristas genéticos do cancro pode ter implicações críticas para o diagnóstico e o tratamento das pacientes que sofre de cancro, contudo a análise do genoma focalizou primeiramente em somente 1-2% do genoma inteiro - a peça que contem o código para fazer proteínas. Que sobre o resto? Igualmente joga um papel em conduzir a doença?

Como parte do projecto do Bandeja-Cancro, os cientistas analisaram o inteiro-genoma que arranja em seqüência dados. Para fazer este, os cientistas tiveram que desenvolver os métodos estatísticos novos apropriados para analisar o genoma da não-codificação.

Joachim Weischenfeldt - agora um líder do grupo na pesquisa de Biotech & centro de inovação na universidade de Copenhaga, e de Rigshospitalet, Copenhaga - era um postdoc na unidade da biologia do genoma em EMBL Heidelberg na altura da pesquisa. Explica a base racional para a investigação:

As décadas do trabalho foram centradas sobre a identificação das conseqüências das mudanças na peça da proteína-codificação do genoma. Muitos cancros não têm nenhuma mutação importante na peça da proteína-codificação, mas algo está conduzindo o cancro. Pela inferência, nós suspeitamos que a peça da não-codificação está jogando um papel importante nestes casos inexplicados.”

A análise centrou-se sobre a identificação das mutações de ponto do motorista - mutações que afectam somente uma ou muito pouca letra do código do ADN - e variações estruturais, ou rearranjos, nas regiões da não-codificação do genoma. Além do que a identificação de motoristas novos, a análise confirmou alguns motoristas previamente relatados e, importante, invalidou outro. Igualmente identificou rearranjos putativos novos do motorista perto dos genes chamados os genes de AKR1C. Isto correlacionou com a expressão genética aumentada através do pulmão e dos cancros do fígado.

As mutações e as variações estruturais que conduzem o cancro foram encontradas para ser menos freqüentes em genes e em seqüências da não-codificação do que na peça da proteína-codificação do genoma, mas esta poderia em parte ser devido ao número relativamente pequeno de conjunto de dados pacientes disponíveis analisar para alguns tipos do tumor. “Nós precisamos provavelmente um ordem de grandeza mais genomas realmente ter uma compreensão detalhada de todas as mutações que conduzem o cancro, e os mecanismos complexos por que formam,” diz Weischenfeldt. “Porque o cancro é uma doença do genoma, nós queremos finalmente poder explicar tantos como cancros como genéticas de utilização possíveis.”

Em grande parte graças ao trabalho realizado durante o projecto do Bandeja-Cancro, aproximadamente 95% dos cancros estudados podia ser explicado genetically por uma mutação do motorista. Uma das saídas chaves do projecto é um catálogo que os clínicos e os pesquisadores possam usar para olhar acima tipos específicos do tumor e para identificar os motoristas da doença.

O projecto do Bandeja-Cancro

A análise do Bandeja-Cancro do projecto inteiro dos genomas é uma colaboração que envolve mais de 1300 cientistas e clínicos de 37 países. Envolveu a análise de mais de 2600 genomas de 38 tipos diferentes do tumor, criando um recurso enorme de genomas preliminares do cancro. Este era o ponto de partida para que 16 grupos de trabalho estudem aspectos múltiplos da revelação, da causa, da progressão, e da classificação do cancro.

Source:
Journal reference:

Li, Y., et al. (2020) Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes. Nature. doi.org/10.1038/s41586-019-1913-9.