Los investigadores descubren nuevos impulsores genéticos del cáncer

El descubrimiento de impulsores genéticos del cáncer puede tener implicaciones críticas para la diagnosis y el tratamiento de enfermos de cáncer, con todo el análisis del genoma se ha centrado sobre todo en solamente 1-2% del genoma entero - la pieza que contiene la clave para hacer las proteínas. ¿Qué sobre el descanso? ¿También desempeña un papel en impulsar la enfermedad?

Como parte del proyecto del Cubeta-Cáncer, los científicos han analizado el entero-genoma que ordenaba datos. Para hacer esto, los científicos tuvieron que desarrollar los nuevos métodos estadísticos convenientes para analizar el genoma de la no-codificación.

Joaquín Weischenfeldt - ahora líder del grupo en la investigación de Biotech y centro de innovación en la universidad de Copenhague, y de Rigshospitalet, Copenhague - era un postdoc en la unidad de la biología del genoma en EMBL Heidelberg a la hora de la investigación. Él explica el análisis razonado para la investigación:

Las décadas de trabajo se han centrado en determinar las consecuencias de cambios en la pieza de la proteína-codificación del genoma. Muchos cánceres no tienen ninguna mutación importante en la pieza de la proteína-codificación, pero algo está impulsando el cáncer. Por inferencia, sospechamos que la pieza de la no-codificación está desempeñando un papel importante en estos casos inexplicados.”

El análisis se centró en determinar las mutaciones de punto del impulsor - mutaciones que afectan a las solamente una o muy poca cartas de la clave de la DNA - y las variantes estructurales, o los cambios, en las regiones de la no-codificación del genoma. Además de determinar nuevos impulsores, el análisis confirmó algunos impulsores previamente denunciados y, invalidó importantemente otros. También determinó los cambios supuestos nuevos del impulsor cerca de los genes llamados los genes de AKR1C. Esto correlacionó con la expresión génica creciente a través de cánceres del pulmón y de hígado.

Las mutaciones y las variantes estructurales que impulsaban el cáncer fueron encontradas para ser menos frecuentes en genes y series de la no-codificación que en la pieza de la proteína-codificación del genoma, pero esto podría en parte ser debido al número relativamente pequeño de grupos de datos pacientes disponibles analizar para algunos tipos del tumor. “Necesitamos probablemente un orden de magnitud más genomas realmente de tener una comprensión completa de todas las mutaciones que impulsan el cáncer, y los mecanismos complejos por los cuales forman,” dice Weischenfeldt. “Pues el cáncer es una enfermedad del genoma, queremos final poder explicar tantos cánceres como sea posible usando genética.”

Gracias en gran parte al trabajo realizado durante el proyecto del Cubeta-Cáncer, el cerca de 95% de los cánceres estudiados se podían explicar genético por una mutación del impulsor. Uno de los rendimientos dominantes del proyecto es un catálogo que los clínicos y los investigadores pueden utilizar para observar hacia arriba tipos específicos del tumor y para determinar los impulsores de la enfermedad.

El proyecto del Cubeta-Cáncer

El análisis del Cubeta-Cáncer del proyecto entero de los genomas es una colaboración que implica más de 1300 científicos y clínicos a partir de 37 países. Implicó análisis de más de 2600 genomas de 38 diversos tipos del tumor, creando un recurso enorme de los genomas primarios del cáncer. Éste era el punto de partida para que 16 grupos de trabajo estudien aspectos múltiples del revelado, de la causalidad, de la progresión, y de la clasificación del cáncer.

Source:
Journal reference:

Li, Y., et al. (2020) Patterns of somatic structural variation in human cancer genomes. Nature. doi.org/10.1038/s41586-019-1913-9.