Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Les chercheurs découvrent le chromothripsis mutationnel neuf de phénomène dans le cancer

Les chercheurs à la Faculté de Médecine de Harvard et à l'EMBL-EBI ont effectué la plus grande analyse en travers des types de cancer du chromothripsis mutationnel neuf découvert de phénomène. Cette étude est la plus grande de son genre jusqu'à présent, contenant l'entier-génome ordonnançant (WGS) des caractéristiques de plus de 2600 tumeurs enjambant 38 types de cancer différents.

Chromothripsis

Chromothripsis, ou « chromosome se brisant », est un procédé mutationnel dans lequel les grandes extensions d'un chromosome subissent les réarrangements massifs dans un événement catastrophique unique. L'éclat de régions chromosomiques dans de plus petites pièces, permutent, et rejoignent, menant à une configuration neuve de génome.

En comprenant entièrement comment cette altération pilote l'évolution de génome de cancer, et quels mécanismes moléculaires sont impliqués dans leur rétablissement, soyez des étapes importantes vers l'évolution de compréhension de génome de cancer.

Cette recherche était publiée en génétique de nature en tant qu'élément du Carter-Cancer que l'analyse des génomes entiers (PCAWG) projettent, un effort global comportant la collaboration internationale de plus de 1300 scientifiques. Dans cette étude, les chercheurs ont prouvé que les événements de chromothripsis sont beaucoup plus courants en travers de beaucoup de types de cancer qu'ont précédemment pensé. Ils pourraient également directement lier le chromothripsis aux cachets courants du génome de cancer, y compris l'amplification d'oncogene (une augmentation dans le nombre de copies d'un gène qui peut entraîner le cancer), et la perte de suppresseurs de tumeur (les gènes qui règlent la croissance des cellules et la division).

Prévalence de Chromothripsis dans le cancer

Nous avons intégré des caractéristiques de GT de plus de 2600 tumeurs enjambant plus de 30 types de cancer. De ceci nous avons découvert que les événements de chromothripsis et d'autres types de réarrangements complexes de génome sont dominants en travers des cancers humains, avec des fréquences plus grandes que 50% de tumeurs dans quelques types de cancer. »

Isidro Cortés-Ciriano, chef de groupe à EMBL-EBI et un ancien chercheur post-doctoral à la Faculté de Médecine de Harvard

Utilisant des ensembles de données de GT a donné aux chercheurs un avis amélioré des événements de chromothripsis dans le génome de cancer. Études précédentes regardant le rôle du chromothripsis dans des technologies choix choix à basse résolution employées souvent de cancer et de maladies congénitales. Ici les chercheurs pouvaient prouver que les événements de chromothripsis sont beaucoup plus répandus dans le cancer que précédemment prévu. Ils ont également caractérisé les configurations de l'altération massive de génome en travers des types de cancer, et ont étudié les mécanismes de réparation de l'ADN impliqués dans leur rétablissement.

« Cette étude est encore une autre démonstration du pouvoir du l'entier-génome de grande puissance ordonnançant, » dit le stationnement de Peter, professeur de l'informatique biomédicale à la Faculté de Médecine de Harvard et à l'auteur supérieur du papier. « Il nous a permis de sonder la complexité ahurissante du génome-éclatement en génomes de cancer et de caractériser des traits communs en travers des centaines de cas. »

Chromothripsis et pronostic de cancer

« Les découvertes effectuées dans ce projet nous permettent de comprendre mieux comment le cancer surgit et évolue, ainsi que les configurations de l'altération dans l'ADN des tumeurs humaines, » indique Cortés-Ciriano. « Une partie de cette altération a des implications cliniques intenses et pourrait ouvrir les avenues neuves pour le développement thérapeutique au cours des années à venir. »

Les chercheurs expliquent que le chromothripsis forme le génome de tumeur, menant à la perte de gènes suppresseur de tumeur et à l'amplification des oncogenes pour piloter l'étape progressive de cancer. Chromothripsis a été associé au pronostic faible pour des malades du cancer, mais continuant nous étudie comme cette aide pour comprendre le choc du chromothripsis et de toute autre altération de grande puissance de génome, et comment ils peuvent être employés pour le diagnostic de cancer à l'avenir.

Le projet de Carter-Cancer

L'analyse de Carter-Cancer du projet entier de génomes est une collaboration faisant participer plus de 1300 scientifiques et cliniciens de 37 pays. Il analyse impliquée de plus de 2600 génomes de 38 types différents de tumeur, produisant une ressource énorme en génomes primaires de cancer. C'était le point de départ pour que 16 groupes de travail étudient des aspects multiples de développement du cancer, de causalité, d'étape progressive, et de catégorie.

Source:
Journal reference:

Cortés-Ciriano, I., et al. (2020) Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing. Nature Genetics. doi.org/10.1038/s41588-019-0576-7.