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Os pesquisadores descobrem o chromothripsis mutational novo do fenômeno no cancro

Os pesquisadores na Faculdade de Medicina de Harvard e no EMBL-EBI realizaram a análise a maior através dos tipos do cancro do chromothripsis mutational recentemente descoberto do fenômeno. Este estudo é o maior de seu tipo até agora, contendo o inteiro-genoma que arranja em seqüência (WGS) dados sobre de 2600 tumores que medem 38 tipos diferentes de cancro.

Chromothripsis

Chromothripsis, ou o “cromossoma que quebra-se”, são um processo mutational em que os grandes estiramentos de um cromossoma se submetem a rearranjos maciços em um único evento catastrófico. O fragmento cromossomático das regiões em partes menores, rearranja, e torna a reunir, conduzindo a uma configuração nova do genoma.

Inteiramente compreendendo como estas alterações conduzem a evolução do genoma do cancro, e que mecanismos moleculars são envolvidos em sua geração, seja etapas importantes para a evolução compreensiva do genoma do cancro.

Esta pesquisa foi publicada na genética da natureza como parte do Bandeja-Cancro que a análise dos genomas inteiros (PCAWG) se projecta, um esforço global que envolve a colaboração internacional sobre de 1300 cientistas. Neste estudo, os pesquisadores mostraram que os eventos do chromothripsis são muito mais comuns através de muitos tipos de cancro do que pensaram previamente. Poderiam igualmente directamente ligar o chromothripsis às indicações comuns do genoma do cancro, incluindo a amplificação do oncogene (um aumento no número de cópias de um gene que pudesse causar o cancro), e a perda de supressores do tumor (os genes que regulam o crescimento e a divisão da pilha).

Predominância de Chromothripsis no cancro

Nós integramos dados do WGS sobre de 2600 tumores que medem mais de 30 tipos do cancro. Disto nós descobrimos que os eventos do chromothripsis e outros tipos de rearranjos complexos do genoma são patentes através dos cancros humanos, com as freqüências maiores de 50% dos tumores em algum cancro dactilografa.”

Isidro Cortés-Ciriano, líder do grupo em EMBL-EBI e um pesquisador pos-doctoral anterior na Faculdade de Medicina de Harvard

Usar conjunto de dados do WGS deu aos pesquisadores uma ideia aumentada de eventos do chromothripsis no genoma do cancro. Os estudos precedentes que olham o papel do chromothripsis em baixo-definição usada frequentemente do cancro e das doenças congenitais disposição-basearam tecnologias. Aqui os pesquisadores podiam mostrar que os eventos do chromothripsis são muito mais predominantes no cancro do que calculados previamente. Igualmente caracterizaram os testes padrões de alterações maciças do genoma através dos tipos do cancro, e estudaram os mecanismos do reparo do ADN envolvidos em sua geração.

“Este estudo é contudo uma outra demonstração da potência do inteiro-genoma em grande escala que arranja em seqüência,” diz o parque de Peter, professor da informática biomedicável na Faculdade de Medicina de Harvard e no autor superior do papel. “Permitiu que nós sondassem a complexidade desconcertante da genoma-quebra em genomas do cancro e caracterizassem características comuns através das centenas de casos.”

Chromothripsis e prognóstico do cancro

“As descobertas feitas neste projecto permitem que nós compreendam melhor como o cancro elevara e evolui, assim como os testes padrões das alterações no ADN de tumores humanos,” diz Cortés-Ciriano. “Algumas destas alterações têm implicações clínicas fortes e poderiam abrir avenidas novas para a revelação terapêutica sobre os anos seguintes.”

Os pesquisadores demonstram que o chromothripsis dá forma ao genoma do tumor, conduzindo à perda de genes de supressor do tumor e à amplificação dos oncogenes para conduzir a progressão do cancro. Chromothripsis foi associado com o prognóstico deficiente para pacientes que sofre de cancro, mas continuando estuda-nos como esta ajuda para compreender o impacto do chromothripsis e de outras alterações em grande escala do genoma, e como podem ser usados para o diagnóstico do cancro no futuro.

O projecto do Bandeja-Cancro

A análise do Bandeja-Cancro do projecto inteiro dos genomas é uma colaboração que envolve mais de 1300 cientistas e clínicos de 37 países. Envolveu a análise de mais de 2600 genomas de 38 tipos diferentes do tumor, criando um recurso enorme de genomas preliminares do cancro. Este era o ponto de partida para que 16 grupos de trabalho estudem aspectos múltiplos da revelação, da causa, da progressão, e da classificação do cancro.

Source:
Journal reference:

Cortés-Ciriano, I., et al. (2020) Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing. Nature Genetics. doi.org/10.1038/s41588-019-0576-7.