Los investigadores descubren nuevo chromothripsis mutacional del fenómeno en cáncer

Los investigadores en la Facultad de Medicina de Harvard y EMBL-EBI han realizado el análisis más grande a través de tipos del cáncer del chromothripsis mutacional nuevamente descubierto del fenómeno. Este estudio es el más grande de su clase hasta la fecha, conteniendo el entero-genoma que ordena (WGS) datos sobre de 2600 tumores que atraviesan 38 diversos tipos de cáncer.

Chromothripsis

Chromothripsis, o el “cromosoma que rompe”, es un proceso mutacional en el cual los alargamientos grandes de un cromosoma experimentan los cambios masivos en una única acción catastrófica. El fragmento cromosómico de las regiones en pedazos más pequeños, cambia, y se reagrupa, llevando a una nueva configuración del genoma.

Completo entendiendo cómo estos cambios impulsan la evolución del genoma del cáncer, y qué mecanismos moleculares están implicados en su generación, sea pasos importantes hacia la evolución de comprensión del genoma del cáncer.

Esta investigación fue publicada en la genética como parte del Cubeta-Cáncer que el análisis de los genomas enteros (PCAWG) proyecta, un esfuerzo global de la naturaleza que implicaba la colaboración internacional sobre de 1300 científicos. En este estudio, los investigadores mostraron que las acciones del chromothripsis son mucho mas comunes a través de muchos tipos de cáncer que pensaron previamente. Podrían también conectar directamente chromothripsis a los sellos comunes del genoma del cáncer, incluyendo la amplificación del oncogene (un aumento en el número de copias de un gen que puede causar el cáncer), y la baja de los supresores del tumor (los genes que regulan incremento y la división de la célula).

Incidencia de Chromothripsis en cáncer

Integramos datos del WGS sobre de 2600 tumores que atravesaban más de 30 tipos del cáncer. De esto descubrimos que las acciones del chromothripsis y otros tipos de cambios complejos del genoma son penetrantes a través de cánceres humanos, con las frecuencias mayores el de 50% de tumores en un cierto cáncer pulsa.”

Isidro Cortés-Ciriano, líder del grupo en EMBL-EBI y un investigador postdoctoral anterior en la Facultad de Medicina de Harvard

Usando grupos de datos del WGS dio a investigadores una vista aumentada de las acciones del chromothripsis en el genoma del cáncer. Los estudios anteriores que observaban el papel del chromothripsis en la inferior-resolución de uso frecuente del cáncer y de las enfermedades congénitas matriz-basaron tecnologías. Aquí los investigadores podían mostrar que las acciones del chromothripsis son mucho más frecuentes en cáncer que estimadas previamente. También caracterizaron las configuraciones de los cambios masivos del genoma a través de tipos del cáncer, y estudiaron los mecanismos de la reparación de la DNA implicados en su generación.

“Este estudio es otra demostración de la potencia del entero-genoma en grande que ordena,” dice el parque de Peter, profesor de la informática biomédica en la Facultad de Medicina de Harvard y el autor mayor del papel. “Permitió que sondáramos la complejidad desconcertante de genoma-romper en genomas del cáncer y que caracterizáramos características comunes a través de centenares de casos.”

Chromothripsis y pronóstico del cáncer

“Los descubrimientos hechos en este proyecto permiten que entendamos mejor cómo el cáncer se presenta y se desarrolla, así como las configuraciones de cambios en la DNA de tumores humanos,” dice Cortés-Ciriano. “Algunos de estos cambios tienen implicaciones clínicas fuertes y podrían abrir las nuevas avenidas para el revelado terapéutico en los próximos años.”

Los investigadores demuestran que el chromothripsis da forma el genoma del tumor, llevando a la baja de los genes de supresor del tumor y a la amplificación de oncogenes para impulsar la progresión del cáncer. Chromothripsis se ha asociado al pronóstico pobre para los enfermos de cáncer, pero continuando nos estudia como esta ayuda para entender el impacto del chromothripsis y de otros cambios en grande del genoma, y cómo pueden ser utilizados para la diagnosis del cáncer en el futuro.

El proyecto del Cubeta-Cáncer

El análisis del Cubeta-Cáncer del proyecto entero de los genomas es una colaboración que implica más de 1300 científicos y clínicos a partir de 37 países. Implicó análisis de más de 2600 genomas de 38 diversos tipos del tumor, creando un recurso enorme de los genomas primarios del cáncer. Éste era el punto de partida para que 16 grupos de trabajo estudien aspectos múltiples del revelado, de la causalidad, de la progresión, y de la clasificación del cáncer.

Source:
Journal reference:

Cortés-Ciriano, I., et al. (2020) Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing. Nature Genetics. doi.org/10.1038/s41588-019-0576-7.