As impressões digitais genéticas podiam ajudar a identificar culpados cancerígenos

As causas do cancro estão sendo catalogadas com um estudo internacional que revela as impressões digitais genéticas dos processos ADN-prejudiciais que conduzem a revelação do cancro. Os pesquisadores da Faculdade de Medicina de San Diego da Universidade da California, do instituto de Wellcome Sanger, do Duque-NUS Faculdade de Medicina Singapura, do instituto largo do MIT e de Harvard, com colaboradores em todo o mundo, criaram a lista a mais detalhada contudo destas impressões digitais genéticas, fornecendo indícios a como cada cancro se torna.

Estas impressões digitais permitirão que os cientistas procurarem pelos produtos químicos previamente desconhecidos, por caminhos biológicos e pelos agentes ambientais responsáveis para causar o cancro.

Nós identificamos quase cada genoma disponível publicamente do cancro no início deste projecto e analisamos suas seqüências inteiras do genoma. Os dados destes milhares de cancros permitiram que nós descrevessem assinaturas mutational em muito mais detalhe, e nós estamos seguros que nós conhecemos agora a maioria das assinaturas que existem.”

Ludmil B. Alexandrov, PhD, primeiro autor, professor adjunto nos departamentos da medicina e da tecnologia biológica celulares e moleculars em Uc San Diego

A pesquisa, publicada o 5 de fevereiro de 2020 na natureza como parte do projecto global do Bandeja-Cancro, ajudará a traçar as causas do cancro, informará estratégias da prevenção e definirá sentidos novos para diagnósticos e tratamentos do cancro.

Nos Estados Unidos, as avaliações do instituto nacional para o cancro 1,7 milhão novos casos do cancro foram diagnosticadas em 2018 e mais de 600.000 povos morreram da doença. Aproximadamente 38 por cento dos homens e das mulheres neste país serão diagnosticados com cancro em sua vida.

O cancro é causado por mudanças genéticas -- mutações -- no ADN de uma pilha, alertando a pilha para dividir-se incontroladamente. Muitas causas conhecidas do cancro, tais como o uso da luz ultravioleta e do tabaco, deixam uma impressão digital específica de dano no ADN, conhecida como uma assinatura mutational. Estas impressões digitais podem ajudar a compreender como os cancros se tornam, e potencial como puderam ser impedidos. Contudo, os estudos passados não foram grandes bastante identificar todas as assinaturas mutational potenciais.

“Usar nosso catálogo detalhado da escala de assinaturas mutational no ADN do cancro, os pesquisadores no mundo inteiro poderá agora investigar que produtos químicos ou processos são ligados a estas assinaturas,” disse autor Mike co-superior Stratton, PhD, director do instituto de Wellcome Sanger. “Isto aumentará nossa compreensão de como o cancro se torna, e descobre as causas novas do cancro, ajudando a informar estratégias da saúde pública para impedir o cancro.”

Este estudo identificou as assinaturas mutational novas de que não tinha sido visto antes, das únicas mutações do erro tipográfico da letra, às inserções e aos supressões ligeira maiores do código genético. O resultado é a base de dados a maior de assinaturas mutational da referência. Somente sobre a metade de todas as assinaturas mutational souberam causas.

“Alguns tipos destas impressões digitais do ADN, ou as assinaturas mutational, reflectem como o cancro poderia responder às drogas,” disseram Steven co-superior Rozen autor, PhD, director do centro para a biologia computacional e professor da biologia do cancro e de célula estaminal no Duque-NUS Faculdade de Medicina. “Uma pesquisa mais adicional nesta poderia ajudar a diagnosticar alguns cancros e que drogas puderam responder.”

O projecto global do Bandeja-Cancro é o estudo o maior e o mais detalhado de genomas inteiros do cancro. A colaboração criou um recurso enorme de genomas preliminares do cancro, disponível aos pesquisadores no mundo inteiro para avançar a investigação do cancro.

“A disponibilidade de um grande número genomas inteiros permitiu-nos de aplicar uns métodos analíticos mais avançados para descobrir e para refinar assinaturas mutational e para expandir nosso estudo em tipos adicionais de mutações,” disse o Gad co-superior Getz, PhD, membro do instituto do instituto largo do MIT e Harvard do autor, professor da patologia na Faculdade de Medicina de Harvard, e o membro da faculdade e o director da bioinformática no centro do cancro do Hospital Geral de Massachusetts.

“Nossa coleção nova das assinaturas fornece uma imagem mais completa dos processos biológicos e químicos que o ADN de dano ou do reparo e permitirá pesquisadores de decifrar os processos mutational que afectam os genomas de cancros recentemente arranjados em seqüência.”

Source:
Journal reference:

Alexandrov, L.B., et al. (2020) The repertoire of mutational signatures in human cancer. Nature. doi.org/10.1038/s41586-020-1943-3.