Las huellas dactilares genéticas podían ayudar a determinar a culpables cancerígenos

Las causas del cáncer se están catalogando con un estudio internacional que revela las huellas dactilares genéticas de los procesos DNA-perjudiciales que impulsan el revelado del cáncer. Los investigadores de la Facultad de Medicina de San Diego de la Universidad de California, del instituto de Wellcome Sanger, del Duque-NUS Facultad de Medicina Singapur, del instituto amplio del MIT y de Harvard, con los colaboradores en todo el mundo, han creado el filete más detallado con todo de estas huellas dactilares genéticas, ofreciendo pistas a cómo cada cáncer se convierte.

Estas huellas dactilares permitirán que los científicos exploren para las substancias químicas previamente desconocidas, los caminos biológicos y los agentes ambientales responsables de causar el cáncer.

Determinamos casi cada genoma público disponible del cáncer al inicio de este proyecto y analizábamos sus series enteras del genoma. Los datos de estos millares de cánceres permitieron que describiéramos firmas mutacionales en mucho más detalle, y nos sentimos confiados que ahora conocemos la mayor parte de las firmas que existen.”

Ludmil B. Alexandrov, doctorado, primer autor, profesor adjunto en de los departamentos del remedio y de la bioingeniería celulares y moleculares en Uc San Diego

La investigación, publicada el 5 de febrero de 2020 en naturaleza como parte del proyecto global del Cubeta-Cáncer, ayudará a delinear las causas del cáncer, informará a estrategias de la prevención y definirá las nuevas direcciones para las diagnosis y los tratamientos del cáncer.

En los Estados Unidos, los presupuestos del Instituto Nacional del Cáncer 1,7 millones de nuevos casos de cáncer fueron diagnosticados en 2018 y más de 600.000 personas murieron de la enfermedad. Diagnosticarán al aproximadamente 38 por ciento de hombres y de mujeres en este país con el cáncer en su curso de la vida.

Los cambios genéticos causa el cáncer -- mutaciones -- en la DNA de una célula, incitando la célula para dividir incontrolable. Muchas causas sabidas del cáncer, tales como uso de la luz ultravioleta y del tabaco, dejan una huella dactilar específica del daño en la DNA, conocida como firma mutacional. Estas huellas dactilares pueden ayudar a entender cómo los cánceres se convierten, y potencialmente cómo puede ser que sean prevenidos. Sin embargo, los últimos estudios no han sido bastante grandes determinar todas las firmas mutacionales potenciales.

“Usando nuestro catálogo detallado del alcance de las firmas mutacionales en la DNA del cáncer, los investigadores por todo el mundo pueda ahora investigar qué substancias químicas o procesos se conectan a estas firmas,” dijo autor a Mike co-mayor Stratton, doctorado, director del instituto de Wellcome Sanger. “Esto aumentará nuestra comprensión de cómo el cáncer se convierte, y descubre las nuevas causas del cáncer, ayudando a informar a estrategias de la salud pública para prevenir el cáncer.”

Este estudio determinó las nuevas firmas mutacionales antes de las cuales no había sido visto, de únicas mutaciones del error tipográfico de la carta, a inserciones y a supresiones ligeramente más grandes de la clave genética. El resultado es la base de datos más grande de las firmas mutacionales de la referencia. Solamente sobre la mitad de todas las firmas mutacionales han sabido causas.

“Algunos tipos de estas huellas dactilares de la DNA, o las firmas mutacionales, reflejan cómo el cáncer podría responder a las drogas,” dijeron a Steven co-mayor Rozen autor, doctorado, director del centro para la biología de cómputo y profesor de la biología del cáncer y de célula madre en el Duque-NUS Facultad de Medicina. La “investigación adicional en esto podría ayudar a diagnosticar algunos cánceres y qué drogas puede ser que respondan.”

El proyecto global del Cubeta-Cáncer es el estudio más grande y más completo de los genomas enteros del cáncer. La colaboración ha creado un recurso enorme de los genomas primarios del cáncer, disponible para los investigadores por todo el mundo para avance la investigación de cáncer.

“La disponibilidad de un gran número de genomas enteros nos permitió aplicar métodos analíticos más avanzados para descubrir y refinar firmas mutacionales y desplegar nuestro estudio en tipos adicionales de mutaciones,” dijo el Gad co-mayor Getz del autor, doctorado, pieza del instituto del instituto amplio del MIT y Harvard, profesor de la patología en la Facultad de Medicina de Harvard, y miembro del profesorado y director de la bioinformática en el centro del cáncer del Hospital General de Massachusetts.

“Nuestra nueva colección de firmas ofrece un retrato más completo de los procesos biológicos y químicos que la DNA del daño o de la reparación y permitirá a investigadores descifrar los procesos mutacionales que afectan a los genomas de cánceres nuevamente ordenados.”

Source:
Journal reference:

Alexandrov, L.B., et al. (2020) The repertoire of mutational signatures in human cancer. Nature. doi.org/10.1038/s41586-020-1943-3.