La technique nouvelle pour étudier l'épissure de gène indique des analyses neuves dans le procédé

Les gènes sont comme des directives, mais avec des options pour établir plus d'une chose. Daniel Larson, chercheur supérieur à l'Institut national du cancer, étudie ce procédé « de épissure » de gène, qui se produit en cellules normales et entre de travers dans des cancers de sang comme la leucémie. Larson, associé post-doctoral Yihan blême, et collègues ont développé une technique neuve pour étudier le gène épissant à une écaille sans précédent, indiquant les petits groupes neufs dans le procédé. Larson présentera l'équipe travaillent dimanche 16 février, à la rencontre annuelleth 64 de la société biophysique à San Diego, la Californie.

Imaginez une longue liste de directives avec trois parts. Si vous couperez-coll des parties une et deux ensemble vous pourraient construire un camion de camionnette de livraison, ou si vous colliez la partie une et trois, vous pourriez effectuer un véhicule. Puisque vous ne voudriez pas couper la matrice originelle et détruire une partie de vos directives pour toujours, vous commencez par tirer une copie. C'est comment cela fonctionne en nos cellules ; Des directives d'ADN sont copiées dans l'ARN, avant d'être coupé et épissé ensemble, et servant de directives à une protéine et à ses variations. L'épissure de gène est une voie importante que l'expression du gène est réglée pour produire la diversité de protéine.

L'épissure est l'un des mystères de longue date dans l'expression du gène, particulièrement pour les gènes humains parce que la majeure partie du gène obtient coupée. Nous ne savons toujours pas la cellule sait où épisser. Nous avons également l'idée très petite de la façon dont l'épissure varie de la cellule à la cellule et de ses conséquences pour la biologie. »

Daniel Larson, chercheur supérieur, Institut national du cancer

Pour commencer à répondre à ces questions, Larson, blême, et des collègues ont développé et ont mis en application un tour génétique pour marquer des milliers de gènes immédiatement pour produire d'une vue complète de la façon dont l'ARN est effectué et traité.

L'équipe a inséré un gène dans le génome des cellules humaines qui fait devenir des transcriptions de l'ARN fluorescentes. Utilisant la représentation unicellulaire de haut-débit en travers des milliers de cellules, elles ont suivi le RNAs de différents gènes pendant qu'elles étaient effectuées et épissées en temps réel. Cependant la sonde fluorescente a été insérée fait au hasard dans le génome, elles pouvaient employer profondément l'ordonnancement pour déterminer quel gène avait été marqué, et puis pour apparier cette caractéristique aux caractéristiques de représentation.

« Nos résultats, de presque 1.000 gènes, montrent que l'épissure se produit bien plus souvent que n'importe qui précédemment prévu, » Larson dit. Il a également indiqué qu'il y a une quantité incroyable de variabilité dans le calage d'expression du gène, du laps de temps des séjours d'un gène en sommeil, au laps de temps avant l'épissure se produit. Et le spliceosome, la machine cellulaire qui fait l'épissure, semble être très efficace à ce procédé couperant-coll, même lorsqu'il a les pièces énormes à retirer.

Larson espère que sa méthode neuve aidera des scientifiques entièrement à comprendre le gène épissant par le spliceosome. « Puisque le spliceosome est fréquemment subi une mutation dans le cancer, comment le spliceosome prend les décisions et ce que ces spliceosomes font est une remise en cause appuyante en médicament, » Larson dit.