A técnica nova para estudar a emenda do gene revela introspecções novas no processo

Os genes são como instruções, mas com opções para construir mais de uma coisa. Daniel Larson, investigador superior no instituto nacional para o cancro, estuda este processo “de emenda” do gene, que acontece em pilhas normais e vai awry em cancros de sangue como a leucemia. Larson, o associado pos-doctoral Yihan macilento, e os colegas desenvolveram uma técnica nova para estudar o gene que emenda em uma escala inaudita, revelando detalhes novos no processo. Larson apresentará a equipe trabalha domingo 16 de fevereiro, na reuniãoth 64 anual da sociedade biofísica em San Diego, Califórnia.

Imagine uma lista de instruções longa com três porções. Se você cortara-col secções uma e dois junto você poderiam construir um camião de recolhimento, ou se você colou a parte uma e três, você poderia fazer um carro. Desde que você não quereria cortar o molde original e perder para sempre a parte de suas instruções, você começa fazendo uma cópia. Isto é como trabalha em nossas pilhas; As instruções do ADN são copiadas no RNA, antes de ser cortado e emendaa junto, e servindo como instruções para uma proteína e suas variações. A emenda do gene é uma maneira importante que a expressão genética está regulada para criar a diversidade da proteína.

Emendar é um dos mistérios de longa data na expressão genética, especialmente para genes humanos porque a maioria do gene obtem cortado. Nós ainda não sabemos a pilha sabe onde emendar. Nós igualmente temos a ideia muito pequena de como emendar varia da pilha à pilha e das suas conseqüências para a biologia.”

Daniel Larson, investigador superior, instituto nacional para o cancro

Para começar responder 2 aquelas perguntas, Larson, macilento, e colegas desenvolveram e executaram um truque genético para etiquetar imediatamente milhares de genes para gerar uma vista detalhada de como o RNA está sendo feito e processado.

A equipe introduziu um gene no genoma de pilhas humanas que faz com que os transcritos do RNA se tornem fluorescentes. Usando a imagem lactente da único-pilha da alto-produção através dos milhares de pilhas, seguiram o RNAs dos genes individuais enquanto foram feitos e emendados no tempo real. A ponta de prova fluorescente foi introduzida embora aleatòria no genoma, podiam usar profundamente arranjar em seqüência para determinar que gene tinha sido etiquetado, e para combinar então esses dados aos dados da imagem lactente.

“Nossos resultados, de quase 1.000 genes, mostram que emendar acontece distante mais frequentemente do que qualquer um esperado previamente,” Larson dizem. Igualmente revelou que há uma quantidade incrível de variabilidade no sincronismo da expressão genética, da quantidade de tempo as estadas de um gene dormentes, à quantidade de tempo antes de emendar ocorre. E a spliceosome, a máquina celular que faz a emenda, parece ser muito eficaz neste processo cortarando-col, mesmo quando tem as partes enormes a remover.

Larson espera que seu método novo ajudará cientistas inteiramente a compreender o gene que emenda pelo spliceosome. “Porque o spliceosome é transformado freqüentemente no cancro, como o spliceosome está fazendo as decisões e o que estes spliceosomes fazem são uma pergunta de pressão na medicina,” Larson diz.