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La technique neuve peut marquer de diverses molécules dans un prélèvement de tissu unique

Une technique neuve peut marquer de diverses molécules et amplifier le signe d'aider des chercheurs à repérer ceux qui sont particulièrement rares. SABER appelé (amplification de signe par réaction de substitution), laboratoire de Peng Yin à l'institut de Wyss de Harvard a introduit la première fois l'année dernière cette méthode et puisqu'ont trouvé des moyens de s'appliquer l'aux protéines, ADN et ARN. Yin expliquera comment la nanotechnologie conçue d'ADN, y compris le SABRE, peut aider des scientifiques à analyser l'horizontal moléculaire mardi 18 février à la rencontre annuelleth 64 de la société biophysique à San Diego, la Californie.

Il est essentiel de comprendre comment nos fuselages fonctionnent normalement ou pendant la maladie au cellulaire et aux niveaux moléculaires, pouvant concevoir une gamme des molécules. Il y a actuel des méthodes pour faire ceci, mais chacun a ses limitations. Il est particulièrement difficile de voir les molécules d'inférieur-abondance, qui donnent un faible ou non détectable signe quand une sonde fluorescente unique fixe. Il conteste également pour voir beaucoup de molécules simultanément ou pour rechercher les molécules occasionnelles dans de grands et complexes prélèvements de tissu, comme des biopsies de tumeur. Peng inspiré ces par limitations Yin pour concevoir et développer des nanotechnologies neuves.

Le SABRE est une nanotechnologie utilisant les matrices personnalisées d'ADN qui peuvent fixer aux molécules d'intérêt. Chaque matrice d'ADN a également des objectifs pour ajouter les sondes fluorescentes, qui peuvent être conçues pour avoir une configuration étant branchée pour faciliter des sondes plus fluorescentes, la facilitant de ce fait pour trouver les molécules rares. Dans la première démonstration de la technologie de SABRE, Yin et collègues ont visé l'ADN et les séquences d'ARN dans la rétine de souris et également ont conçu 17 régions différentes d'objectif simultanément sur le chromosome X humain. C'est une importante amélioration au-dessus de la méthode conventionnelle, connue sous le nom de POISSONS (hybridation in situ de fluorescence), qui ont eu une difficulté trouver des séquences rares, particulièrement en tissu épais, et ont été limités à une sonde fluorescente.

Pour employer le SABRE pour trouver des protéines, Yin et collègues ont fixé les traitements courts d'ADN aux anticorps. Les anticorps grippent particulièrement aux protéines, puis le procédé de SABRE peut ajouter des séquences d'ADN dans une configuration étant branchée pour ajouter les molécules fluorescentes. Elles ont nommé l'immuno-SABRE de technique. À la différence d'immuno-florescence normal, dans lequel seulement cinq protéines peuvent type être marquées dans le même échantillon, en accouplant l'immuno-SABRE à une méthode d'échange d'ADN, elles ont marqué dix protéines dans le même échantillon de rétine.

À cause de sa vitesse, le coût bas, et la capacité de trouver beaucoup de molécules d'inférieur-abondance dans le même échantillon, SABRE offre la possibilité d'examen critique de haut-débit, qui pourrait avancer la biologie fondamentale, la découverte de biomarqueur, et la diagnose clinique, Yin dit. Et un jour, PengYin dit :

Le SABRE a pu être utile pour apparier des patients avec des demandes de règlement optimales basées sur la configuration spatiale des bornes de protéine. Par exemple, pour le cancer, le micro-environnement de tumeur peut être caractérisé par la configuration spatiale d'expression des bornes de protéine, qui pourraient aviser la demande de règlement d'immunothérapie. »