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La nueva técnica puede etiqueta las moléculas diversas en una única muestra de tejido

Una nueva técnica puede etiqueta las moléculas diversas y amplificar la señal de ayudar a investigadores a observar los que sean especialmente raros. SABER llamado (amplificación por la reacción de cantina), laboratorio de la señal de Peng Yin en el instituto de Wyss de Harvard primero introdujo este método el año pasado y puesto que han encontrado maneras de aplicarlo a las proteínas, DNA y ARN. Yin explicará cómo la nanotecnología dirigida de la DNA, incluyendo el SABLE, puede ayudar a científicos a analizar el paisaje molecular el martes 18 de febrero en la reuniónth anual 64 de la sociedad biofísica en San Diego, California.

Para entender cómo nuestras carrocerías funcionan normalmente o durante enfermedad en los niveles celulares y moleculares, pudiendo visualizar un alcance de moléculas es esencial. Hay actualmente métodos para hacer esto, pero cada uno tiene sus limitaciones. Es especialmente difícil ver las moléculas de la inferior-abundancia, que dan una señal débil o no detectable cuando una única antena fluorescente sujeta. También está desafiando para ver muchas moléculas simultáneamente o para buscar las moléculas infrecuentes en muestras de tejido grandes y complejas, como biopsias del tumor. Peng inspirado estas limitaciones Yin para diseñar y para desarrollar las nuevas nanotecnologías.

El SABLE es una nanotecnología que emplea los patrones modificados para requisitos particulares de la DNA que pueden sujetar a las moléculas del interés. Cada patrón de la DNA también tiene objetivos para agregar las antenas fluorescentes, que se pueden diseñar para tener una configuración que se ramifica para acomodar antenas más fluorescentes, de tal modo haciéndola más fácil descubrir las moléculas raras. En la primera demostración de la tecnología del SABLE, Yin y los colegas apuntaron series de la DNA y del ARN en retina del ratón y también visualizaron 17 diversas regiones del objetivo simultáneamente en el cromosoma X humano. Esto es una mejoría importante sobre el método convencional, conocido como PESCADOS (hibridación in situ de la fluorescencia), que tenían una dificultad el descubrir de series raras, especialmente en tejido grueso, y fueron limitados a una antena fluorescente.

Para utilizar el SABLE para descubrir las proteínas, Yin y los colegas sujetaron las manetas cortas de la DNA a los anticuerpos. Los anticuerpos atan específicamente a las proteínas, después el proceso del SABLE puede agregar series de la DNA en una configuración que se ramifica para agregar las moléculas fluorescentes. Nombraron el inmuno-SABLE de la técnica. A diferencia de inmuno-florescence estándar, en las cuales solamente cinco proteínas se pueden etiqueta típicamente en la misma muestra, acoplando el inmuno-SABLE a un método de la cantina de la DNA, etiqueta diez proteínas en la misma muestra de la retina.

Debido a su velocidad, el bajo costo, y la capacidad de descubrir muchas moléculas de la inferior-abundancia en la misma muestra, SABLE ofrece la posibilidad de la investigación de la alto-producción, que podría avance biología básica, descubrimiento del biomarker, y diagnósticos clínicos, Yin dice. Y algún día, PengYin dice:

El SABLE podía ser útil para igualar a pacientes con los tratamientos óptimos basados en la configuración espacial de los marcadores de la proteína. Por ejemplo, para el cáncer, el microambiente del tumor se puede caracterizar por la configuración espacial de la expresión de los marcadores de la proteína, que podrían informar al tratamiento de la inmunoterapia.”