L'étude recense CoV neuf responsable de la manifestation de Wuhan

Les 2019 coronavirus nouveaux (CoV) entraînent la pneumonie fatale qui a prétendu plus de 1300 durées, avec plus de 52000 cas confirmés d'infection avant le 13 février 2020, tous dans l'envergure de juste au-dessus d'un mois. Mais, quel est ce virus ? Est-ce un virus neuf totalement ? D'où est-il venu ? Les scientifiques de premiers instituts de recherches en Chine se sont associés pour répondre à ces questions, et cette étude de lancement a été publiée en tourillon médical chinois.

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Début décembre, quelques gens dans la ville de Wuhan dans la province de Hubei de la Chine ont commencé le malade en baisse après être allé à un marché local de fruits de mer. Ils ont remarqué des sympt40mes comme la toux, la fièvre, et le manque du souffle, et même les complications liées au syndrome de détresse respiratoire aigu (ARDS). Le diagnostic immédiat était pneumonie, mais la cause exacte était inexpliquée. Qu'a entraîné cette manifestation neuve ? Est-ce le syndrome-CoV respiratoire aigu (SARS) sévère ? Est-ce le syndrome-CoV respiratoire (MERS) de Moyen-Orient ? Car il s'avère, les scientifiques avaient entrepris une étude pour recenser ce virus en décembre après avoir analysé les cas premiers. Cette étude est maintenant publiée en tourillon médical chinois et l'identité du virus a été déterminée--c'est un virus complet neuf, étroitement lié à "bat" CoV radar à ouverture synthétique Radar à ouverture synthétique.

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M. Jianwei Wang (Académie des sciences médicales chinoise, institut de biologie d'agent pathogène), chercheur de fil sur l'étude, conditions :

Notre papier a déterminé l'identité de la "bat"-origine CoV qui était inconnue jusqu'ici. »

Dans cette étude, les scientifiques des instituts de recherches illustres en Chine, telle que l'Académie des sciences médicales chinoise, institut de biologie d'agent pathogène, hôpital d'amitié du Chine-Japon, et faculté de médecine des syndicats de Pékin, ont commun découvert et ont recensé le CoV neuf--le coupable principal de la manifestation de Wuhan--par l'ordonnancement de la deuxième génération (NGS). Ils se sont concentrés sur cinq patients admis à l'hôpital de Yin-tan de Jin à Wuhan, dont la plupart étaient des travailleurs sur le marché de fruits de mer de Huanan à Wuhan. Ces patients ont eu la grosse fièvre, la toux, et d'autres sympt40mes, et ont été au commencement diagnostiqués pour avoir la pneumonie, mais d'une cause inconnue. L'état de quelques patients rapidement empiré à ARDS ; on est même mort.

M. Wang dit :

Les radiographies de la poitrine des patients ont montré quelques opacities et fusions flous, qui sont typiques de la pneumonie. Cependant, nous avons voulu découvrir ce qui a entraîné la pneumonie, et nos expériences suivantes ont indiqué la cause exacte--un CoV neuf qui n'a pas été connu déja. »

Pour l'étude, les scientifiques ont employé les échantillons liquides du lavage bronchoalvéolaire (BAL) prélevés des patients (BAL est une procédure dont du liquide stérile est transféré aux poumons par un bronchoscope et puis rassemblé pour l'analyse).

D'abord, les scientifiques ont essayé de recenser le virus par séquençage du génome, utilisant la technologie de NGS. NGS est la méthode de dépistage préférée pour recenser les agents pathogènes inconnus parce qu'il rapidement trouve et élimine tous les micros-organismes pathogènes connus dans l'échantillon. Basé sur l'ordonnancement du DNA/RNA des échantillons liquides de BAL, les scientifiques ont constaté que les la plupart du viral s'affichent appartenu à la famille de CoV. Les scientifiques ont alors assemblé le différent « s'affiche » qu'appartenu à CoVs et construit une séquence génomique entière pour le virus neuf ; ces séquences étaient 99.8-99.9% assimilés parmi les échantillons de tous les patients, confirmant que ce virus était l'agent pathogène courant dans tous les patients. De plus, utilisant l'analyse d'homologie, où une séquence de génome est comparée contre d'autres séquences connues de génome (avec un seuil de préréglage de 90% pour qu'il soit considéré une séquence) « neuve », ils ont confirmé que la séquence de génome de ce virus neuf est 79,0% assimilés aux Radars à ouverture synthétique-CoV, environ 51,8% assimilés au MERS-CoV, et environ 87.6-87.7% assimilés à l'autre CoVs radar à ouverture synthétique Radar à ouverture synthétique de "bat" en fer à cheval chinoises (ZC45 appelé et ZXC21). L'analyse phylogénétique a prouvé que les séquences des cinq tensions de CoV obtenues étaient les plus proches de ceux des tensions "bat"-dérivées, mais les succursales évolutionnaires indépendantes formées. Ces découvertes proposent clairement que le virus ait provenu de "bat".

Conditions de M. Wang :

Puisque les similitudes du gène viral de replicase avec tout l'autre les virus « assimilés » connus sont toujours moins de 90%, et également compte tenu des résultats phylogénétiques d'analyse, nous considérons que c'est en effet un CoV neuf et précédemment inconnu. Ce virus neuf est temporairement appelé le 2019-nCoV. »

Pour finir, les scientifiques ont déménagé à « isoler » le virus des échantillons liquides de BAL en vérifiant si les échantillons liquides ont montré l'effet cytopathe aux lignées cellulaires dans le laboratoire. Les cellules exposées aux échantillons liquides ont été observées sous un microscope électronique, et les scientifiques ont trouvé les structures comme CoV caractéristiques. Ils ont également employé l'immunofluorescence--une technique qui emploie des anticorps spécifiques a étiqueté avec les teintures fluorescentes. Pour ceci, elles ont employé le sérum des patients de récupération (qui ont contenu des anticorps), qui a réagi avec les particules virales à l'intérieur des cellules ; ceci a confirmé que ce virus était en effet la cause de l'infection.

Cette étude prépare le terrain pour que les futures études comprennent le virus et ses sources mieux, particulièrement donné son écart rapide, sa capacité d'entraîner ARDS fatal, et la panique provoquée par la manifestation. Bien que 4 des 5 patients desquels ce virus a été recensé aient été d'un marché de fruits de mer à Wuhan, l'origine exacte de l'infection est inconnue. Le CoV pourrait avoir été communiqué à des êtres humains par un transporteur « intermédiaire », comme dans le cas de Radars à ouverture synthétique-CoV (viande de civette de paume) ou MERS-CoV (chameau).

M. Wang conclut :

Tout le CoVs humain sont zoonotique, et plusieurs l'être humain CoVs ont provenu de "bat", y compris le radar à ouverture synthétique et le MERS-CoVs. Notre étude montre clairement le besoin urgent pour la surveillance régulière de la boîte de vitesses de la "bat"-origine CoVs aux êtres humains. L'émergence de ce virus est un danger massif à la santé publique, et pour cette raison, elle est d'importance critique pour comprendre la source de ce virus et pour décider les prochaines opérations avant que nous soyons témoin d'une manifestation à grande échelle. »

Cette étude de lancement entreprend l'ordonnancement du génome du CoV pour la première fois. Crédit : Tourillon médical chinois

Source:
Journal reference:

Ren, L-L., et al. (2020) Identification of a novel coronavirus causing severe pneumonia in human a descriptive study. Chinese Medical Journal. doi.org/10.1097/CM9.0000000000000722.