Poichè gli scienziati rimescolano per imparare più circa il coronavirus SARS-CoV-2, due studi recenti sul genoma dei virus hanno raggiunto le conclusioni discutibili: vale a dire, quello serpeggia è host intermedi di nuovo virus e quello azioni “similarità misteriose„ di tasto di una proteina di coronavirus con una proteina di HIV-1. Ora, uno studio in giornale di ACS della ricerca di Proteome confuta entrambe le idee e suggerisce quello squamoso, gli animali del tipo di formichiere chiamati pangolini sono l'anello mancante per la trasmissione SARS-CoV-2 fra i pipistrelli ed esseri umani.
Capendo dove SARS-CoV-2 -- il virus che ha causato la pandemia COVID-19 -- è venuto da e come si sparge è importante per il sui controllo e trattamento. La maggior parte dei esperti acconsentono che i pipistrelli sono un bacino idrico naturale di SARS-CoV-2, ma un host intermedio era necessario affinchè salti dai pipistrelli agli esseri umani. Uno studio recente che ha analizzato il genoma dei nuovi virus ha suggerito i serpenti come questo host, malgrado il fatto che i coronaviruses fossero conosciuti soltanto per infettare i mammiferi e gli uccelli. Nel frattempo, uno studio indipendente ha confrontato la sequenza della proteina della punta -- una proteina chiave responsabile dell'entrare il virus nelle cellule di mammiferi -- di nuovo coronavirus a quello del HIV-1, notando le similarità inattese. Sebbene gli autori ritirino questo manoscritto della pubblicazione preliminare dopo la critica scientifica, ha generato le voci e le teorie di cospirazione che il nuovo coronavirus potrebbe essere costruito in un laboratorio. Yang Zhang e colleghi ha voluto condurre un'analisi più attenta e più completa delle sequenze del DNA SARS-CoV-2 e della proteina a risolvere questi problema.
Confrontato agli studi precedenti, i ricercatori hanno usato i più grandi insiemi di dati ed i più nuovi, metodi di bioinformatica e database più accurati per analizzare il genoma SARS-CoV-2. Hanno trovato che, contrariamente al reclamo che quattro regioni della proteina della punta sono state divise unicamente fra SARS-CoV-2 ed il HIV-1, i quattro segmenti di sequenza potrebbero essere trovati in altri virus, compreso il coronavirus del pipistrello. Dopo avere scoperto un errore nell'analisi che ha suggerito i serpenti come host intermedio, il gruppo ha cercato le sequenze della proteina e del DNA isolate dai tessuti del pangolino un simili a SARS-CoV-2. I ricercatori hanno identificato le sequenze della proteina in polmoni degli animali malati che erano 91% identici alle proteine dei virus umani. Inoltre, il dominio obbligatorio del ricevitore della proteina della punta dal coronavirus del pangolino ha avuto soltanto cinque differenze dell'amminoacido da SARS-CoV-2, rispetto a 19 differenze fra l'essere umano e batte le proteine virali. Questa prova indica il pangolino come il host intermedio più probabile per il nuovo coronavirus, ma i host intermedi supplementari potrebbero essere possibili, i ricercatori dicono.
Source:
Journal reference:
Zhang, C., et al. (2020) Protein Structure and Sequence Reanalysis of 2019-nCoV Genome Refutes Snakes as Its Intermediate Host and the Unique Similarity between Its Spike Protein Insertions and HIV-1. Journal of Proteome Research. doi.org/10.1021/acs.jproteome.0c00129.