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Huit tensions des coronavirus affligeant le monde

Les scientifiques autour du monde emballent pour étudier le coronavirus nouveau 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère de tension de coronavirus. Maintenant, il s'avère qu'il y a huit tensions de SARS-CoV-2 diffusant le globe. Les bonnes nouvelles sont celle selon le médecin de maladie infectieuse et le microbiologiste clinique Charles Chiu, « le virus subit une mutation tellement lentement que les souches virales sont principalement très assimilées entre eux. »

Utilisant la technologie de pointe pour ordonnancer rapidement le virus des échantillons de test, les chercheurs prouvent qu'il y a seulement des différences très minutieuses entre les différentes tensions, et aucun de elles n'améliore la virulence virale. D'ailleurs, dites les scientifiques, aucune tensions deviennent plus dangereux avec continuer la modification mutationnelle.

Les scientifiques étudiant le virus ont partagé leur connaissance pour compiler un plan génétique de séquence chez NextStrain.org, un site Web d'ouvert-accès qui montre comment les tensions variées ont voyagé dans différentes régions et pays. Ceci qui trouve est basé en circuit plus de 2.000 séquences du génome viral qui ont été partagées avec les chercheurs jusqu'ici. Les échantillons sont entrés de tous les continents excepté l'Antarctique.

Épidémiologie génomique de coronavirus nouveau. Crédit d
Épidémiologie génomique de coronavirus nouveau. Crédit d'image : Nextstrain

En référence à la boîte de vitesses du virus comme trackable, Chiu dit également, « nous avons la capacité de faire l'ordonnancement génomique presque en temps réel de voir quelles tensions ou lignées diffusent. »

Pourquoi le rail génétique est-il important ?

La maladie est asymptomatique ou douce dans jusqu'à 80% de gens mais causes pneumonie, insuffisance respiratoire, et mort dans jusqu'à 5% à 6% de général de cas sinon traitée. Si le virus devaient subir une mutation, d'autre part, et devenu plus mortel, il le rendrait plus difficile pour que les chercheurs développent un vaccin efficace basé sur les antigènes viraux.

Par exemple, la grippe saisonnière a un vaccin - mais elle doit être actualisée chaque seule année à cause des nombreux et mutations rapides qui ont mené à l'émergence de plusieurs différentes tensions du virus de la grippe. Tous les ans, les scientifiques doivent déchiffrer qui de ces tensions sont flottants autour le plus couramment et assurer le vaccin contient ces tensions.

En revanche, les virus tels que la varicelle et les virus de rougeoles subissent une mutation les coups de feu lentement, et par conséquent de immunisation contre eux immunité d'offre depuis de nombreuses années, peut-être perpétuel. À cet égard unique, le SARS-CoV-2 semble être plutôt eux que comme le virus de la grippe. Quoique l'étude prouve que le virus subit une mutation seulement une fois tous les 15 jours ou ainsi, les mutations sont « complet bénignes et utiles comme pièce de puzzle pour découvrir comment le virus écarte, » selon le fondateur Trevor Bedford de NextStrain.

Le coronavirus subit-il une mutation ?

La première étape dans la recherche génétique de SARS-CoV-2 a été prise par la Chine quand les généticiens ont mis en évidence la première fois la séquence du génome viral. Cette information, indique le chercheur Peter Thielen, montre une similitude plus proche avec le comportement de la varicelle et de la rougeole. D'ailleurs, la disponibilité tôt de la séquence génétique virale aidée avec le travail de la mise au point de vaccin.

Actuellement, dit Thielen, ils les explorent si le génome viral change de ce génome au commencement publié, et comment rapidement ce procédé se produit. Les expériences étant jusqu'ici effectuée orientation sur les mutations et les ont aidées pour obtenir à un taux de mutation expérimental. D'ailleurs, il aidera à indiquer à quel point les mesures de lockdown fonctionnent pour contenir l'écart viral, car le type de virus étant transmis sera évident sur l'ordonnancement génétique.

S'il y a boîte de vitesses répandue de communauté dans une région, elle prouvera que des commandes de lockdown ont été franchies par habitude. D'autre part, une réduction significative par transmission permettrait au lockdown d'être soulagé.

L'état, en ligne publié le 27 mars, est sous forme de plan de rail génétique basé sur cette caractéristique.

Les découvertes

L'étude a prouvé que le virus a atteint la première fois le R-U de Wuhan, Chine, se déplaçant Singapour et en Corée du Sud. La prochaine opération était d'écarter par l'intermédiaire des passagers de vol à Londres. De là, l'aéroport de grande ville était le moyeu d'où la propagation des virus au reste de l'Europe et des Etats-Unis.

Actuellement, dites les scientifiques, il reste « mélange intense des échantillons en travers de l'Europe, proposant que le virus ait prolongé à déménager en travers des bordures dans les 3-5 dernières semaines. » Une fois que les mesures de lockdown commencent à montrer plus d'effet, dites les chercheurs, les résultats seront des boîtiers de boîte de vitesses de chaque type ou de tension du virus dans différents pays.

Aux USA, cependant, les échantillons viraux provenant des bords opposés du pays sont presque identiques. Par exemple, dans la condition de Washington, le virus a été introduit deux fois, et peut-être plus. L'origine est pensée à soit la Chine ou l'Europe. L'effet est visible en tant que deux réseaux indépendants d'écart viral.

Cependant, en Californie et plusieurs autres conditions, le virus est vu écarter probablement au sein de la communauté plutôt qu'en étant introduit de l'extérieur, dites les scientifiques. C'est parce que plusieurs des cas sur la côte ouest sont très assimilés à une tension de Washington, qui est consécutivement seulement trois mutations à partir de la première tension du virus à trouver, disent les chercheurs.

Central et en Amérique du Sud, la configuration n'est pas claire car seulement quelques échantillons ont été prélevés. Les séquences neuves déjà reçues ont été comportées au plan, mais l'activité virale pourrait être plus forte que montrée.

Quand il s'agit de l'Asie, les chercheurs insistent sur le fait qu'elle ressemble à quelques cas est venue d'Iran récent.

En Afrique, le rail génétique propose que le virus soit transmis localement dans Kinshasa, une grande ville en république démocratique du Congo, pendant plus de 11 jours maintenant. Ici aussi, le nombre d'échantillons est inférieur, et l'illustration montrant peu d'activité COVID-19 est susceptible d'être fallacieuse.

En Océanie, l'écart viral local se produit en Nouvelle-Galles du Sud, Australie, selon l'étude.

Que fait ce moyen ?

Basé sur ces études, dit Thielen, ils sont arrivés à la conclusion préliminaire que « ce serait vraisemblablement un vaccin unique plutôt qu'un qui doit être actualisé tous les ans, comme le vaccin contre la grippe. » Le premier vaccin sera vraisemblablement procurable partout dans le monde en année ou 18 mois.

Avertit Kristian Anderson, qui recherche également la configuration de la boîte de vitesses, « nous ont un demi-million de cas décrits en ce moment mais peut-être 1.000 génomes ordonnancés. Donc il y a beaucoup de lignées que nous sommes manquants. »

Sources:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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