Compréhension du génome nouveau de coronavirus

By Angela Betsaida B. Laguipo, BSNMar 31 2020

Le coronavirus nouveau a apparu en décembre 2019 dans la ville de Wuhan, province de Hubei, en Chine, et depuis lors, il s'est rapidement écarté à plus de 170 pays en travers du globe. Notre connaissance du virus, officiellement nommée maintenant le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère, est toujours dans les stades précoces. Cependant, les scientifiques autour du monde emballent pour comprendre mieux le virus, dans l'espoir de jeter la lumière sur les vaccins potentiels et les traitements.

Pour répondre effectivement à une manifestation, il est essentiel que les experts santé étudient le génome du virus, pour fournir une meilleure compréhension de la nature de l'agent pathogène, comment elle affecte le corps humain, ce qui il vise, et comment elle est transmise. Une pleine compréhension de la caractérisation génomique et l'épidémiologie du coronavirus nouveau armeront des scientifiques avec les outils pour ralentir ou traiter SARS-CoV-2 complet.

Caractéristiques génomiques

En décembre 2019, 27 patients hors des 41 personnes admises aux hôpitaux dus à l'affection pulmonaire mystérieuse, réussie par un marché mouillé dans la ville de Wuhan. Cependant l'origine du virus a été tracée au marché, le tout premier cas humain recensé n'est pas allée au marché souvent. Au lieu de cela, basé sur les séquences génomique SARS-CoV-2, le premier cas peut être tracé de nouveau en novembre 2019.

Dans une étude entreprise par les scientifiques canadiens, elles ont ordonnancé presque le génome 30,000-base du coronavirus Radar à ouverture synthétique-associé, appelé l'isolat Tor2. Ils ont constaté que le coronavirus nouveau, SARS-CoV-2, seulement est modérément associé à d'autres coronaviruses connus, tels que l'OC43 et le 229E.  

De plus, les chercheurs ont constaté que SARS-CoV-2 appartient au groupe de Betacoronaviruses, qui est assimilé aux Radars à ouverture synthétique-CoV à partir de 2002. Pendant ce temps, on l'a constaté que "bat" du genre Rhinolophus étaient le réservoir du virus. On l'a également indiqué qu'une civette de paume, une carnivore féline long-bodied et aux jambes courtes du Viverridae de famille, était l'hôte intermédiaire du virus avant qu'il ait sauté aux êtres humains. En 2012, le MERS-CoV a également sauté aux êtres humains par des chameaux de dromadaire.

Le rôle des pangolins demeurent un mystère

Le coronavirus nouveau a secoué le monde avec son écart rapide hors de la Chine. Le 23 janvier, en raison des infections répandues dans la ville de Wuhan et ses provinces voisines, la ville a été verrouillée vers le bas. Le 27 février, les scientifiques ont dévoilé qu'un virus près de SARS-CoV-2 avait été trouvé dans le pangolin, proposant un réservoir neuf pour le virus de "bat".

Une révision neuve, cependant, a noté qu'en analysant des caractéristiques génomiques du pangolin malaisien, il y avait seulement 90 pour cent de la concordance génomique. L'étude neuve laisse entendre que les pangolins peuvent ne pas être le réservoir pour ravager universel actuel par des pays en travers du globe. Toujours, le coronavirus extrait du pangolin est apparenté à 99 pour cent dans une région spécifique de la protéine de S. Les chercheurs ont conclu que l'isolement d'un coronavirus dans le pangolin pourrait proposer qu'ils aient le potentiel d'être une foule intermédiaire du coronavirus nouveau SARS-CoV-2.

Évolution et adaptation de virus

Une autre analyse montre cela basé sur l'ordonnancement de la deuxième génération des échantillons provenant du liquide de lavage bronchoalvéolaire de neuf patients, huit de qui avait été au marché de fruits de mer de Huanan à Wuhan, où le virus a apparu la première fois. L'équipe a exécuté séquençage du génome complet et partiel pour déterminer l'histoire évolutionnaire de l'infection, laissant entendre son origine. L'analyse de la structure du virus prouve que le SARS-CoV-2 peut pouvoir gripper avec les récepteurs de l'enzyme de conversion de l'angiotensine deux chez l'homme. L'équipe a également encouragé que les études de contrat à terme, en particulier ceux concentrées sur l'évolution, adaptation, et écart du virus.

Dans un état publié sur Virological.org, une conférence en ligne et un site Web de partage des informations employé par des virologues, des spécialistes en santé publique, et des épidémiologistes, une équipe des scientifiques ont partagé la séquence de génome complet pour le virus, jetant la lumière neuve sur la façon dont le virus écarte en travers du globe.

En Italie, un des pays les plus gravement atteints de la manifestation COVID-19, le scientifique n'ont pas encore figuré à l'extérieur d'où le virus est venu pour obtenir en Lombardie. Les Italiens n'ont pas encore recensé leur patient 0, qui apporterait la réponse de savoir si la manifestation actuelle est venue de Chine ou ailleurs.

Au Brésil, cependant, l'équipe a constaté qu'un cas dans le pays ressemble attentivement à des échantillons ordonnancés en Allemagne le 28 janvier. Le génome est également différent de cela ordonnancé dans la ville de Wuhan. L'équipe également a prouvé que le virus subit une mutation lentement et relativement peu, environ une fois par mois. En étudiant le génome entier du virus d'isolement dans le deuxième patient dans le pays, ils ont constaté qu'il y a des différences entre ceux dès le début et les deuxième patients.

Le partage global des caractéristiques COVID-19 peut bientôt fournir une voie pour que les experts développent les vaccins et les tests diagnostique potentiels.

Non fabriqué par l'homme

Pendant la crête de l'épidémie en Chine, plusieurs théories ont apparu que le coronavirus peut être fabriqué par l'homme. Dans un état récent, cependant, les chercheurs ont observé l'origine de SARS-CoV-2 des analyses comparatives des caractéristiques génomiques. Ils ont constaté que le virus n'est pas un élément de laboratoire ou un virus à bon escient manipulé.