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Compreendendo o genoma novo do coronavirus

O coronavirus novo emergiu em dezembro de 2019 na cidade de Wuhan, província de Hubei, em China, e desde então, espalhou ràpida sobre a 170 países através do globo. Nosso conhecimento do vírus, agora nomeado oficialmente o coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2), está ainda nas fases iniciais. Contudo, os cientistas em todo o mundo estão competindo para compreender melhor o vírus, na esperança de derramar a luz em vacinas potenciais e em terapias.

Para responder eficazmente a uma manifestação, é crucial para peritos da saúde estudar o genoma do vírus, para fornecer uma compreensão melhor da natureza do micróbio patogénico, como afecta o corpo humano, o que ele visa, e como é transmitida. Uma compreensão completa da caracterização genomic e a epidemiologia do coronavirus novo armarão cientistas com as ferramentas para retardar completamente ou tratar SARS-CoV-2.

Micrografia de elétron nova da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de uma pilha apoptotic (verde) contaminada pesadamente com as partículas do vírus SARS-COV-2 (roxas), isoladas de uma amostra paciente. A imagem capturada e cor-aumentada no NIAID integrou a instalação de investigação no forte Detrick, Maryland. Crédito: NIAID

Micrografia de elétron nova da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de uma pilha apoptotic (verde) contaminada pesadamente com as partículas do vírus SARS-COV-2 (roxas), isoladas de uma amostra paciente. Imagem capturada e cor-aumentada na instalação de investigação integrada NIAID (IRF) no forte Detrick, Maryland. Crédito: NIAID

Dados Genomic

Em dezembro de 2019, 27 pacientes fora dos 41 povos admitidos aos hospitais devido à doença pulmonar misteriosa, passada através de um mercado molhado na cidade de Wuhan. A origem do vírus foi seguida embora ao mercado, muito o primeiro caso humano identificado não foi ao mercado frequentemente. Em lugar de, com base nas seqüências SARS-CoV-2 genomic, o primeiro caso pode ser seguido de volta ao novembro de 2019.

Em um estudo conduzido por cientistas canadenses, arranjaram em seqüência quase o genoma 30,000-base do coronavirus SARS-associado, chamado o isolado Tor2. Encontraram que o coronavirus novo, SARS-CoV-2, está associado somente moderada com outros coronaviruses conhecidos, tais como o OC43 e o 229E.  

Mais, os pesquisadores encontraram que SARS-CoV-2 pertence ao grupo de Betacoronaviruses, que são similares aos SARS-CoV desde 2002. Durante esse tempo, encontrou-se que os bastões do género Rhinolophus eram o reservatório do vírus. Igualmente revelou-se que um almíscar de palma, um carnívoro semelhante aos felinos longo-corpóreo, curto-equipado com pernas do Viverridae da família, era o anfitrião intermediário do vírus antes que saltou aos seres humanos. Em 2012, o MERS-CoV igualmente saltou aos seres humanos através dos camelos do dromedário.

O papel dos pangolins permanece um mistério

O coronavirus novo agitou o mundo com sua propagação rápida fora de China. O 23 de janeiro, devido às infecções difundidas na cidade de Wuhan e em suas províncias vizinhas, a cidade era pena fechado. O 27 de fevereiro, os cientistas revelaram que um vírus perto de SARS-CoV-2 tinha sido encontrado no pangolin, sugerindo um reservatório novo para o vírus dos bastões.

Uma revisão nova, contudo, notou que em analisar dados genomic do pangolin malaio, havia somente 90 por cento da concordância genomic. O estudo novo está sugerindo que os pangolins não podem ser o reservatório para a pandemia actual que devasta através dos países através do globo. Ainda, o coronavirus extraído do pangolin é aparentado a 99 por cento em uma região específica da proteína de S. Os pesquisadores concluíram que o isolamento de um coronavirus no pangolin pôde sugerir que tivessem o potencial ser um anfitrião intermediário do coronavirus novo SARS-CoV-2.

Evolução e adaptação do vírus

Uma outra análise mostra aquela baseada em arranjar em seqüência da próxima geração das amostras do líquido de lavage broncoalveolar de nove pacientes, oito de quem tinha sido ao mercado do marisco de Huanan em Wuhan, onde o vírus emergiu primeiramente. A equipe executou o genoma completo e parcial que arranja em seqüência para determinar a história evolucionária da infecção, sugerindo sua origem. A análise estrutural do vírus mostra que o SARS-CoV-2 pode poder ligar com os receptors deconversão da enzima dois nos seres humanos. A equipe igualmente incentivou que os estudos do futuro, particularmente aqueles centrados sobre a evolução, adaptação, e propagação do vírus.

Em um relatório publicado em Virological.org, um fórum e um Web site em linha da partilha de dados usados por virologists, por especialistas da saúde pública, e por epidemiologistas, uma equipe dos cientistas compartilharam da seqüência completa do genoma para o vírus, derramando a luz nova em como o vírus está espalhando através do globo.

Em Itália, um dos países da duro-batida da manifestação COVID-19, o cientista não figurou ainda para fora de aonde o vírus veio chegar em Lombardy. Os italianos não identificaram ainda seu paciente 0, que daria a resposta se a manifestação actual veio de China ou em outro lugar.

Em Brasil, contudo, a equipe encontrou que um caso no país se assemelha pròxima às amostras arranjadas em seqüência em Alemanha o 28 de janeiro. O genoma é igualmente diferente daquele arranjado em seqüência na cidade de Wuhan. A equipe igualmente mostrou que o vírus se transforma lentamente e relativamente pouco, aproximadamente uma vez por mês. Em cima de estudar o genoma inteiro do vírus isolado do segundo paciente no país, encontraram que há umas diferenças entre aquelas do primeiras e os segundas pacientes.

A partilha global dos dados COVID-19 pode logo fornecer uma maneira para que os peritos desenvolvam vacinas e testes de diagnóstico potenciais.

Nao sintético

Durante o pico da epidemia em China, diversas teorias emergiram que o coronavirus pode ser sintético. Em um relatório recente, contudo, os pesquisadores reviram a origem de SARS-CoV-2 das análises comparativas de dados genomic. Encontraram que o vírus não é uma construção do laboratório ou um vírus purposefully manipulado.

Sources:
Angela Betsaida B. Laguipo

Written by

Angela Betsaida B. Laguipo

Angela is a nurse by profession and a writer by heart. She graduated with honors (Cum Laude) for her Bachelor of Nursing degree at the University of Baguio, Philippines. She is currently completing her Master's Degree where she specialized in Maternal and Child Nursing and worked as a clinical instructor and educator in the School of Nursing at the University of Baguio.

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