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IRB Barcelone et Amazone joignent des forces pour développer l'outil de calcul dans le combat contre COVID-19

Il y a actuel plus de 10.000 articles scientifiques liés aux infections de coronavirus. En fait, au cours des dernières semaines, la recherche pour combattre COVID-19 a accéléré, et plus de 4.000 papiers scolaires neufs ont été publiés sur les vaccins potentiels, les traitements, et les demandes de règlement. Le traitement de ce volume d'information manuellement serait incontrôlable pour pouvoir avancer cette recherche eue un besoin urgent assez rapidement. Le laboratoire de biologie structurel de bio-informatique et de réseau d'IRB Barcelone, abouti par le chercheur Patrick Aloy d'ICREA, a joint des forces avec Amazone pour développer un outil de calcul qui accélérerait le procédé. Utilisant l'artificial intelligence, cet outil « indiqué » tous ces articles et extraire relatif à l'information tout approprié aux molécules et aux demandes de règlement étudiées.

Par un examen limité de la littérature scientifique la plus appropriée, les chercheurs à IRB Barcelone ont jusqu'ici recensé plus de 150 composé-avec différents niveaux d'expérimental preuve-que soyez potentiellement en activité contre COVID-19. L'objectif est maintenant de trouver d'autres médicaments avec des caractéristiques assimilés à ces derniers, augmentant le portefeuille des molécules d'intérêt et augmentant de ce fait les possibilités de recenser un avec l'efficacité élevée. Les résultats sont déjà procurables chez https://sbnb.irbbarcelona.org/covid19/.

De ce que nous avons besoin maintenant est pour des organismes de recherche travaillant avec les demandes de règlement COVID-19 pour introduire leurs résultats. Les molécules neuves seront comportées automatiquement une fois par jour, et la communauté scientifique entière aura ainsi des caractéristiques actualisées, qui aideront à éviter la duplication et produiront des hypothèses neuves qui aideraient à trouver la demande de règlement définitive. »

Patrick Aloy, chercheur d'ICREA

Collaboration rapide pour la découverte de médicaments

Le contrôleur chimique est un outil de calcul qui offre l'information sur 1 million de molécules avec le potentiel pharmacologique. « Le contrôleur chimique vise à traiter et coder des caractéristiques complexes sur les effets que les différents composés chimiques ont sur des organismes vivants, de sorte qu'ils puissent être comportés aux technologies neuves d'artificial intelligence, » dit Miquel Duran, chercheur du groupe d'IRB Barcelone et premier auteur de l'étude.

Dans juste au-dessus d'une semaine, du laboratoire et de l'Amazone d'Aloy ont déterminé une collaboration qui a activé pour régler avec précision cet outil de bio-informatique. « C'a été un plaisir pour que nous mettent notre capacité d'artificial intelligence au service de la découverte de médicaments contre COVID-19, » dit Hugo Saragosse, de la Science de recherche d'Amazone et de groupe d'AI. L'expérience Amazone a avec le text mining, apprentissage automatique et la compréhension de langage naturel a permis à l'analyse automatique des articles scientifiques d'être comportée au contrôleur chimique rapidement. La « collaboration avec Amazone a été principale pour obtenir cet outil en service tellement rapidement. Sans ses capacités de traitement de calculer et de textes de nuage d'AWS, il aurait été impossible, » dit Aloy.

IRB Barcelone commise à la recherche dans COVID-19

Le laboratoire de biologie structurel de bio-informatique et de réseau participe également au projet européen RiPCoN, consacré à l'identification des protéines humaines que le virus emploie pour son extension. Ce projet recherche à recenser les médicaments (déjà sur le marché ou dans les tests cliniques) qui peuvent moduler l'activité du virus et arrêter sa réplication.

IRB Barcelone travaille également sur d'autres projets liés à COVID-19. On est consacré au développement des tests diagnostique rapides et simples pour trouver le virus, alors que des autres orientations sur le développement d'une demande de règlement de pulvérisateur pour COVID-19. Un autre projet porte sur réduire le taux de mortalité de COVID-19 en trouvant une demande de règlement pour le syndrome de détresse respiratoire aigu, la cause du décès principale par ce virus.