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IRB Barcelona e Amazonas juntam-se a forças para desenvolver a ferramenta computacional na luta contra COVID-19

Há actualmente mais de 10.000 artigos científicos relativos às infecções do coronavirus. De facto, nas últimas semanas, a pesquisa para combater COVID-19 acelerou, e mais de 4.000 papéis académicos novos foram publicados em vacinas potenciais, em terapias, e em tratamentos. Processar este volume de informação manualmente seria incontrolável poder avançar esta pesquisa urgente necessário rapidamente bastante. O laboratório de biologia estrutural da bioinformática e da rede de IRB Barcelona, conduzido pelo pesquisador Patrick Aloy de ICREA, juntou-se a forças com Amazonas para desenvolver uma ferramenta computacional que acelerasse o processo. Usando a inteligência artificial, esta ferramenta “lido” todos estes artigos e para extrair relativo à informação toda relevante às moléculas e aos tratamentos estudados.

Com uma revisão limitada da literatura científica a mais relevante, os pesquisadores em IRB Barcelona têm identificado até agora mais de 150 composto-com níveis diferentes de experimental evidência-que seja potencial activo contra COVID-19. O objetivo é agora encontrar outras drogas com características similares a estes, desse modo expandindo a carteira das moléculas do interesse e aumentando as possibilidades de identificar um com eficácia alta. Os resultados estão já disponíveis em https://sbnb.irbbarcelona.org/covid19/.

O que nós precisamos agora é para os grupos de investigação que trabalham com tratamentos COVID-19 para introduzir seus resultados. As moléculas novas serão incorporadas automaticamente uma vez por dia, e assim a comunidade científica inteira terá os dados actualizados, que ajudarão a evitar a duplicação e gerarão as hipóteses novas que ajudariam a encontrar o tratamento definitivo.”

Patrick Aloy, pesquisador de ICREA

Colaboração rápida para a descoberta da droga

O verificador químico é uma ferramenta computacional que ofereça a informação em 1 milhão moléculas com potencial farmacológico. “O verificador químico aponta processar e para codificar dados complexos nos efeitos que os compostos químicos diferentes têm em organismos vivos, de modo que possam ser incorporados em tecnologias de inteligência artificial novas,” diz Miquel Duran, pesquisador do grupo de IRB Barcelona e primeiro autor do estudo.

Em apenas sobre uma semana, o laboratório e as Amazonas de Aloy estabeleceram uma colaboração que permitisse de ajustar esta ferramenta da bioinformática. “Foi um prazer para que nós ponham nossa capacidade da inteligência artificial ao serviço da descoberta da droga contra COVID-19,” diz Hugo Zaragoza, da ciência da busca das Amazonas e do grupo do AI. As Amazonas da experiência têm com texto-mineração, aprendizagem de máquina e a compreensão de linguagem natural permitiu que a análise automática de artigos científicos seja incorporada no verificador químico rapidamente. A “colaboração com Amazonas foi chave obter tão rapidamente esta ferramenta em serviço. Sem suas capacidades da computação e de processamento de texto da nuvem de AWS, seria impossível,” diz Aloy.

IRB Barcelona comprometida à pesquisa em COVID-19

O laboratório de biologia estrutural da bioinformática e da rede igualmente está participando no projecto europeu RiPCoN, devotado à identificação das proteínas humanas que o vírus usa para sua expansão. Este projecto procura identificar as drogas (já no mercado ou nos ensaios clínicos) que podem modular a actividade do vírus e parar sua réplica.

IRB Barcelona igualmente está trabalhando em outros projectos relativos a COVID-19. Se for devotado à revelação de um teste de diagnóstico rápido e simples detectar o vírus, quando uns outros focos na revelação de um tratamento do pulverizador para COVID-19. Um outro projecto centra-se em reduzir a taxa de mortalidade de COVID-19 encontrando um tratamento para a síndrome de aflição respiratória aguda, a causa de morte principal por este vírus.