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IRB Barcelona y el Amazonas ensamblan fuerzas para desarrollar la herramienta de cómputo en el combate contra COVID-19

Hay actualmente más de 10.000 artículos científicos relacionados con las infecciones del coronavirus. De hecho, en las últimas semanas, la investigación para combate COVID-19 ha acelerado, y más de 4.000 nuevos papeles académicos se han publicado en vacunas potenciales, terapias, y tratamientos. El tramitación de este volumen de información estaría manualmente inmanejable poder avance esta investigación urgente necesaria rápidamente bastante. El laboratorio de biología estructural de la bioinformática y de la red de IRB Barcelona, llevado por el investigador Patrick Aloy de ICREA, ha ensamblado fuerzas con el Amazonas para desarrollar una herramienta de cómputo que aceleraría el proceso. Usando la inteligencia artificial, esta herramienta “leído” todos estos artículos y extraer relacionado con la información todo relevante a las moléculas y a los tratamientos estudiados.

Con una revista limitada de la literatura científica más relevante, los investigadores en IRB Barcelona han determinado hasta ahora más de 150 composición-con diversos niveles de experimental prueba-que sea potencialmente activo contra COVID-19. El objetivo ahora es encontrar otras drogas con características similares a éstos, de tal modo desplegando la cartera de moléculas del interés y aumentando las posibilidades de determinar uno con alta eficacia. Los resultados están ya disponibles en https://sbnb.irbbarcelona.org/covid19/.

Qué ahora necesitamos está para los grupos de investigación que trabajan con los tratamientos COVID-19 para introducir sus resultados. Las nuevas moléculas serán incorporadas automáticamente una vez al día, y la comunidad científica entera habrá puesto al día así los datos, que ayudarán a evitar la duplicación y generarán las nuevas hipótesis que ayudarían a encontrar el tratamiento definitivo.”

Patrick Aloy, investigador de ICREA

Colaboración rápida para el descubrimiento de la droga

El verificador químico es una herramienta de cómputo que ofrece la información sobre 1 millón de moléculas con potencial farmacológico. “El verificador químico apunta tramitar y codificar datos complejos sobre los efectos que diversas composiciones químicas tienen en organismos vivos, para poderlas incorporar en nuevas tecnologías de inteligencia artificial,” dice Miquel Duran, investigador del grupo de IRB Barcelona y primer autor del estudio.

En apenas sobre una semana, el laboratorio y el Amazonas de Aloy han establecido una colaboración que ha habilitado ajustar esta herramienta de la bioinformática. “Ha sido un placer para que pongamos nuestra capacidad de la inteligencia artificial al servicio de descubrimiento de la droga contra COVID-19,” dice a Hugo Zaragoza, de la ciencia de la búsqueda del Amazonas y del grupo del AI. La experiencia el Amazonas tiene con la texto-explotación minera, aprendizaje de máquina y la comprensión de lenguaje natural ha permitido que el análisis automático de artículos científicos sea incorporado en el verificador químico rápidamente. La “colaboración con el Amazonas ha sido dominante conseguir esta herramienta en servicio tan rápidamente. Sin sus capacidades el calcular de la nube de AWS y de tramitación de texto, habría sido imposible,” dice Aloy.

IRB Barcelona comprometida a la investigación en COVID-19

El laboratorio de biología estructural de la bioinformática y de la red también está participando en el proyecto europeo RiPCoN, dedicado a la identificación de las proteínas humanas que el virus utiliza para su extensión. Este proyecto intenta determinar las drogas (ya en el mercado o en juicios clínicas) que pueden modular la actividad del virus y parar su réplica.

IRB Barcelona también está trabajando en otros proyectos relacionados con COVID-19. Uno se dedica al revelado de una prueba diagnóstica rápida y simple descubrir el virus, mientras que otros focos en el revelado de un tratamiento del aerosol para COVID-19. Otro proyecto centra en reducir la tasa de mortalidad de COVID-19 encontrando un tratamiento para el síndrome de señal de socorro respiratoria agudo, la causa de la muerte principal por este virus.