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L'étude met en valeur une voie neuve de recenser des gènes de résistance aux antibiotiques

Les singes dans des zoos des États-Unis hébergent les communautés bactériennes dans leurs tubes intestinaux qui sont plus assimilés à ceux des gens qui mangent un régime non-occidental qu'au renivellement d'intestin de leurs cousins sauvages de singe, selon une étude neuve d'université de Washington à St Louis.

De plus, même les singes sauvages qui n'ont jamais rencontré des antibiotiques hébergent des microbes avec des gènes de résistance aux antibiotiques.

Les découvertes proposent que le contact avec des gens forme les communautés microbiennes d'intestin, ou des microbiomes, des gorilles et des chimpanzés, et que les microbiomes d'intestin des singes sauvages fournissent des indices aux interactions de humain-singe qui pourraient aviser des efforts pour protéger l'espèce menacée.

L'étude met en valeur également une voie de recenser les gènes de résistance aux antibiotiques neufs avant qu'ils deviennent largement déterminés dans les bactéries et les gens, donnant à des chercheurs l'heure de développer des outils pour contrer de tels gènes avant qu'ils menacent la santé des personnes.

L'étude est accessible en ligne dans le tourillon d'ISME.

Le microbiome d'intestin nous fournit des vitamines, nourriture de résumé d'aides, règle l'inflammation et maintient des microbes de pathogène dans la vérification. Les antibiotiques peuvent changer le renivellement du microbiome d'intestin des voies durables.

« Il est difficile de figurer à l'extérieur exact comment les antibiotiques affectent le microbiome humain d'intestin quand presque chacun est né avec les parasites qui ont déjà des gènes de résistance aux antibiotiques, » a dit l'auteur Gautam supérieur Dantas, PhD, un professeur de pathologie et d'immunologie, de la microbiologie moléculaire, et de génie biomédical à l'École de Médecine d'université de Washington. « Les singes sauvages sont la chose la plus proche que nous devons des êtres humains de pré-antibiotiques. Heureusement, nous avons obtenu l'opportunité de fonctionner avec deux primatologists fortement respectés. »

Les co-auteurs Crickette Sanz, PhD, un professeur agrégé de l'anthropologie biologique dans les arts et les sciences à l'université de Washington, et David Morgan, PhD, un chargé de recherches chez le Lester E. Fisher Center pour l'étude et la conservation des singes au zoo de Lincoln Park Chicago et un scientifique honorifique de recherches à l'université de Washington, étudient les chimpanzés et les gorilles sauvages dans une contrée lointaine de stationnement national de Nouabalé-Ndoki en République du Congo.

Le stationnement est managé par la société de conservation de faune et le gouvernement congolais. Pour se renseigner sur les microbiomes de l'intestin des singes, Sanz, Morgan et leurs équipes d'inducteur ont suivi des singes dans les groupes connus et ont discrètement rassemblé les échantillons fécaux de 18 chimpanzés sauvages et de 28 gorilles sauvages.

La méthode de prélèvement non envahissante a permis aux chercheurs de rassembler des caractéristiques sur les singes sans leur toucher.

Les échantillons ont été enregistrés en azote liquide, transportés aux sièges sociaux de stationnement, et transportés en canoë de pirogue en bas de la rivière de Sangha et puis par camion vers Brazzaville, la capitale de la République du Congo, où ils ont été retenus dans un congélateur jusqu'à ce qu'ils pourraient être expédiés au laboratoire de Dantas.

Les chercheurs ont également rassemblé et ont expédié les échantillons fécaux provenant de 81 personnes qui ont vécu sur les périphéries du stationnement.

En attendant, Dantas et premier l'auteur Tayte Campbell, PhD - puis un étudiant de troisième cycle dans le laboratoire de Dantas - se sont chargés d'obtenir les échantillons fécaux provenant de 18 chimpanzés et de 15 gorilles vivant au zoo de Saint Louis ou au zoo de Lincoln Park.

Les chercheurs ont recensé les genres de bactéries et de gènes antibiotiques actuels dans les échantillons de gorille, de chimpanzé et d'être humain, et comparé les données disponibles de résultats publiquement - sur les gens qui habitent aux États-Unis, le Pérou, le Salvador, le Malawi, la Tanzanie, ou le Venezuela et suivent le chasseur-cueilleur, l'agronome rural, ou les modes de vie urbains.

Les microbiomes d'intestin des gens dont la caractéristique a été comprise dans l'étude sont tombés dans deux groupes. Dans un il y avait les chasseurs-cueilleur et les agronomes ruraux qui mangent type un régime lourd dans les légumes et la lumière en viande et graisse ; ce groupe a inclus les gens des périphéries du stationnement national en République du Congo.

Dans le deuxième groupe il y avait les gens urbains qui mangent un régime occidental riche en viande. Les gorilles et les chimpanzés sauvages ont constitué un troisième groupe distinct des deux groupes humains. Mais les singes captives sont tombées dans le premier groupe ; elles étaient les plus assimilées aux gens qui ont mangé des régimes non-occidentaux.

Des « chimpanzés sont mis en danger, et des gorilles de plaine occidentale sont en critique mis en danger ; leurs dangers principaux sont destruction d'habitat, pocher et la maladie, » Sanz a dit. La « mesure du microbiome d'intestin pourrait être une voie de surveiller l'exposition des singes aux dangers anthropogènes ainsi nous pouvons recenser des sujets de préoccupation et développer des stratégies efficaces et probantes d'atténuation. »

Les chercheurs ont également recensé plusieurs gènes de résistance aux antibiotiques précédemment inconnus dans les singes et les gens sauvages de République du Congo, y compris une qui s'entretient résistance au colistin, un antibiotique de dernier recours. Pour l'instant, les gènes demeurent dans les bactéries inoffensives aux êtres humains.

Mais les bactéries ont la capacité de partager des gènes, ainsi n'importe quel gène de résistance aux antibiotiques pourrait réussir à pénétrer son une substance plus dangereuse des bactéries.

« Les opportunités rares d'échantillonnage des singes sauvages comme dans cette étude nous donne un regard dans le contrat à terme, » Campbell a dit. « Quand nous trouvons ces gènes de résistance aux antibiotiques nouveaux dans l'environnement, nous pouvons les étudier et probablement trouver des moyens de les empêcher avant qu'ils apparaissent dans les virus humains et rendent des infections très difficiles à traiter. »

« Il serait très intéressant d'augmenter cette recherche en travers d'un choix plus large de contextes de conservation, tels que des zones de enregistrement commerciales et des fonctionnements de touriste, » Morgan a ajouté.

« Avec l'arrivée des activités humaines et des bruits anthropogènes associés, des singes sauvages peuvent être exposées aux gènes de résistance aux antibiotiques. Nous ne connaissons pas beaucoup au sujet de la façon dont la résistance aux antibiotiques écarte par les environnements naturels, de sorte qu'ait pu avoir des implications pour la santé publique humaine que nous ne comprenons pas encore. C'est quelque chose que nous voudrions vérifier. »

Source:
Journal reference:

Campbell, T. P. et al. (2020) The microbiome and resistome of chimpanzees, gorillas, and humans across host lifestyle and geography. The ISME Journal. doi.org/10.1038/s41396-020-0634-2.