Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

El mapa más grande de la conexión de la proteína del mundo revela funcionamientos de la célula

El cuerpo humano se comprende de mil millones de células. Con todo funciona y crece como único organismo, debido a trillones de las acciones recíprocas que ayudan a las diversas células para reconocer y para responder el uno al otro vía diversas moléculas en su superficie o interior las células. Ahora, un nuevo estudio publicado en la naturaleza del gorrón describe en abril de 2020 el primer mapa del interactome, para ayudar a distinguir acciones recíprocas sanas y enfermedad-producir unos.

¿Cuál es el interactome?

El genoma humano consiste en todos los genes que funcionan en un ser humano, normal y anormal. Estos genes se transcriben en el ARN de mensajero (mRNA), que lleva las instrucciones genéticas para la síntesis de la proteína a la célula. La suma de todo el mRNA en la célula se llama el transcriptome. El ARN transcrito es responsable de síntesis de la proteína, y la suma de toda la proteína traducida del genoma se llama el proteome.

Sin embargo, las proteínas obran recíprocamente con uno a para hacer la función de la carrocería, si en salud o enfermedad. El proyecto del genoma humano ha ofrecido un filete de piezas, por así decirlo, para la célula, pero no ha explicado cómo estas piezas ajustadas en la ecuación entera.

Éste es el estímulo detrás del proyecto actual - crear un mapa de la referencia de todas las maneras que las proteínas actúan en uno a para construir y para operar la carrocería. Éste es el interactome.

Dice al investigador Marc Vidal, “desde mediados de 1990 s, nuestras personas colaborativas ha activado la idea que los mapas del interactome pueden iluminar aspectos fundamentales de la vida.” El papel actual puso el primer mapa del interactome en el suelo el cual la gente puede emplear, agregando en la información a medida que venga hacia adentro. Es decir el mapa, según lo descrito, es el andamio en el cual los nuevos datos pueden ser agregados.

Trazando en parejas acciones recíprocas entre 17.500 proteínas humanas, los científicos han creado un mapa, a la izquierda, representando que las proteínas trabajan juntas para sostener la función celular. Las proteínas con perfiles similares de las acciones recíprocas caen en los atados color-cifrados discretos que representan diversos bioprocedimientos en la célula. Haber de imagen: Y otros/Shutterstock de la suerte de Katja
Trazando en parejas acciones recíprocas entre 17.500 proteínas humanas, los científicos han creado un mapa, a la izquierda, representando que las proteínas trabajan juntas para sostener la función celular. Las proteínas con perfiles similares de las acciones recíprocas caen en los atados color-cifrados discretos que representan diversos bioprocedimientos en la célula. Haber de imagen: Y otros/Shutterstock de la suerte de Katja

¿Cómo construyeron el interactome?

El mapa detallado ha tardado casi diez años para completar, y es la fruta de los trabajos devotos de personas grandes, comprendiendo sobre 80 investigadores de varios países diferentes. Éstos incluyen Bélgica, España, Francia, e Israel además de los E.E.U.U. y del Canadá. Llamó el mapa humano de Interactome de la referencia (HuRI), él detalla casi 52.570 maneras de las cuales 8.275 proteínas humanas obran recíprocamente con uno a. Esto le hace el más extenso tal mapa.

Algunos de los investigadores en las personas actuales habían hecho ya la parte del trabajo, representando cerca de 14.000 acciones recíprocas entre diversas proteínas. El proyecto actual tomó este delantero, examinando la manera casi todas las proteínas que fueron codificadas por los genes humanos interactivos. Esto ha hecho el mapa por lo menos cuatro veces tan completas.

Primero estimularon la expresión simultánea de ambos genes, codificando un par de proteínas humanas dentro de una célula de levadura. Tales pares fueron creados para expresar las acciones recíprocas entre casi cada proteína humana si ocurrió. Cada tal acción recíproca da lugar a un interruptor molecular que aumente el incremento de la célula. Así, el incremento de la célula de levadura hizo señales la presencia de una acción recíproca.

Usando esto como base, los investigadores observaban todas las combinaciones posibles de pares entre 17.500 proteínas humanas, buscando acciones recíprocas entre las proteínas en cada par. Probaron para las acciones recíprocas en 3 versiones distintas de una célula de levadura, y cada prueba fue relanzada tres veces simultáneamente. Esto asciende a probar 3 mil millones acciones recíprocas posibles, en todos.

En el extremo, fueron dejadas con cerca de 53.000 acciones recíprocas binarias en medio sobre 8.000 proteínas. La mayor parte de éstas eran acciones recíprocas nuevas. Todos entonces fueron validados usando otro análisis.

¿Por qué es el interactome importante?

El interactome ofrece un marco para entender cómo obran recíprocamente las moléculas de proteína, causando un alcance de enfermedades tales como cáncer, enfermedades virales, y otras condiciones. La disponibilidad de las ayudas básicas de este marco revela las maneras fundamentales de las cuales la estructura o la función anormal del gen rompe la función normal de la célula para producir las características clínicas de la enfermedad. Por ejemplo, podría ayudar a científicos a entender cómo el virus SARS-CoV-2 (que es el agente del pandémico actual COVID-19) obra recíprocamente con las proteínas de las células huesped para producir las manifestaciones de la enfermedad.

Las ventajas de esta aproximación están, según el investigador Mike Calderwood, “secuencia del genoma pueden determinar las variantes llevado por un individuo que las hacen susceptibles a la enfermedad, pero no revela cómo se causa la enfermedad. Los cambios en las acciones recíprocas de una proteína son un mecanismo posible de enfermedad, y este mapa ofrece un punto de partida para estudiar el impacto de variantes enfermedad-asociadas en acciones recíprocas de la proteína-proteína.”

Hay en conjunto cerca de 20.000 genes que cifran para las proteínas, pero poco está sin obstrucción a partir ahora alrededor de las proteínas que codifican. Sin embargo, los científicos están utilizando “culpabilidad por un principio de la asociación”, en el cual consideran que dos proteínas son probables participar en procesos biológicos similares si obran recíprocamente con las proteínas similares. Así, incluso la función de una proteína desconocida se puede predecir usando el mapa del interactome.

Otro investigador, Frederick P. Roth, dice chistoso, la “gente puede observar hacia arriba su proteína preferida y conseguir pistas sobre su función de las proteínas que obra recíprocamente con.”

Las limitaciones

El HuRI es el interactome más completo hoy, pero todavía representa el solamente cerca de 2% al 11% de todas las acciones recíprocas entre las proteínas humanas. La razón por la que faltan a la mayoría de acciones recíprocas está debido a la falta de moléculas específicas que sean esenciales para la función apropiada de la proteína y se encuentren solamente en células humanas.

Sin embargo, HuRI ha multiplicado el conocimiento en acciones recíprocas de la proteína-proteína en las células humanas triples o más. Esto le hace una fuente inestimable de conocimiento en esta área.

De hecho, los científicos están encontrando que incluso las proteínas familiares se están encontrando para tener nuevos papeles dentro de la célula, y están descubriendo los cambios del molecular-nivel que llevan a la enfermedad. De esta manera, HuRI ha sido fructuoso en la destapadura hasta ahora de las funciones desconocidas para las proteínas que participan en apoptosis o muerte celular programada, la baja del cargamento de la célula, y muchos otros procesos de la célula.

Semejantemente, las personas de investigadores han tentativa enlazar los datos sobre las diversas acciones recíprocas que ocurren entre las proteínas a la expresión variable de genes en cada clase de tejido. Esto les ha ayudado a encontrar el arsenal de las proteínas que obraban recíprocamente que son esenciales en el revelado y el mantenimiento de diversos tejidos. También les ha ayudado para determinar los objetivos nuevos para el tratamiento de un alcance de las condiciones diversas de la enfermedad causadas por factores genéticos. Éstos podían incluir varios tipos de cánceres, así como ciertas condiciones infecciosas.

En inmóvil otra dirección, compararon las acciones recíprocas entre las diversas proteínas encontradas en células bajo estudio con ésas encontradas en el mapa de la referencia, para descubrir cómo las proteínas anormales encontradas en diversas enfermedades accionaron acciones recíprocas anormales, a su vez. Esto apareció las cosas que salían mal para causar esa condición específica en un nivel molecular.

El portal en línea, en el sitio que publicaba en línea de fuente abierta BioRxiv, ha tenido ya 15.000 visitas desde su inicio en abril de 2019. Los investigadores dicen que muchos utilizadores han transferido ya el grupo de datos directamente entero. Como el papel anterior, revistiendo menos que un tercero de HuRI, que no obstante se ha citado más de 800 veces, cuentan con un uso mucho más pesado de sus datos en el futuro.

Journal reference:

Luck, K., Kim, D., Lambourne, L. et al. A reference map of the human binary protein interactome. Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2188-x

Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Thomas, Liji. (2020, April 08). El mapa más grande de la conexión de la proteína del mundo revela funcionamientos de la célula. News-Medical. Retrieved on October 29, 2020 from https://www.news-medical.net/news/20200408/Worlds-largest-protein-connection-map-reveals-cell-workings.aspx.

  • MLA

    Thomas, Liji. "El mapa más grande de la conexión de la proteína del mundo revela funcionamientos de la célula". News-Medical. 29 October 2020. <https://www.news-medical.net/news/20200408/Worlds-largest-protein-connection-map-reveals-cell-workings.aspx>.

  • Chicago

    Thomas, Liji. "El mapa más grande de la conexión de la proteína del mundo revela funcionamientos de la célula". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20200408/Worlds-largest-protein-connection-map-reveals-cell-workings.aspx. (accessed October 29, 2020).

  • Harvard

    Thomas, Liji. 2020. El mapa más grande de la conexión de la proteína del mundo revela funcionamientos de la célula. News-Medical, viewed 29 October 2020, https://www.news-medical.net/news/20200408/Worlds-largest-protein-connection-map-reveals-cell-workings.aspx.