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A base de dados nova de 14.000 macrolactones conhecidos podia apoiar a descoberta e a pesquisa da droga

Os pesquisadores da universidade estadual de North Carolina e dos fármacos das colaborações criaram uma base de dados do livre-à-uso de 14.000 macrolactones conhecidos - grandes moléculas usadas na revelação da droga - que contem a informação sobre as características moleculars, a diversidade química e as actividades biológicas desta classe estrutural.

A base de dados, chamada MacrolactoneDB, enche uma diferença do conhecimento a respeito destas moléculas e poderia servir como uma ferramenta útil para a descoberta futura da droga.

Macrolactones é moléculas com pelo menos os 12 átomos que compor sua estrutura em forma de anel. Entre muitas características úteis, a capacidade dos macrolactones para ligar aos alvos difíceis da proteína fá-los apropriados para as drogas do antiviral, do antibiótico, as antifungosas e as antiparasitárias. Contudo, seus tamanho e estrutura complicada fazem-nos difíceis sintetizar.

“Macrolactones é moléculas titânicas - seus desafios dos presentes do tamanho aos pesquisadores que podem querer trabalhar com eles,” diz Sean Ekins, CEO de fármacos das colaborações, de membro do instituto comparativo da medicina do estado do NC, de empresário na residência na escola do Eshelman do monte da UNC-Capela da farmácia e do autor correspondente da pesquisa. “Nós quisemos endereçar essa edição criando a base de dados disponível da publicamente - destas moléculas e de suas propriedades.”

O NC indica que o aluno diplomado e o primeiro autor do papel Phyo Phyo Zin minaram 13 bases de dados públicas 14.000 macrolactones conhecidos, compilando os em MacrolactoneDB. Somente 20% dos compostos que do macrolactone curated teve os dados biológicos associados com eles.

Zin, Ekins, e do estado do NC professor adjunto da química Gavin Williams conduziram análises do cheminformatics das propriedades moleculars dos macrolactones e desenvolveram 91 descritores para caracterizar melhor as moléculas.

Os pesquisadores olharam então três alvos do interesse para alguns dos macrolactones - especificamente malária, hepatite C e pilhas de T - e usado máquina-aprendendo técnicas compreender o relacionamento da estrutura-actividade entre os macrolactones e estes alvos.

Nós sabemos que as drogas do macrolactone são eficazes, mas há muito nós não sabe sobre o que faz bom. É por isso nós expor para fazer esta pesquisa. Nós encontramos que é possível utilizar a aprendizagem de máquina com estas moléculas, e melhorar nossas análise e descrição dos macrolactones melhorará os modelos da previsão que vão para a frente.”

Professor do ssociate de Gavin Williamsm da química, universidade estadual de North Carolina

“Qualquer um interessado nestas moléculas ou na revelação da droga que utiliza macrolactones tem agora uma base de dados de fácil utilização onde tudo seja acessível e em um lugar,” Ekins diz. Os “pesquisadores podem fazer perguntas sobre o que faz uma molécula particular do macrolactone bem-serida para uma aplicação biológica particular.

“Esperançosamente MacrolactoneDB ajudar-nos-á a compreender esta classe diversa de moléculas, e move-se para a frente em criar novos.”

Source:
Journal reference:

Zin, P. P. K., et al. (2020) Cheminformatics Analysis and Modeling with MacrolactoneDB. Scientific Reports. doi.org/10.1038/s41598-020-63192-4.