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La nueva base de datos de 14.000 macrolactones sabidos podía soportar descubrimiento y la investigación de la droga

Los investigadores de la universidad de estado de Carolina del Norte y los productos farmacéuticos de las colaboraciones han creado una base de datos del libre-a-uso de 14.000 macrolactones sabidos - moléculas grandes usadas en el revelado de la droga - que contiene la información sobre las características moleculares, la diversidad química y las actividades biológicas de esta clase estructural.

La base de datos, llamada MacrolactoneDB, llena un entrehierro del conocimiento referente a estas moléculas y podría servir como herramienta útil para el descubrimiento futuro de la droga.

Macrolactones es moléculas con por lo menos componer de 12 átomos su anillo-como la estructura. Entre muchas características útiles, la capacidad de los macrolactones de atar a los objetivos difíciles de la proteína los hace convenientes para las drogas antivirus, antibióticos, antihongos y antiparásitos. Sin embargo, su talla y estructura complicada las hacen difíciles sintetizar.

“Macrolactones es moléculas titánicas - sus retos de los presentes de la talla a los investigadores que pueden querer trabajar con ellos,” dice a Sean Ekins, CEO de los productos farmacéuticos de las colaboraciones, de la pieza del instituto comparativo del remedio del estado del NC, del empresario en residencia en la escuela de Eshelman de la colina de la UNC-Capilla de la farmacia y del autor correspondiente de la investigación. “Quisimos abordar esa entrega creando la base de datos disponible de a público - de estas moléculas y de sus propiedades.”

El NC declara que el estudiante de tercer ciclo y el primer autor del papel Phyo Phyo Zin minaron 13 bases de datos públicas para 14.000 macrolactones sabidos, compilándolos en MacrolactoneDB. El solamente 20% de las composiciones del macrolactone que ella curated tenían datos biológicos asociados a ellos.

Zin, Ekins, y profesor adjunto del estado del NC de la química Gavin Williams conducto los análisis del cheminformatics de las propiedades moleculares de los macrolactones y desarrollaron 91 descriptores para caracterizar mejor las moléculas.

Los investigadores entonces observaban tres objetivos de interés para algunos de los macrolactones - específicamente malaria, hepatitis C y células de T - y utilizado máquina-aprendiendo técnicas para entender el lazo de la estructura-actividad entre los macrolactones y estos objetivos.

Sabemos que las drogas del macrolactone son efectivas, pero hay mucho nosotros no sabe sobre qué hace buen. Por eso nos establecimos para hacer esta investigación. Encontramos que es posible utilizar el aprendizaje de máquina con estas moléculas, y perfeccionar nuestro análisis y descripción de macrolactones perfeccionará los modelos de la predicción que van adelante.”

Profesor de la química, universidad del ssociate de Gavin Williamsm de estado de Carolina del Norte

“Cualquier persona interesada en estas moléculas o en el revelado de la droga que utiliza macrolactones ahora tiene una base de datos convivial donde está accesible todo y en una situación,” Ekins dice. Los “investigadores pueden hacer preguntas acerca de qué hace una molécula determinada del macrolactone bien adaptada para un uso biológico determinado.

“Esperanzadamente MacrolactoneDB nos ayudará a entender esta clase diversa de moléculas, y se mueve adelante en crear nuevos.”

Source:
Journal reference:

Zin, P. P. K., et al. (2020) Cheminformatics Analysis and Modeling with MacrolactoneDB. Scientific Reports. doi.org/10.1038/s41598-020-63192-4.