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Os colaboradores internacionais propor um esquema novo da classificação classificar SARS-CoV-2

Em novembro de 2019--provavelmente, mesmo mais cedo--uma entidade minúscula que mede apenas alguns cem billionths de um medidor no diâmetro começou a rasgar em uma escala global a sociedade humana separada.

Dentro de alguns meses, o explorador implacável conhecido como SARS-CoV-2 tinha feito sua maneira a cada canto povoado da terra, deixando cientistas e autoridades de saúde com perguntas demais e poucas respostas.

Hoje, os pesquisadores scrambling para compreender onde e como o coronavirus novo elevarou, que características esclarecem a constelação de confusão de sintomas pode causar e como o incêndio violento da transmissão pode ser trazido sob o controle.

Uma parte importante desta procura envolverá esforços para classificar correctamente este micróbio patogénico humano emergente e para compreender como se relaciona a outros vírus que nós podemos conhecer mais aproximadamente.

Em consenso indicação, Arvind Varsani, um virologist molecular com centro do Biodesign de ASU para Microbiomics fundamental e aplicado e um anfitrião de colaboradores internacionais propor um sistema de classificação novo, capaz de situar coronaviruses como SARS-CoV-2 dentro da Web enorme dos vírus através do planeta, conhecida como o virosphere.

A fim categorizar adequadamente esta diversidade viral surpreendente, o grupo propor um esquema de classificação 15 florescente e descreve como três micróbios patogénicos humanos--coronavirus da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS CoV), vírus de Ebola, e vírus de palavra simples de herpes 1, ajuste na estrutura nova.

Varsani é juntado por outros membros executivos eleitos do comitê internacional na taxonomia dos vírus (ICTV), uma organização do todo-voluntário de virologists principais de todo o mundo, dedicada a projetar uma nomenclatura praticável para definir a espécie viral.

Dentro do ICTV, aproximadamente 100 grupos de trabalho distintos compor dos especialistas dentro de todas as famílias virais principais trabalham para trazer o pedido ao skein tangled dos elementos no virosphere.

A indicação do consenso aparece na edição em linha avançada da microbiologia da natureza do jornal.

Um armário dos vírus

O esquema novo da classificação, uma elaboração do sistema de classificação binário mais adiantado concebeu pelo grande taxonomist do século XVIII Carl Linnaeus, procura incorporar a série completa da divergência genética no virosphere.

Como uma situação de teste, a indicação do consenso mostra como três micróbios patogénicos humanos podem ordenadamente ser incorporados no sistema novo. A nível de reino, o mais baixos e o mais inclusivos na taxonomia nova, em dois vírus do RNA, em vírus de Ebola (EBOV) e em coronavirus da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV) são agrupados como o “riboviria”, quando a palavra simples de herpes 1, um vírus dobro-encalhado do ADN, não pertencer ao riboviria do reino mas é classificada por cinco graus tradicionais.

Planejar uma taxonomia viral inclusiva é da grande importância prática. Pode jogar um papel vital em detectar e em identificar os agentes responsáveis para epidemias emergentes nos seres humanos, nos rebanhos animais ou nas plantas. Estabelecer um estado taxonomic dos vírus permite uma comunicação clara e inequívoca entre virologists e a comunidade científica mais larga.

Com estudos metagenomic virais (que envolvem arranjar em seqüência o material genético recuperado directamente do ambiente), nós estamos descobrindo grandes quantidades de vírus que nós não podemos realmente pôr em nenhum pedido particular.

Nós fomos encarregados com tentativa vir acima com uma estrutura taxonomic melhor. “O esquema novo confia na parte na conservação das proteínas virais chaves e outras propriedades encontraram entre vírus taxonomically-relacionados para uns graus mais altos.”

Arvind Varsani, Virologist molecular, centro de Biodesign para Microbiomics fundamental e aplicado, ASU

O vírus que causa a manifestação actual de doença do coronavirus, por exemplo, tem sido nomeado recentemente da “o coronavirus 2" Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2), após o ICTV Coronaviridae o grupo de estudo que determinou o vírus pertence à espécie existente, coronavirus síndrome-relacionado respiratório agudo severo,” baseado na parte nas proteínas conservadas envolvidas na réplica SARS-CoV-2 viral. (Umas classificações mais adiantadas dos coronaviruses foram baseadas pela maior parte em estudos da reactividade serological com proteínas virais do ponto, que dão a coronaviruses sua característica mace-como a aparência.)

Visualizando o virosphere

Mesmo para cientistas usou-se ao tratamento em números extremos da mente-bendingly, o virosphere é quase unfathomably vasto. Calculou-se que 100 vírus poderiam ser atribuídos ao cada protagonizam no universo inteiro sem esgotar a fonte do mundo, calculada em 1 nonillion (ou em 1 seguido por 30 zero).

“Uma coisa importante sobre todas estas estruturas para a taxonomia viral é que são dinâmicos. Porque nós descobrimos mais vírus, as coisas terão que deslocar,” Varsani diz.

“E a mesma coisa aconteceu no reino floral, onde os povos classificaram uma vez as plantas baseadas nas pétalas, nas folhas e em outras características morfológicas. E logo, como a informação genética entrou, contradisse a classificação prévia que os povos tiveram.

“Estas edições são comuns através da classificação da planta, do animal, a fungosa e a bacteriana e tomarão certamente muito convencimento aos proponentes iniciais dessa taxonomia. Talvez um exemplo bruto é a classificação erróneo de uma planta como uma margarida na família do Asteraceae, mas de facto é uma planta que esteja imitando uma margarida, porque quer um polinizador particular e não é genetically parte do Asteraceae.”

Mas a extensão e a diversidade genética do virome são apenas o começo dos desafios que enfrentam os pesquisadores que tentam desenvolver uma taxonomia detalhada--uma taxonomia mega--do mundo viral. As linhagens virais, por exemplo, são excepcionalmente complicadas amolar para fora.

Ao contrário de toda a vida celular na terra, os vírus adquirem seu material genomic de muitas fontes, uma propriedade conhecida como polyphylogeny. Os fenômenos que incluem transferência horizontal de elementos genéticos permitem que os vírus troquem livremente os elementos de sua identidade, deixando pesquisadores sem uma linha de descida clara.

Mais, as taxas virais da mutação são muito mais rápidas e mais prolíficos do que suas contrapartes celulares, devido aos mecanismos deficientes da correcção genomic e de correcção de erros, assim como as pressões selectivas que empurram sua diversificação implacável.

Unidade e diversidade

Comparado com outros organismos, a diversidade entre vírus é extrema. Podem diferir em seu material genético (RNA ou ADN) e estrutura básica, (dobro ou para escolher encalhado), assim como a orientação de seus genes codificados.

Uma complicação mais adicional envolve o facto de que os genomas virais podem ser distribuídos através das unidades distintas, empacotadas às vezes junto em um virion, ou nas partículas separadas do vírus, que são necessários contaminar uma pilha para que a réplica ocorra.

Quando todos os eukaryotes compartilharem de um último antepassado comum, distinto daqueles das bactérias e do archaea, permitindo que os pesquisadores sigam suas origens e divergências evolucionárias muitos biliões de anos no passado, falta dos vírus um grupo de genes universal conservados necessários para construir uma filogenia apropriada.

15 novos a taxonomia florescente elabora no sistema estratificado de Linnaean 7 de reino, filo, classe, pedido, família, género, espécie. Igualmente pede elementos fisiológicos da taxonomia assim chamada de Baltimore, (desenvolvida pelo Prémio Nobel David Baltimore).

O sistema de Baltimore igualmente reconhece 7 níveis mas é não-hierárquico e usa as variáveis que incluem estratégias do tipo e da réplica-expressão do genoma para guiar a classificação viral.

A taxonomia nova é uma etapa significativa para a frente na procura para trazer a organização global ao mundo viral. Mais, apesar da diversidade extrema das histórias evolucionárias actuais nos vírus polyphyletic, uma unidade apontando a uma associação primordial vírus-como de elementos genéticos está começando a emergir.

A história subseqüente inteira da vida na terra pode ser lida como um dinâmico incessante entre estes agentes egoístas e seus anfitriões celulares.

Source:
Journal reference:

The new scope of virus taxonomy: partitioning the virosphere into 15 hierarchical ranks. Nature Microbiology. doi.org/10.1038/s41564-020-0709-x.