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Comment les betacoronaviruses évoluent-ils ?

Les chercheurs Meghan mai, Bahman Rostama et Ryan F. Relich du service des sciences biomédicales, université de médicament, université de la Nouvelle Angleterre, Biddeford, médicament de Service de Pathologie et de laboratoire, l'Indiana et École de Médecine d'université, Indianapolis, aux Etats-Unis, ont travaillé à l'évolution des tensions pathogènes des betacoronaviruses comprenant le radar à ouverture synthétique CoV-2 qui a entraîné la pandémie COVID-19.

Leur étude analyses intitulée, des « de Selectomic et d'Evolvability du Betacoronaviruses hautement pathogène SARS-CoV-2, Radars à ouverture synthétique-CoV, et MERS-CoV, » a été publiée avant l'inspection professionnelle sur le serveur Biorxiv* de prétirage d'ouvert-accès.

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SARS-CoV-2 - Micrographe électronique de boîte de vitesses des particules du virus SARS-CoV-2, d'isolement dans un patient. Image saisie et couleur-améliorée à l'installation intégrée par NIAID de recherches (IRF) dans le fort Detrick, le Maryland. Crédit : NIAID

Quelle était cette étude environ ?

Le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère est le virus nouveau qui entraîne la maladie COVID-19 et a eu comme conséquence la pandémie mondiale affectant presque tout le.

L'équipe de recherche a écrit, « le coronavirus nouveau SARS-CoV-2 est le troisième Betacoronavirus à apparaître pendant les dernières 20 vingt années. »

Ce virus a apparu en décembre 2019 avec les premiers cas rapportés vus province à Wuhan, Hubei de la Chine. On dit que ce virus a des similitudes génomiques avec la manifestation précédente provoquée par le radar à ouverture synthétique CoV qui entraîne le syndrôme respiratoire aigu sévère en 2003. De même, le MERS CoV ou le syndrome respiratoire de Moyen-Orient a également entraîné une manifestation.

L'équipe a écrit qu'il y avait eu, jusqu'à présent, sept coronaviruses qui ont été recensés par des scientifiques. Ceux-ci mènent aux infections des voies respiratoires parmi des êtres humains. Quatre de ces derniers comprennent « les coronaviruses humains (HCoVs) HCoV-229, 49 HCoV-OC43, HCoV-NL63, et HCoV-HKU1, » ils ont écrit. Ce font partie de plusieurs autres virus respiratoires qui diffusent en travers du monde pendant les mois d'hiver. Ils mènent au supérieur doux ou abaissent des infections des voies respiratoires parmi des populations. Ces HCoVs, cependant, sont également capable d'entraîner des infections sévères, et ce sont particulièrement sévères parmi les populations vulnérables de ce type avec un système immunitaire compromis ou des personnes âgées.

Le radar à ouverture synthétique CoV-1 contient l'ARN unique d'un sens qui est sens positif et a une longueur s'échelonner entre le kbp 27 et 32 (paires de kilobase). Ce indicatifs d'ARN pour quatre protéines qui forment la structure du virus appelé la « pointe, S ; 93 enveloppe, E ; membrane, M, et nucléoprotéine, N, » et protéines nonstructural (NSPs) du virus. Il a un cadre de lecture ouvert (ORF) nommé ORF1ab, a écrit les chercheurs.

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Coronavirus nouveau SARS-CoV-2 : Cette image de microscope électronique de lecture montre SARS-CoV-2 (objectifs ronds d'or) apparaissant de la surface des cellules cultivées dans le laboratoire. SARS-CoV-2, également connu sous le nom de 2019-nCoV, est le virus qui entraîne COVID-19. Le virus montré a été isolé dans un patient au crédit des États-Unis : NIAID-RML

Ils ont ajouté que le radar à ouverture synthétique mènent aux frissons, à la fièvre, au mal de tête, à la douleur musculaire, et à la malaise généralisée. Dans certains, il peut mener à la pneumonie sévère et souvent devenir potentiellement mortel. Le régime de fatalité de cas ou le risque de mourir dû à l'infection est environ 10 pour cent. Le régime de fatalité de cas, cependant, augmente avec l'augmentation de l'âge.

Cette étude regardée « la plasticité génomique et la dynamique évolutionnaire » de cette classe des betacoronaviruses afin d'aider à développer des tests diagnostique pour la confirmation moléculaire de l'infection ou à développer des vaccins pour éviter l'infection.

Qu'a été fait dans l'étude ?

L'équipe a déterminé le selectome pour le virus SARS-CoV-2 en évaluant la diversification (deux types - dominants et épisodiques) des positions de perforations acides aminées et leur choix pour les tensions suivantes. Elles ont également regardé l'évolution des betacoronaviruses pathogènes pour évaluer le mouvement de ce virus des animaux aux êtres humains (écart zoonotique ou boîte de vitesses). Selectomes pour Radars à ouverture synthétique-CoV et MERS-CoV et calculs d'évolution dans SARS-CoV-2 se sont également analysés. Suivre ces méthodes, ils ont regardé l'emplacement acide aminé où il y a eu « choix de diversification dominant ou choix de diversification épisodique. »

Qu'a été trouvé ?

L'étude a prouvé qu'il y avait un site significatif où l'évolution a eu lieu. C'était au « polyprotein d'ORF1a, à la protéine de pointe, et à la protéine de membrane, » du coronavirus nouveau ou du SARS-CoV-2. Ils ont écrit que le virus est « hautement en plastique » (au HCoV-OC43) ainsi que « a hautement économisé » (au HCoV-229E). Ils ont écrit que cette technique pourrait aider à recenser les versions de faune de ce virus qui pourraient potentiellement subir une mutation dans les formes virulentes. Ils ont écrit, « ceci souligne la nécessité d'assurer le contrôle viromic continu des réservoirs de faune, car l'identification des coronaviruses avec des traits sensiblement evolvable sont susceptible à une probabilité plus élevée pour des événements zoonotiques couronnés de succès de débordement. »

Ils ont noté qu'il y avait dominant diversifiant le choix dans le polyprotein d'ORF1a et la protéine d'ORF1b et la protéine de S de MERS-CoV et de radar à ouverture synthétique CoV qui a signifié son evolvability. Chacun des trois virus a montré le choix de diversification dominant. Le choix de diversification épisodique a été vu dans les mêmes protéines du SARS-CoV-2, ils a écrit.

Conclusions

Les auteurs ont écrit que cette « adaptation d'hôte de SARS-CoV-2 aux êtres humains est susceptible de mener à la diversification virale parallèle à cela vue pour Radars à ouverture synthétique-CoV et MERS-CoV. Cette étude fournit également des analyses dans le besoin du contrôle viral d'éviter l'effusion des virus de la faune dans des êtres humains.

Les auteurs conclus, « ces découvertes fournissent une vue complète de dynamique évolutionnaire de betacoronavirus zoonotique et hautement pathogène qui peut être directement appliquée à l'analyse diagnostique et au modèle vaccinique pour SARS-CoV-2. »

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et, en conséquence, pour ne pas être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
  • Selectomic and Evolvability Analyses of the Highly Pathogenic Betacoronaviruses SARS-CoV-2, SARS-CoV, and MERS-CoV Meghan May, Bahman Rostama, Ryan F. Relich bioRxiv 2020.05.05.078956; doi: https://doi.org/10.1101/2020.05.05.078956
Dr. Ananya Mandal

Written by

Dr. Ananya Mandal

Dr. Ananya Mandal is a doctor by profession, lecturer by vocation and a medical writer by passion. She specialized in Clinical Pharmacology after her bachelor's (MBBS). For her, health communication is not just writing complicated reviews for professionals but making medical knowledge understandable and available to the general public as well.

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