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Numéro de reproduction et immunité de troupeau dans COVID-19

Une étude de modélisation neuve publiée sur le medRxiv* de serveur de prétirage présume en mai 2020 que les cas asymptomatiques dans la pandémie actuelle au Japon peuvent fortement dépasser les infections symptomatiques par plusieurs ordres de grandeur. Ceci a des implications pour de futures prévisions et politiques sanitaires publiques.

Comment il toute a commencé

Le début de la pandémie COVID-19 actuelle était rapporté comme petite, apparent locale manifestation à Wuhan, Chine, en décembre 2019. Ceci avait tiré jusqu'à environ 50.000 cas avant le 6 mars 2020. Au Japon, en attendant, le premier cas était rapporté le 3 janvier 2020, étant un réfugié de Wuhan. Avant le 26 avril 2020, il y avait plus de 7.700 cas au Japon.

La manifestation a fait une pointe le 12 février à Wuhan, mais fin mars au Japon.

Les manifestations COVID-19 sont caractérisées par un numéro élevé de reproduction, un R0, environ des 2, et des crêtes inférieures de manifestation, au sujet du nombre de cas neufs et de tout le nombre de cas. Le R0 devrait signifier que la manifestation fera une pointe quand le virus infecte la moitié de la population.

À la crête de Wuhan, tout le nombre de patients était 48.000, et au Japon, 7.700 cas. La population de Wuhan a 11 millions ans, et du Japon, 120 millions. Ceci n'est pas conforme à la caractéristique plus tôt. Pour réconcilier ceci, l'étude actuelle offre un modèle neuf.

Le modèle de MONSIEUR est appliqué

Les scientifiques avaient l'habitude un modèle de MONSIEUR (susceptible-infecté-guérison) pour étudier la courbure épidémique de Wuhan. La période d'incubation a été prise des caractéristiques empiriques au Japon.

On a assumé que des cas asymptomatiques et symptomatiques sont également infectieux.

Le nombre de patients symptomatiques à Wuhan est venu des statistiques publiées du 20 janvier au 5 mars, et au Japon, des chiffres publiés par le ministère du travail, de la santé et de l'aide sociale (MLHW) pour le 14 janvier - 24 avril. Là où la date de début était inconnue, on l'a estimé a basé sur des données disponibles. À Wuhan, faute de n'importe quelle date de début, la même caractéristique a été appliquée pour l'estimer.

Le nombre de patients présentant les dates inconnues de début a été estimé, représentant la sous-estimation due aux délais d'enregistrement.

Les chercheurs ont alors modélisé l'épidémie à Wuhan, assumant seulement un cas initial faute d'enregistrement quotidien jusqu'au 20 janvier. Après modèle la prévision a atteint le nombre de patients ce jour, eux comparés les deux ensembles de caractéristiques - des prévisions modélisées et observations.

La courbure épidémique au Japon est marquée dans trois périodes, lesoù annulation d'événement et fermeture volontaires d'école (VECSC) du 27 février au 19 mars. La courbure avait augmenté graduellement, mais est devenue presque entièrement plate dans cette période de VECSC, après quoi elle a montré une augmentation exponentielle. Après qu'elle ait fait une pointe le 2 avril, elle a commencé à se baisser monotoniquement.

Les scientifiques ont conclu, pour cette raison, que chacune de ces crêtes a eu un numéro de reproduction, un R0, un rv, et un Ra différents.

Les résultats

Tout le nombre de cas était plus de 68.000 à Wuhan du 20 janvier au 5 mars. Au Japon, il était 13.000 du 14 janvier au 26 avril, considérant seulement des cas communauté-acquis et excluant des cas asymptomatiques.

La durée du début à l'état était de 30 jours tout au plus. Le modèle prouve que la première crête de manifestation s'est produite au Japon le 3 avril, avec les infections s'étant produit le 29 mars. Les périodes d'incubation parmi 91 cas avec les dates rapportées d'exposition et les dates de début publiées par le MHLW montre une moyenne de 6,6 jours.

Le R0, le rv, et le Ra prévus étaient 3,19 avec la gamme de [3,08, 3,31], 147,7 [145,3, 157,0], et 2,048 [2,048, 2,024] à Wuhan. En outre, q a été estimé en tant que 99,32 [99,31, 99,36] %.  

Au Japon, le R0, le rv, et le Ra ont été estimés respectivement en tant que 2,16 [1,97, 2,20], 1,13 [1,00, 1,44], et 2,96 [2,81, 3,08]. D'ailleurs, q au Japon a été estimé en tant que 99,9888% [99,9885, 99,9890] %.

La crête à Wuhan a été observée le 7 février et faisait partie d'une courbure épidémique qui n'a montré aucune réaction aux mesures de lockdown, qui ont commencé le 23 janvier.  Ceci signifie que la plupart des patients infectés à la crête de l'épidémie ont acquis le virus après le lockdown, et la crête n'est probablement pas à cause du lockdown.

Au Japon, la première crête s'est produite le 3 avril, et la caractéristique employée pour estimer cette crête comprend presque tous les cas rapportés dans les 30 jours. Ceci prouve que la première crête est terminée au Japon. À la crête, aucun lockdown n'était en place, avec la période de VECSC étant terminée déjà le 21 mars. Le Japon a déclaré une condition de l'urgence le 7 avril.

Entre ces dates, pour cette raison, les seuls contre-mesures étaient une recommandation d'éviter de grands rassemblements de masse, et pour cette raison la crête n'est pas due aux contre-mesures intenses. Cependant, le VECSC a semblé avoir été efficace.

Le climat et les conditions atmosphériques ont pu également ne pas avoir contribué à la nature infectieuse du virus puisque ceux-ci sont restés relativement stables tout au long de mars.

Les scientifiques disent, « c'est le premier modèle qui peut montrer une crête et une phase se baissante sans changement du numéro de reproduction pour la manifestation COVID-19. »

Le courant a estimé que le R0 était les estimations assimilées mais légèrement plus inférieurement que précédentes de 2.24-3.58 à Wuhan, mais beaucoup plus haut que l'estimation première de 0,06 au Japon. Ceci signifie que le traçage de contact peut être essentiel pour trouver des boîtiers de boîte de vitesses si plus de 60 millions de personnes sont susceptibles d'être infecté.

Nombres importants d'asymptomatics au Japon

La proportion de cas asymptomatiques dans la population infectée est 99,32 et 99,98%, respectivement, à Wuhan et au Japon. En d'autres termes, il y a 150 et 9.000 patients asymptomatiques pour chaque personne symptomatique confirmée dans ces places, respectivement. C'est une déviation massive à une première estimation de 3 asymptomatiques parmi 23 personnes infectées. La raison pourrait être l'utilisation du contrôle d'ACP, qui rend nécessaire l'infection active au moment du contrôle mais ne trouve pas l'infection antérieure. Le contrôle de grande puissance d'anticorps dans la communauté peut être la seule voie de confirmer les résultats actuels.

Un essai assimilé de contrôle d'anticorps à New York a montré une prévalence d'anticorps de 15% à une prévalence de cas rapporté seulement de 0,88% pour un asymptomatique : rapport infecté de 94%, comparable à l'étude actuelle.

Les chercheurs présument que la proportion asymptomatique est si différente à Wuhan et en Chine à cause des états de santé et des comportements fondamentaux comme le diabète, fumage, et la pollution de l'air, menant à une condition de la santé plus élevée au Japon comparé à Wuhan. Ceci a pu mener à une possibilité plus élevée de la maladie symptomatique à Wuhan.

Une autre raison pourrait être des différences dans la stratégie de contrôle puisque des caisses plus asymptomatiques pourraient être diagnostiquées au Japon si l'ACP vérifie seulement des cas sévères. Une troisième possibilité est celle de la mutation du virus pour développer différentes caractéristiques au Japon.

Limitations de l'étude

Les limitations d'étude comprennent la base entièrement hypothétique du modèle, de la nécessité d'évaluer les raisons de la réussite de VECSC, et des effets possibles de sous-s'assurer des cas, en plus des différences dans le contrôle et les systèmes de compte rendu.

Les scientifiques avertissent également que les futures ondes pourraient se produire au Japon, encore plus haut que la première, particulièrement depuis avril des repères le début de l'année scolaire et l'exercice budgétaire. Ceci signifie une évolution important dans beaucoup de mouvements et d'activités niveau de la population au Japon. Ainsi, la manifestation japonaise ne peut pas être conclue pour être terminée.

L'étude conclut : « En introduisant très une forte proportion de cas asymptomatiques, deux phénomènes intermittents pourraient être resolved en raison de cette étude : le numéro élevé de reproduction et la crête inférieure. Cependant, c'est actuel seulement une hypothèse. »

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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