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L'affinité d'entrée des cellules SARS-CoV-2 varie en travers des espèces différentes d'hôte

Une étude neuve d'Inde, actuellement disponible sur le bioRxiv* de serveur de prétirage, a estimé la probabilité et l'état de préparation du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère pour infecter des cellules des substances animales différentes - et indiqué bon nombre d'entre elles qui pourraient agir en tant que transporteurs de la maladie.

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SARS-CoV-2 - Micrographe électronique de boîte de vitesses des particules du virus SARS-CoV-2, d'isolement dans un patient. Image saisie et couleur-améliorée à l'installation intégrée par NIAID de recherches (IRF) dans le fort Detrick, le Maryland. Crédit : NIAID

Pandémie de la maladie de coronavirus (COVID-19) provoquée par SARS-CoV-2 très probablement provenu de "bat", qui est une substance connue pour héberger une grande sélection de coronaviruses. Et tandis que les pays luttent avec ses conséquences à facettes multiples, les scientifiques autour du monde établissent les spécificités du procédé de l'infection COVID-19.

Nous connaissons déjà des fonctionnements de cette enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) comme récepteur pour le virus. Il est fixé à la surface extérieure des cellules variées et introduit le procédé d'infection en facilitant l'entrée virale due à son affinité d'ACE2-binding.

Virus SARS-CoV-2 grippant aux récepteurs ACE-2 sur une cellule humaine, l
Virus SARS-CoV-2 grippant aux récepteurs ACE-2 sur une cellule humaine, l'étape initiale COVID-19 de l'infection, crédit conceptuel de l'illustration 3D : Kateryna Kon/Shutterstock

La reconnaissance du récepteur est une cause déterminante essentielle en recensant la gamme d'hôte et l'infection hétérospécifique des virus. Cependant, étude n'a pas jusqu'ici poursuivi la comparaison de la séquence ACE2 parmi la substance (avec la modélisation et la prévision d'homologie) pour définir son interaction exacte avec la protéine virale de pointe.

Par conséquent, un organisme de recherche d'Inde a visé à recenser et prévoir l'entrée virale dans la substance animale multiple (agissant en tant que des hôtes de potentiel) en évaluant des différences possibles dans les séquences ACE2 qui peuvent marquer avec l'entrée virale des cellules SARS-CoV-2.

« Coronaviruses sont notoirement promiscueux. Des milliers d'hôte de "bat" de ces types sans succomber à la maladie, et eux sont connus pour infecter des mammifères et les oiseaux, y compris des crabots, des poulets, des bétail, des porcs, des chats, des pangolins, et des "bat" », expliquent des chercheurs.

« Évidemment, ces virus ont le potentiel de sauter à la substance neuve et dans ce procédé subissez une mutation le long de la route pour s'adapter à leur hôte neuf, » ils ajoutent.

Approche de recherches

Aux fins de cette étude, les chercheurs ont analysé un total de 48 séquences ACE2 des substances mammifères, aviaires, et reptiles, recherchées du centre national pour des dépôts de l'information de biotechnologie. Ces séquences ont été alors soumises à l'analyse phylogénétique détaillée (afin d'évaluer des relations évolutionnaires) et puis mutuellement comparé.

Des interactions complexées entre le virus et le récepteur ont été supplémentaire évaluées par l'homologie modélisant utilisant SWISS-MODEL, qui est un serveur qui active la modélisation comparative robotisée des structures des protéines en trois dimensions.

L'analyse statistique pour la prévision était une opération finale, tenant compte de la supposition que la structure et la séquence d'ACE2 sont économisées dans la substance à niveau. Et ils ont trouvé réellement la preuve solide de corroborer ces lieux.

« Pour la substance homo sapiens, nous les environ 60 séquences ACE2 comparées, et constaté que toutes les séquences comparées étaient complet identiques », disons les chercheurs de l'institut national de la biotechnologie animale à Hyderabad, institut de recherches vétérinaire ICAR-Indien dans Izatnagar, et Conseil indien de la recherche agronomique à New Delhi, Inde.

SARS-CoV-2 et le règne animal

Les longueurs d'ADN et de séquence protéique d'ACE2 ont varié dans la dépendance de l'hôte. Plus particulièrement, « sur la moyenne distance de groupe » - qui est le paramètre indicatif de la variabilité de séquence de nucléotides dans le groupe - s'est avéré minimum dans les ungulates impair-bottés avec la pointe du pied, suivis des primates. En revanche, elle était maximum parmi les oiseaux gallinacés.

« Ceci indique que dans le groupe de primates, toutes les substances considérées sont enclines soient également infectées avec SARS-CoV-2 comme êtres humains », expliquent des auteurs d'étude dans le papier procurable sur le bioRxiv.

Dans le type mammifère, la majeure partie de la substance des carnivores, les mammifères fendre-hooved, les ungulates impair-bottés avec la pointe du pied, les pangolins, et les primates ont expliqué une forte probabilité d'entrée virale. Cependant, parmi les primates, on lui a montré que les babouins ont une probabilité très inférieure d'entrée virale, indiquant des différences de dans-groupe.

En outre, les hamsters étaient hautement favorables pour l'entrée virale parmi des rongeurs ; réciproquement, les souris, et les rats ont montré une probabilité plutôt inférieure. Parmi des oiseaux, les canards ont montré une probabilité, un support de poulets, et une dinde très inférieurs la probabilité la plus élevée de l'entrée virale. Les tortues et les crocodiles ont expliqué une probabilité inférieure d'entrée virale.

La signification d'autres facteurs

La « majeure partie de la substance considérée dans cette étude a montré une forte probabilité d'entrée virale, » a dit des auteurs d'étude. « Cependant, l'entrée virale n'est pas le seul facteur qui détermine l'infection dans COVID-19, comme des charges virales se sont avérées élevées dans les patients asymptomatiques », ils ajoutent.

En dépit de la susceptibilité virale d'entrée, des facteurs qui déterminent le taux d'infection et la gravité de la maladie suivante dans l'hôte sont comportement et numéro des contacts, états de santé fondamentaux, et l'âge, mais également des facteurs environnementaux tels que la température atmosphérique, du flux d'air, de l'humidité, et de la densité de population.

En tous cas, les prévisions mises en avant par cette étude peuvent nous inciter à suivre de près certaine substance animale pour déterminer le choc pathogène exact de SARS-CoV-2, mais pour s'assurer également leur capacité d'agir en tant que transporteur ou disseminateur viral.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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