Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

El nuevo algoritmo podía ayudar a investigar las pistas genéticas detrás de la inmunidad

Los científicos con la escuela de Jacobs de Uc San Diego de la ingeniería y del instituto de Qualcomm han desarrollado un nuevo algoritmo de la predicción de gen, llamado MINING-D, que podría ayudar a investigadores a investigar las pistas genéticas detrás de la variación de los síntomas mostrados en los pacientes COVID-19 -; información que es dominante a crear una vacuna versátil y efectiva.

Las conclusión y el algoritmo, que fueron publicados en biología de cómputo de PLOS el 27 de abril, pueden dar a científicos una vista más completa de cómo los genes que forman el asiento de nuestro sistema inmune crean un repertorio personalizado de anticuerpos para proteger contra patógeno invasores. Pueden también verter la luz en porqué algunas personas tienen una inmunorespuesta más efectiva a una infección.

Este estudio será determinado útil como las docenas de grupos comienzan a probar las vacunas potenciales COVID-19, y considera que la vacuna trabaja en algunas personas y no en otros; y el secreto puede estar en las mutaciones en el sistema inmune de cada individuo. Sin conocer el maquillaje inmune de un individuo, no podremos decir porqué trabajó o no trabajó. MINING-D puede ayudar a ofrecer respuestas.”

Pavel Pevzner, profesor con el departamento de Uc San Diego de informática y el dirigir y co-autor en el papel

Hay tres grupos de los genes de la inmunoglobulina de la base que son los bloques huecos de la inmunorespuesta de un individuo: el (v) variable, la diversidad (d) y (j) los genes del germline que ensamblan. MINING-D analiza cómo esas cuadras, determinado el gen poco-estudiado de D, están mezcladas y empaquetadas de nuevo para crear una gran variedad de anticuerpos. Los genes de D desempeñan un papel crítico en crear las regiones de anticuerpos que sean responsables de reconocer patógeno.

La “voluntad de MINING-D ayuda a investigadores a estudiar mutaciones en los genes de D, encima de la cual hasta que este punto haya sido un reto,” dijo a Vinnu Bhardwaj, el autor importante del papel y un candidato del Ph.D. con el departamento de eléctrico y la ingeniería informática y Qualcomm instituyen en Uc San Diego. “Nuestro estudio inicial reveló que algunas variantes de los genes de D están utilizadas más a menudo que otros en respuesta a diversas infecciones. Esperamos que esta información pavimente la manera a abrir pistas sobre el papel que los genes de D desempeñan en cómo es difícil o fácil está para que un paciente luche la infección.”

Cuando un patógeno incorpora un organismo sano, acciona una inmunorespuesta que incluya la recombinación de los genes del germline y de sus mutaciones al azar. El proceso, que difiere de individual al individuo, da lugar a áspero mil millones anticuerpos que circulan en cada uno de nosotros en cualquier momento dado. Este repertorio personalizado del anticuerpo está cambiando constante para luchar nuevas infecciones.

“Nuestro paso siguiente es colaborar con los expertos de cabeza del immunogenomics en la universidad de Louisville que están comenzando a muestrear repertorios del anticuerpo en pacientes con la severidad diversa de COVID-19,” dijo a Yana Safonova, co-autor de papel e investigador postdoctoral en el departamento de informática y de dirigir.

Safonova señala que, como en el caso de gripe, estudios anteriores mostraron que una única mutación en un gen llamado IGHV1-69 dio lugar a la capacidad reducida de un individuo de reconocer el virus de la gripe y así una falla de producir una inmunorespuesta contra ella.

De “variaciones genéticas similares comprensión entre los pacientes COVID-19 pueden ser la llave a desarrollar las vacunas versátiles que accionan el revelado de los anticuerpos que reconocen y neutralizan el virus SARS-CoV-2,” Safonova dijeron.

Source:
Journal reference:

Bhardwaj, V., et al. (2020) Automated analysis of immunosequencing datasets reveals novel immunoglobulin D genes across diverse species. PLOS Computational Biology. doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007837.