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O estudo mostra a dispersão geográfica e evolucionária larga dos betacoronaviruses dos bastões africanos

Um grupo de investigação de Nigéria encontrou a evidência da transmissão e da dispersão interurbanas entre os coronaviruses do bastão isolados em África e esses Europa e Ásia, como descrito em um papel novo disponível no bioRxiv* do server da pré-impressão.

A pandemia da doença 2019 do coronavirus (COVID-19), causada pelo coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2), transformou-se a crise de saúde pública global de definição de nosso tempo. Este vírus pertence ao grupo largo de coronaviruses, que são sabidos para ter um potencial zoonotic do espalhamento dos animais aos seres humanos.

Novo imagem do microscópio de elétron da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 esta mostra SARS-CoV-2 (amarelo) - igualmente conhecido como 2019-nCoV, o vírus que causa COVID-19-isolated de um paciente nos E.U., emergindo da superfície das pilhas (rosa) cultivadas no laboratório. A imagem capturou e colorized em laboratórios da montanha rochosa de NIAID em Hamilton, Montana. Crédito: NIAID
Novo imagem do microscópio de elétron da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 esta mostra SARS-CoV-2 (amarelo) - igualmente conhecido como 2019-nCoV, o vírus que causa COVID-19-isolated de um paciente nos E.U., emergindo da superfície das pilhas (rosa) cultivadas no laboratório. A imagem capturou e colorized em laboratórios da montanha rochosa de NIAID (RML) em Hamilton, Montana. Crédito: NIAID

A fauna e a biodiversidade ricas em África criaram um ponto quente para doenças virais emergentes. A oportunidade adicional para vírus é uma variedade dos bastões que podem servir como os reservatórios, e que podem eficientemente espalhar o micróbio patogénico (por exemplo, megabat africanos são sabidos cobrindo milhares de milhas durante seus ciclos da migração).

A evidência aponta para bastões africanos como um reservatório potencial para diversos betacoronaviruses que podem causar eventos sérios da manifestação. Alguns estudos igualmente sugeriram que o SARS-CoV-2 derramasse provavelmente sobre na população humana por um evento zoonotic que envolve betacoronavirus SARS-relacionado.

Conseqüentemente, um grupo de investigação do centro médico federal em Abeokuta, a universidade da obrigação contratual em Otta, e a universidade de Ibadan em Nigéria decidiram avaliar a diversidade filogenética e a dinâmica evolucionária de betacoronaviruses africanos entre bastões, assim como sua dispersão possível através do continente.

Analisando a árvore evolucionária

Três séries de dados foram geradas das bases de dados do recurso do micróbio patogénico do vírus para fins deste estudo. Mais especificamente, os autores obtiveram seqüências do gene RNA-dependente parcial da polimerase (RdRP) de RNA de coronaviruses do bastão de sete quatro países europeus e três os asiáticos do africano.

A informação tal como a espécie do anfitrião, o país de origem, e as tâmaras da coleção foi combinada com os dados da seqüência a fim conduzir exactamente a determinação filogenética. A análise de conjunto foi realizada com o software específico para identificar a similaridade da seqüência e para reduzir a duplicação dos dados.

As árvores filogenéticas foram pressupor com o uso do software MEGA para manual e o alinhamento da seqüência automática, análise da distribuição (ambos geogràfica e evolucionário) foi usado a cadeia de Markov Monte - Carlo executado no ANIMAL (uma plataforma para a análise molecular filogenética Bayesian da seqüência) e visualizado com plataforma SpreaD3 interactiva.

Um vírus que salte continentes

A espécie a mais predominante do bastão provada neste estudo era megabat epauletted anão de Peters (pusillus de Micropteropus). Ao mesmo tempo, República dos Camarões era o país com a distribuição a mais alta da espécie do bastão provada neste estudo. Contudo, as diferenças reconhecidas dos dados devem ser levadas em consideração ao avaliar resultados do estudo.

Megabat de Epauletted do anão de Peter (pusillus de Micropteropus). Crédito de imagem: Dave Montreuil/Shutterstock
Megabat de Epauletted do anão de Peter (pusillus de Micropteropus). Crédito de imagem: Dave Montreuil/Shutterstock

“Este resultado não representa necessariamente a imagem verdadeira da diversidade da espécie do bastão em África, enquanto alguns países faltam a informação da seqüência para a falta devida dos bastões da fiscalização,” autores do estudo do cuidado.

Realmente, até aqui, somente um punhado dos estudos foi conduzido em África em coronaviruses entre bastões, que sae de uma falha considerável na informação epidemiológica em relação aos beta coronaviruses do bastão em África.

Este estudo adiciona o conhecimento adicional na filogenia das beta seqüências do coronavirus, que revelaram que uma maioria das tensões africanas cai dentro da linhagem D - consistir em tensões de República dos Camarões, de the Democratic Republic of the Congo, de Kenya, de Madagáscar, e de Nigéria. Corrobora os relatórios precedentes que identificaram um único clade que circula durante todo o continente africano.

Além disso, os pesquisadores sugeriram para a transmissão das inter-espécies entre os betacoronaviruses da linhagem D, permitindo a recombinação potencial e a evolução rápida desta linhagem. Também, a circulação de duas linhagens distintas B e C entre a espécie africana do bastão foram demonstrados.

Finalmente, a dispersão phylogeographic de coronaviruses do bastão revelou uma pletora de eventos intercontinentais e intra-continentais da propagação. A dispersão viral das mostras anteriores de China e de Hong Kong à central e à África meridional, quando o último demonstrar a propagação entre República dos Camarões, the Democratic Republic of the Congo, e África do Sul, assim como directamente de República dos Camarões em Madagáscar.

Defeitos e conclusões do estudo

Embora estas introspecções fossem giratórias para um seguimento mais adicional dos coronaviruses, uma limitação principal do estudo era a incapacidade analisar dados da seqüência da proteína do ponto destes vírus. Tal aproximação forneceria uns dados mais pertinentes em sua evolução a respeito da transmissão e da infectividade.

Além, a demografia da população relatada neste estudo não pôde realìstica descrever a população viral desde que o tamanho do conjunto de dados utilizado é limitado e não pôde representar a população demográfica verdadeira de coronaviruses do bastão em África.

“Nós temos, contudo, mostrado a importância da fiscalização molecular dos vírus com potencial zoonotic tal como coronaviruses,” diga autores do estudo. “Nós defendemos para uns estudos transporte-continentais mais largos que envolvem seqüências completas do genoma dos betacoronaviruses para compreender mais os motoristas para sua emergência e difusões zoonotic na população humana”, conclui.

Em todo caso, nós temos que estar cientes que os coronaviruses SARS-relacionados do bastão continuarão a derramar sobre à população humana. As possibilidades de uma outra pandemia mortal são certamente raras; contudo, aquelas possibilidades aumentam com a freqüência de tais difusões. Assim a comunidade científica tem que ficar vigilante.

Observação *Important

o bioRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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