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El estudio muestra la dispersión geográfica y evolutiva amplia de betacoronaviruses de palos africanos

Un grupo de investigación de Nigeria encontró pruebas de la transmisión y de la dispersión de larga distancia entre los coronaviruses del palo aislados en África y los Europa y Asia, como descrito en un nuevo papel disponible en el bioRxiv* del servidor de la prueba preliminar.

El pandémico de la enfermedad 2019 del coronavirus (COVID-19), causado por el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática, se convirtió en la crisis de salud pública global de definición de nuestro tiempo. Este virus pertenece al grupo amplio de los coronaviruses, que se saben para tener un potencial zoonótico de extenderse de animales a los seres humanos.

Nuevo esta imagen del microscopio electrónico de exploración de Coronavirus SARS-CoV-2 muestra SARS-CoV-2 (amarillo) - también conocido como 2019-nCoV, el virus que causa COVID-19-isolated de un paciente en los E.E.U.U., emergiendo de la superficie de las células (festonear) cultivadas en el laboratorio. La imagen capturó y colorized en los laboratorios de la montaña rocosa de NIAID en Hamilton, Montana. Haber: NIAID
Nuevo esta imagen del microscopio electrónico de exploración de Coronavirus SARS-CoV-2 muestra SARS-CoV-2 (amarillo) - también conocido como 2019-nCoV, el virus que causa COVID-19-isolated de un paciente en los E.E.U.U., emergiendo de la superficie de las células (festonear) cultivadas en el laboratorio. La imagen capturó y colorized en los laboratorios de la montaña rocosa de NIAID (RML) en Hamilton, Montana. Haber: NIAID

La fauna y la biodiversidad ricas en África crearon apuroses para las enfermedades virales emergentes. La oportunidad adicional para los virus es un surtido de palos que puedan servir como depósitos, y que puedan extender eficientemente el patógeno (por ejemplo, los palos de fruta africanos se saben para revestir millares de millas durante sus ciclos de la migración).

Las pruebas apuntan en la dirección de palos africanos como depósito potencial para varios betacoronaviruses que puedan causar acciones serias del brote. Algunos estudios también han sugerido que el SARS-CoV-2 se derramó probablemente encima en la población humana por una acción zoonótica que implicaba betacoronavirus SARS-relacionado.

Por lo tanto, un grupo de investigación del centro médico federal en Abeokuta, la universidad del convenio en Otta, y la universidad de Ibadan en Nigeria decidían valorar la diversidad filogenética y la dinámica evolutiva de betacoronaviruses africanos entre palos, así como su dispersión posible a través del continente.

Analizar el árbol evolutivo

Tres conjuntos de datos fueron generados de las bases de datos del recurso el patógeno del virus con el propósito de este estudio. Más concretamente, los autores obtuvieron series del gen ARN-relacionado parcial de la polimerasa (RdRP) de ARN de los coronaviruses del palo a partir de siete cuatro países europeos y tres asiáticos del africano.

La información tal como especie del ordenador principal, país de origen, y fechas de la colección fue combinada con datos de la serie para conducto la determinación filogenética exacto. El análisis de atado fue realizado con el software específico para determinar semejanza de la serie y para reducir la duplicación de los datos.

Los árboles filogenéticos fueron deducidos con el uso del software MEGA para manual y la alineación de la serie automática, análisis de la distribución (ambos geográficamente y evolutivo) conducto usando la cadena de Markov Monte Carlo ejecutada en la BESTIA (una plataforma para el análisis molecular filogenético Bayesian de la serie) y visualizada con la plataforma interactiva SpreaD3.

Un virus que salta continentes

La especie más frecuente del palo muestreada en este estudio era palo de la fruta epauletted enano de Peters (pusillus de Micropteropus). Al mismo tiempo, el Camerún era el país con la distribución más alta de la especie del palo muestreada en este estudio. Sin embargo, los entrehierros reconocidos de los datos deben ser tenidos en cuenta al valorar conclusión del estudio.

Palo de fruta de Epauletted del enano de Peter (pusillus de Micropteropus). Haber de imagen: Dave Montreuil/Shutterstock
Palo de fruta de Epauletted del enano de Peter (pusillus de Micropteropus). Haber de imagen: Dave Montreuil/Shutterstock

“Este resultado no representa necesariamente la verdadera imagen de la diversidad de la especie del palo en África, mientras que algunos países faltan la información de la serie para la falta debida de los palos de vigilancia,” los autores del estudio de la cautela.

Real, hasta el momento, solamente un puñado de estudios ha conducto en África en coronaviruses entre palos, que sale de una considerable grieta en la información epidemiológica con respecto a coronaviruses beta del palo en África.

Este estudio agrega conocimiento adicional en la filogenia de las series beta del coronavirus, que revelaron que una mayoría de las deformaciones africanas se cae dentro del linaje D - consistir en deformaciones del Camerún, de la República Democrática del Congo, de Kenia, de Madagascar, y de Nigeria. Corrobora los partes anteriores que determinaron un único clade que circulaba en el continente africano.

Por otra parte, los investigadores hicieron alusión hacia la transmisión de las inter-especies entre los betacoronaviruses del linaje D, teniendo en cuenta la recombinación potencial y la evolución rápida de este linaje. También, la circulación de dos linajes distintos B y C entre especie africana del palo fueron demostradas.

Finalmente, la dispersión phylogeographic de los coronaviruses del palo reveló una plétora de acciones intercontinentales e intracontinentales de la extensión. La dispersión viral de las demostraciones anteriores de China y de Hong Kong a África central y meridional, mientras que este último demuestra la extensión entre el Camerún, la República Democrática del Congo, y Suráfrica, así como directamente del Camerún en Madagascar.

Defectos y conclusiones del estudio

Aunque estos discernimientos sean giratorios para la búsqueda adicional de coronaviruses, una limitación importante del estudio era la incapacidad para analizar datos de la serie de la proteína del pico de estos virus. Tal aproximación habría ofrecido datos más pertinentes en su evolución referente la transmisión y a la contagiosidad.

Además, la demografía de la población denunciada en este estudio no pudo representar realista la población viral puesto que la talla del grupo de datos utilizado es limitada y no pudo representar la población demográfica verdadera de coronaviruses del palo en África.

“Tenemos, sin embargo, mostrado la importancia de la vigilancia molecular de virus con potencial zoonótico tal como coronaviruses,” diga a los autores del estudio. “Abogamos para estudios transcontinentales más amplios que implican series completas del genoma de betacoronaviruses para entender más lejos los impulsores para su aparición y los despilfarros zoonóticos en la población humana”, ella concluye.

En todo caso, tenemos que ser conscientes que los coronaviruses SARS-relacionados del palo continuarán derramarse encima a la población humana. Las ocasiones de otro pandémico mortal son de hecho raras; sin embargo, esas ocasiones aumentan con la frecuencia de tales despilfarros. Así la comunidad científica tiene que tirante vigilante.

Advertencia *Important

el bioRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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