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SARS-CoV-2 si è adattato agli esseri umani molto prima del caso di indice analitico?

Un nuovo studio dal Canada e dagli Stati Uniti suggerisce che il coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo possa già pre-adattarsi alla trasmissione umana quando è emerso alla fine del 2019, che significa là possa essere popolazioni prolungate del progenitore SARS-CoV-2 esperto per l'ri-emergenza umana di malattia di coronavirus e della trasmissione (COVID-19). La ricerca è pubblicata sul bioRxiv* del " server " della pubblicazione preliminare nel maggio 2020.

Microscopio elettronico a scansione novello di Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized di una cella apoptotic (marrone verdastro) infettata molto con le particelle del virus SARS-COV-2 (rosa), isolate da un campione paziente. L
Microscopio elettronico a scansione novello di Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized di una cella apoptotic (marrone verdastro) infettata molto con le particelle del virus SARS-COV-2 (rosa), isolate da un campione paziente. Immagine catturata e colore-migliorata alla funzione di ricerca integrata NIAID (IRF) in Detrick forte, Maryland. Credito: NIAID

Parecchi rapporti hanno dimostrato che SARS-CoV-2, l'agente causativo della pandemia in corso COVID-19, è geneticamente stalla e non sotto molta pressione adattarsi. Ciò che trova potrebbe aumentare l'efficacia dei vaccini che sono corrente in via di sviluppo.

Se andiamo nuovamente dentro l'esperienza, possiamo vedere che c'erano dal 2002 al 2004 due scoppi originali di SAR nel periodo - ciascuno provenire dagli eventi zibetto--umani della trasmissione della palma disparata di SAR-CoV. dovuto l'animale assiduo e tenere la carreggiata e lezioni umane ospite dalla prima epidemia, il secondo scoppio è stato soppresso rapidamente.

Per impedire oggi gli scoppi consecutivi analoghi di COVID-19, è quindi chiave capire le lezioni dal passato e promulgare le misure precise per minimizzazione di rischio dei precursori supplementari di SARS-CoV-2-like che si adattano a e che riappaiono fra gli esseri umani. Ciò può essere fatta mediante l'identificazione dell'itinerario da cui il nuovo coronavirus si è adattato per la trasmissione umana.

Tuttavia, dal momento che, la prova è insufficiente supportare tutto lo scenario specifico di adattamento SARS-CoV-2. Il virus è stato trasmesso attraverso le specie negli esseri umani ed è stato distribuito non scoperto per i mesi prima della fine del 2019, accumulando le mutazioni adattabili sul modo? O era già pozzo regolato per gli esseri umani mentre in pipistrelli o nelle altre specie intermedie?

Pipistrello a ferro di cavallo intermedio (affinis di Rhinolophus). Credito di immagine: Binturong-Tonoscarpe
Pipistrello a ferro di cavallo intermedio (affinis di Rhinolophus). Credito di immagine: Binturong-Tonoscarpe

La domanda più importante per salubrità globale è se il gruppo di virus umano-adattati del progenitore ancora sussiste in animali. E perfino probabilità remota che un precursore virale potrebbe adattare al host umano mentre era studiato in un laboratorio dovrebbe essere considerato.

Queste sono alcune domande pertinenti che Dott. Shing Hei Zhan dall'università di British Columbia a Vancouver e di Fusion Genomics Corporation in Burnaby (Canada), insieme a Dott. Benjamin E. Deverman ed a Dott. Yujia Alina Chan dal vasto istituto del MIT e di Harvard (Stati Uniti) miranti per rispondere in loro documento recente del bioRxiv.

Stabilità genomica di comprensione e dinamica evolutiva

Per guadagnare una migliore comprensione della stabilità del genoma SARS-CoV-2, i ricercatori inizialmente hanno effettuato parallelamente un confronto della dinamica evolutiva fra SARS-CoV-2 e i SAR-CoV originali. Ciò è stata fatta curating i genoma di alta qualità attraverso i periodi di tre mesi; più specificamente, c'erano 11 genoma per la presto--metà di epidemia SAR-CoV, 32 genoma per l'epidemia recente SAR-CoV come pure 46 genoma per SARS-CoV-2 da dicembre 2019 al marzo 2020.

Ciò è stata seguita dal paragone e dalla contrapposizione della dinamica evolutiva di SAR-CoV e di SARS-CoV-2 in termini di tariffe non sinonime e sinonime della sostituzione in ogni gene, assicurandosi allo stesso tempo, diffusione geografica adeguata nella campionatura.

Coronavirus novello SARS-CoV-2: Questa immagine del microscopio elettronico a scansione mostra SARS-CoV-2 (oggetti rotondi dell

Coronavirus novello SARS-CoV-2: Questa immagine del microscopio elettronico a scansione mostra SARS-CoV-2 (oggetti rotondi dell'oro) che emerge dalla superficie delle celle coltivate in laboratorio. SARS-CoV-2, anche conosciuto come 2019-nCoV, è il virus che causa COVID-19. Il virus indicato è stato isolato da un paziente nel credito degli Stati Uniti: NIAID-RML

Lo svantaggio principale di questo approccio è l'inflazione potenziale di diversità genetica dovuto il campionamento dalle posizioni di traffico su/diverse come pure risultati obliqui dovuto i fattori quali il velocita di trasmissione virale e l'efficace dimensione della popolazione. Inoltre, una tendenziosità di campionatura verso gli isolati con un antenato comune più recente può, a sua volta, sottovalutare la diversità genetica.

Una ricerca per il host intermedio evasivo

C'è stato ampio dibattito fra i ricercatori ed il pubblico sopra se SARS-CoV-2 è provenuto dal servizio della vendita all'ingrosso dei frutti di mare di Huanan a Wuhan. Sebbene il CDC di cinese suggerisca che il virus provenuto dagli animali che sono stati venduti là, tenere la carreggiata filogenetico indica che SARS-CoV-2 può essere incluso nel servizio dagli esseri umani.

Un servizio tradizionale in Asia in cui i pipistrelli sono venduti sotto il nome di alimento fra come altri animali come i cani o serpenti. Credito di immagine: Maurizio Biso/Shutterstock
Un servizio tradizionale in Asia in cui i pipistrelli sono venduti sotto il nome di alimento accanto ad altri animali come i cani o serpenti. Credito di immagine: Maurizio Biso/Shutterstock

Gli autori di questo studio sono stati sorpresi osservando che SARS-CoV-2 somiglia a SAR-CoV verso la fine della fase dello scoppio 2003 dopo il virus ha sviluppato parecchi adattamenti vantaggiosi permettendo alla trasmissione da uomo a uomo. Inoltre, il servizio di gennaio isola l'identità quasi 100% del genoma dell'azione con uno sforzo umano SARS-CoV-2 di dicembre, che rende ad una teoria ospite intermedio meno probabile.

“Le nostre osservazioni suggeriscono che prima che SARS-CoV-2 in primo luogo sia stato individuato alla fine del 2019, già pre-si sia adattato alla trasmissione umana in misura simile all'epidemia recente SAR-CoV„, autori di studio di punto culminante. “Tuttavia, nessun precursori o ramo di evoluzione che provengono da un virus di meno umano-adattato di SARS-CoV-2-like sono stati individuati„, essi aggiungono.

In breve, i genoma SARS-CoV-2 all'interno del servizio campiona gli esseri umani molto probabilmente provenuti da infettati con SARS-CoV-2 che erano ospiti o venditori del mercato. Se i host animali intermedi fossero egualmente al servizio, nessuna prova è stata trovata nei campioni genetici disponibile.

Messaggi e strategie chiave

Tale mancanza di prova definitiva che verifica o che elimina l'adattamento in specie ospite intermedio, in esseri umani o in laboratori, precauzioni di mezzi contro parecchi scenari deve essere ordine contenuto per impedire l'ri-emergenza di malattia.

“Vorremmo sostenere per misurato e gli efficaci approcci per identificare tutte le popolazioni prolungate del virus del progenitore SARS-CoV-2, specialmente se questi sono similmente esperti alla trasmissione umana„, dicono gli autori di studio in loro documento.

Parecchie strategie che sono risultato essere fondamentali durante il primo scoppio SAR-CoV nella rilevazione dell'adattamento virale agli esseri umani ed alla trasmissione di inter-specie potrebbero essere riapplicate nell'odierna pandemia per eliminare il progenitore si riunisce rapido.

Queste strategie sono: la campionatura animale (dai servizi, dalle aziende agricole e dalle popolazioni selvagge), esemplari umani di valutazione ha contato i mesi prima della fine del 2019 per i virus di SARS-CoV-2-like o gli anticorpi reattivi come pure ha valutato il sotto- o la sovrarappresentazione di alimento/gestori animali fra i casi di indice analitico per determinare se i precursori SARS-CoV-2 possono circolare fra la comunità di traders animale.

“Ordinare più SARS-CoV-2 isolati da Wuhan, specialmente isolati in anticipo se ancora esistono, potrebbe identificare i rami che provengono da un progenitore più di meno umano-adattato come è stato veduto nello scoppio 2003 SAR-CoV„, spieghi gli autori di studio.

Comunque, durante queste indagini supplementari, sarebbe consigliabile limitare estesamente l'attività umana che può piombo contatto prolungato o aumentato con gli animali selvatici ed i loro habitat. Impedire l'ri-emergenza dovrebbe essere una massima priorità nella conservazione della salubrità globale.

Avviso *Important

il bioRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

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Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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