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SARS-CoV-2 adaptou-se aos seres humanos muito antes do exemplo do deslocamento predeterminado?

Um estudo novo de Canadá e dos E.U. sugere que o coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) possa já pre-ter sido adaptado à transmissão humana quando emergiu ao fim de 2019, que significa lá possa ser populações atrasadas do ancestral SARS-CoV-2 perito para a re-emergência humana da doença da transmissão e do coronavirus (COVID-19). A pesquisa é publicada sobre o bioRxiv* do server da pré-impressão em maio de 2020.

Micrografia de elétron nova da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de uma pilha apoptotic (marrom esverdeado) contaminada pesadamente com as partículas do vírus SARS-COV-2 (rosa), isoladas de uma amostra paciente. A imagem capturada e cor-aumentada no NIAID integrou a instalação de investigação no forte Detrick, Maryland. Crédito: NIAID
Micrografia de elétron nova da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de uma pilha apoptotic (marrom esverdeado) contaminada pesadamente com as partículas do vírus SARS-COV-2 (rosa), isoladas de uma amostra paciente. Imagem capturada e cor-aumentada na instalação de investigação integrada NIAID (IRF) no forte Detrick, Maryland. Crédito: NIAID

Diversos relatórios demonstraram que SARS-CoV-2, o agente causal da pandemia COVID-19 em curso, é genetically estábulo e não sob muita pressão se adaptar. Isto que encontra poderia aumentar a eficácia das vacinas que estão actualmente durante o processo de desenvolvimento.

Se nós vamos de novo no passado, nós podemos ver que havia duas manifestações originais do SARS no período desde 2002 até 2004 - cada um originar dos eventos almíscar-à-humanos da transmissão da palma díspar dos SARS-CoV. Devido ao seguimento assíduo e às lições do anfitrião do animal e do ser humano da primeira epidemia, a segunda manifestação foi suprimida rapidamente.

A fim impedir hoje manifestações consecutivas análogas de COVID-19, é conseqüentemente giratória compreender lições do passado e decretar medidas precisas para a minimização do risco dos precursores adicionais de SARS-CoV-2-like que adaptam-se a e que reemirjem entre seres humanos. Isto pode ser feito identificando a rota por que o coronavirus novo se adaptou para a transmissão humana.

Contudo, no momento em que, a evidência é escassa apoiar toda a encenação específica da adaptação SARS-CoV-2. O vírus foi transmitido através da espécie em seres humanos e circulado não descoberto por meses antes do fim de 2019, acumulando mutações adaptáveis na maneira? Ou era já bom ajustado para seres humanos quando nos bastões ou em uma outra espécie intermediária?

Bastão em ferradura intermediário (affinis de Rhinolophus). Crédito de imagem: Binturong-Tonoscarpe
Bastão em ferradura intermediário (affinis de Rhinolophus). Crédito de imagem: Binturong-Tonoscarpe

A pergunta mais importante para a saúde global é se a associação de vírus humano-adaptados do ancestral ainda subsiste nos animais. E mesmo probabilidade remota que um precursor viral poderia ter adaptado ao anfitrião humano ao ser estudado em um laboratório deve ser levado em consideração.

Estas são algumas perguntas pertinentes que Dr. Shing Hei Zhan da universidade do Columbia Britânica em Vancôver e da Fusão Genómica Corporaçõ em Burnaby (Canadá), junto com o Dr. Benjamin E. Deverman e o Dr. Yujia Alina Chan do instituto largo de MIT e de Harvard (os Estados Unidos) apontados responder em seu papel recente do bioRxiv.

Estabilidade genomic compreensiva e dinâmica evolucionária

Para ganhar uma compreensão melhor da estabilidade do genoma SARS-CoV-2, os pesquisadores realizaram inicialmente de lado a lado uma comparação da dinâmica evolucionária entre SARS-CoV-2 e os SARS-CoV originais. Isto foi feito curating os genomas de alta qualidade através dos períodos de três-mês; mais especificamente, havia 11 genomas para a epidemia SARS-CoV início a meados, 32 genomas para a epidemia SARS-CoV atrasada, assim como 46 genomas para SARS-CoV-2 desde princípio de dezembro de 2019 ao março de 2020.

Isto foi seguido comparando e contrastando a dinâmica evolucionária dos SARS-CoV e do SARS-CoV-2 em termos das taxas não-sinónimas e sinónimas da substituição em cada gene, assegurando ao mesmo tempo, propagação geográfica adequada na amostra.

Coronavirus novo SARS-CoV-2: Esta imagem do microscópio de elétron da exploração mostra SARS-CoV-2 (objetos redondos do ouro) que emerge da superfície das pilhas cultivadas no laboratório. Crédito: NIAID-RML

Coronavirus novo SARS-CoV-2: Esta imagem do microscópio de elétron da exploração mostra SARS-CoV-2 (objetos redondos do ouro) que emerge da superfície das pilhas cultivadas no laboratório. SARS-CoV-2, igualmente conhecido como 2019-nCoV, é o vírus que causa COVID-19. O vírus mostrado foi isolado de um paciente no crédito dos E.U.: NIAID-RML

O inconveniente principal desta aproximação é a inflação potencial da diversidade genética devido à preparação de amostras dos lugar diversos/altamente do tráfego, assim como resultados enviesados devido aos factores tais como a taxa de transmissão viral e o tamanho eficaz da população. Além, uma polarização da amostra para isolados com um antepassado comum mais recente pode, por sua vez, subestimar a diversidade genética.

Uma procura para o anfitrião intermediário indescritível

Houve um debate amplo entre pesquisadores e o público sobre se SARS-CoV-2 originou do mercado da venda por atacado do marisco de Huanan em Wuhan. Embora o CDC chinês sugira que o vírus originado dos animais que foram vendidos lá, o seguimento filogenética indica que SARS-CoV-2 pode ter sido importado no mercado por seres humanos.

Um mercado tradicional em Ásia onde os bastões são vendidos como o alimento entre como outros animais como cães ou serpentes. Crédito de imagem: Maurizio Biso/Shutterstock
Um mercado tradicional em Ásia onde os bastões são vendidos como o alimento ao lado de outros animais como cães ou serpentes. Crédito de imagem: Maurizio Biso/Shutterstock

Os autores deste estudo foram surpreendidos observando que SARS-CoV-2 se assemelha a SARS-CoV no final da fase da manifestação 2003 após o vírus desenvolveu diversas adaptações vantajosas permitindo a transmissão de humano a humano. Além disso, o mercado de janeiro isola a identidade quase 100% do genoma da parte com uma tensão SARS-CoV-2 humana de dezembro, que faça uma teoria do anfitrião intermediário menos provável.

“Nossas observações sugerem que antes que SARS-CoV-2 for detectado primeiramente ao fim de 2019, pre-esteja adaptado já à transmissão humana a uma extensão similar à epidemia atrasada SARS-CoV”, autores do estudo do destaque. “Contudo, nenhum precursor ou ramo da evolução que provêm de um vírus menos humano-adaptado de SARS-CoV-2-like foram detectados”, ele adicionam.

Em curto, os genomas SARS-CoV-2 dentro das amostras do mercado provieram muito provavelmente dos seres humanos contaminados com SARS-CoV-2 que eram visitantes ou vendedores do mercado. Se os anfitriões animais intermediários estavam igualmente no mercado, nenhuma evidência foi encontrada nas amostras genéticas disponível.

Mensagens e estratégias chaves

Tal falta da evidência definitiva que verifica ou que ordena para fora a adaptação em uma espécie do anfitrião intermediário, os seres humanos ou os laboratórios, precauções dos meios contra diversas encenações tem que ser pedido recolhido para impedir a re-emergência da doença.

“Nós gostaríamos de defender para medido e as aproximações eficazes para identificar todas as populações atrasadas do vírus do ancestral SARS-CoV-2, particularmente se estas são similarmente peritas na transmissão humana”, dizem autores do estudo em seu papel.

Diversas estratégias que provaram ser fundamentais durante a primeira manifestação SARS-CoV em detectar a adaptação viral à transmissão dos seres humanos e das cruz-espécies poderiam ser reaplicadas na pandemia de hoje para limpar para fora o ancestral associam-se ràpida.

Estas estratégias são: a amostra animal (dos mercados, as explorações agrícolas e populações selvagens), espécimes humanos de avaliação depositou meses antes do fim de 2019 para vírus de SARS-CoV-2-like ou anticorpos reactivos, assim como avaliação sob ou sobre-representação do alimento/alimentadores animais entre os exemplos do deslocamento predeterminado para determinar se os precursores SARS-CoV-2 podem ter circulado entre a comunidade de troca animal.

“Arranjar em seqüência mais SARS-CoV-2 isolados de Wuhan, isolados particularmente adiantados se ainda existem, poderia identificar os ramos que originam de um ancestral menos humano-adaptado como foi visto na manifestação 2003 SARS-CoV”, explique autores do estudo.

Em todo caso, durante estas investigações adicionais, seria aconselhável limitar extensivamente a actividade humana que pode conduzir contacto prolongado ou aumentado com animais selvagens e seus habitat. Impedir a re-emergência deve ser uma prioridade máxima em preservar a saúde global.

Observação *Important

o bioRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

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Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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