Attenzione: questa pagina è una traduzione automatica di questa pagina originariamente in lingua inglese. Si prega di notare in quanto le traduzioni sono generate da macchine, non tutte le traduzioni saranno perfetti. Questo sito web e le sue pagine web sono destinati ad essere letto in inglese. Ogni traduzione del sito e le sue pagine web possono essere imprecise e inesatte, in tutto o in parte. Questa traduzione è fornita per comodità.

I ricercatori analizzano i dati sulla struttura del RNA del virus di encefalite da zecche

I ricercatori dall'università di Sechenov insieme ai colleghi da parecchi istituti russi hanno analizzato i dati sulla struttura del RNA del virus di encefalite da zecche.

Molto più grande di negli studi precedenti, il volume di dati di nuovo studio li ha permessi di stimare l'età dei sottotipi del virus e di tenere la carreggiata la sua diffusione nell'Eurasia. I risultati dello studio sono stati pubblicati nei virus del giornale.

L'encefalite da zecche è comune in Europa centrale e l'Europa Orientale e un'ampia banda in Siberia del sud e nell'Estremo Oriente.

Questa malattia è pericoloso dovuto la capacità del virus di penetrare il cervello ed il midollo spinale, causante i disordini di motore, i danni e, in casi gravi, la paralisi conoscitiva e la morte. Ogni anno in Russia, 1,500-2,000 genti sono infettate, con la morte neurologica di sviluppo di complicazioni e della gente 20-100 di circa 30%.

L'agente patogeno appartiene al genere Flavivirus (egualmente include il virus di Zika ed il virus che causa le dengue) ed è trasmesso pricipalmente attraverso i morsi della tacca. Ci sono tre sottotipi del virus: Dell'Estremo-Oriente, siberiano ed europeo.

Ciascuno di loro è predominante nella regione dopo di che è nominato, sebbene questa divisione sia abbastanza grezza - per esempio, i casi dell'infezione con il sottotipo siberiano sono stati osservati negli stati baltici e nel Sakhalin e con quello europeo - in Corea del Sud e le montagne di Altai.

Negli ultimi anni, la diffusione del virus si è espanta alle aree nordiche (penisola di Kola, regione di Arcangelo) ed alle regioni montagnose (in Europa centrale ed in Italia). Nel 2019, i primi casi dell'infezione sono stati registrati nel Regno Unito e nei Paesi Bassi.

Per rispondere subito all'emergenza del virus in nuovi territori, è necessario da capire che influenze la sue diffusione ed evoluzione. Gli studi esistenti forniscono i risultati differenti e a volte contraddittori, ma i nuovi dati raccolti negli ultimi anni possono chiarire la situazione.

Gli autori dell'articolo hanno usato GenBank - un database che memorizza più di 200 milione sequenze di nucleotide di RNA e di DNA di varie specie.

I dati sono assicurati dagli scienziati dai paesi differenti ed il loro volume sta sviluppandosi costantemente, in comune con il numero delle sequenze che descrivono il RNA del virus di encefalite da zecche - durante dieci anni il numero è aumentato cinque volte.

Facendo uso degli algoritmi del computer, i ricercatori hanno confrontato il RNA dei virus trovati durante gli anni differenti sul territorio di parecchi paesi.

Conoscendo “la distanza„ (la proporzione di nucleotidi divergenti) fra i campioni e la data della loro ricevuta, si può stimare il periodo di divergenza delle specie o della divisione dell'specie nei sottotipi.

Questo metodo è basato sul presupposto che la sequenza dei nucleotidi in singole specie cambia ad una tariffa approssimativamente costante ed è chiamato l'orologio molecolare. Facendo uso di questo metodo, gli scienziati hanno stimato l'età dell'antenato comune più recente per ciascuno dei sottotipi.

Il risultato (circa 700 e 900 anni per i sottotipi siberiani e dell'Estremo-Oriente, rispettivamente) è coerente con gli studi più iniziali, mentre l'età del sottotipo europeo (circa 1.600 anni) è stata stimata per la prima volta dopo che il virus è stato macchiato nei Paesi Bassi.

I ricercatori egualmente hanno provato a scoprire quanto i virus geneticamente simili dello stesso sottotipo hanno finito in paesi differenti ad una distanza di migliaia di chilometri l'uno dall'altro. Ci sono parecchie spiegazioni possibili.

In primo luogo, i virus (o tacche infettate con loro) possono viaggiare distanze lunghe con gli animali, quali gli uccelli migratori o i pipistrelli. In secondo luogo, l'attività umana può contribuire alla diffusione del virus: trasporto di bestiame o di introduzione degli animali adatti a cercare nei nuovi territori.

Il risultato più importante del lavoro era che la maggior parte degli eventi di diffusione del virus si sono presentati negli ultimi tre o quattro secoli ed in molti casi abbiamo osservato il trasferimento del virus per le migliaia di chilometri durante i 50-100 anni ultimi ed i virus in Europa hanno completamente misto durante gli ultimi 100-200 anni. '

Alexander Lukashev, co-author di studio e Direttore dell'istituto di parassitologia medica e di medicina tropicale, università di Sechenov

“Questo permette che noi consideriamo l'encefalite da zecche come malattia altamente dinamica, proprio mentre una malattia emergente in molte regioni e pensare ad un fattore antropogenico (la diffusione delle tacche infettate come conseguenza di trasporto di nazionale e degli animali selvatici) come uno dei meccanismi principali dietro l'espansione del virus.„

Inoltre, gli scienziati hanno proposto un algoritmo che simula la compilazione dei campioni come utilizzato negli studi più iniziali. Con la sua guida, gli autori dell'articolo hanno indicato che le differenze nei risultati degli studi precedentemente pubblicati sono spiegate bene tramite la selezione delle sequenze incluse nello studio.

Source:
Journal reference:

Deviatkin, A. A., et al. (2020) Tick-Borne Encephalitis Virus: An Emerging Ancient Zoonosis? Viruses. doi.org/10.3390/v12020247.