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Os pesquisadores analisam dados na estrutura do RNA do vírus tiquetaque-carregado da encefalite

Os pesquisadores da universidade de Sechenov junto com colegas de diversos institutos do russo analisaram dados na estrutura do RNA do vírus tiquetaque-carregado da encefalite.

Muito maior do que em estudos precedentes, o volume dos dados do estudo novo permitiu que calculassem a idade dos subtipos do vírus e seguissem sua propagação em Eurasia. Os resultados do estudo foram publicados nos vírus do jornal.

a encefalite Tiquetaque-carregada é comum na Europa Central e Europa Oriental e uma faixa larga em Sibéria do sul e no Extremo Oriente.

Esta doença é perigoso devido à capacidade do vírus para penetrar o cérebro e a medula espinal, causando desordens de motor, prejuízos cognitivos e, em casos severos, em paralisia e em morte. Cada ano em Rússia, 1,500-2,000 povos são contaminados, com morte neurológica tornando-se das complicações e dos povos 20-100 de aproximadamente 30%.

O micróbio patogénico pertence ao género Flavivirus (igualmente inclui o vírus de Zika e o vírus que causa a febre de dengue) e é transmitido principalmente através das mordidas do tiquetaque. Há três subtipos do vírus: Do leste, Siberian e europeu.

Cada um deles é predominante na região depois do qual é nomeado, embora esta divisão seja bastante grosseira - por exemplo, os casos da infecção com o subtipo Siberian foram observados nos Estados Bálticos e no Sakhalin, e com europeu - em Coreia do Sul e nas montanhas de Altai.

Nos últimos anos, a propagação do vírus expandiu às áreas do norte (península de Kola, região de Arkhangelsk) e às regiões montanhosas (na Europa Central e em Itália). Em 2019, os primeiros exemplos da infecção foram gravados no Reino Unido e nos Países Baixos.

Para responder prontamente à emergência do vírus em territórios novos, é necessário compreender que influências suas propagação e evolução. Os estudos existentes fornecem resultados diferentes, às vezes contraditórios, mas os dados novos recolhidos nos últimos anos podem esclarecer a situação.

Os autores do artigo usaram GenBank - uma base de dados que armazenasse mais de 200 milhão seqüências de nucleotide do RNA e do ADN da vária espécie.

Os dados são fornecidos por cientistas dos países diferentes, e seu volume está crescendo constantemente, em comum com o número de seqüências que descrevem o RNA do vírus tiquetaque-carregado da encefalite - em dez anos o número aumentou cinco vezes mais.

Usando algoritmos do computador, os pesquisadores compararam o RNA dos vírus encontrados em anos diferentes no território de diversos países.

Conhecendo a “distância” (a proporção de nucleotides divergentes) entre amostras e a tâmara de seu recibo, se pode calcular a época da divergência da espécie ou da divisão de uma espécie em subtipos.

Este método é baseado na suposição que a seqüência dos nucleotides em uma única espécie muda em uma taxa aproximadamente constante, e chamado o pulso de disparo molecular. Usando este método, os cientistas calcularam a idade do antepassado comum o mais recente para cada um dos subtipos.

O resultado (aproximadamente 700 e 900 anos para os subtipos Siberian e do leste, respectivamente) é consistente com os estudos mais adiantados, quando a idade do subtipo europeu (aproximadamente 1.600 anos) foi calculada pela primeira vez depois que o vírus foi manchado nos Países Baixos.

Os pesquisadores igualmente tentaram encontrar como os vírus genetically similares do mesmo subtipo terminaram acima em países diferentes em uma distância dos milhares de quilômetros de se. Há diversas explicações possíveis.

Primeiramente, os vírus (ou os tiquetaques contaminados com eles) podem viajar distâncias longas com animais, tais como aves migratórias ou bastões. Em segundo, a actividade humana pode contribuir à propagação do vírus: transporte dos rebanhos animais ou da introdução de animais apropriados para caçar em territórios novos.

O resultado o mais importante do trabalho era que a maioria dos eventos de espalhamento do vírus ocorreram nos últimos três ou quatro séculos, e em muitos casos nós observamos transferência do vírus para milhares de quilômetros nos últimos 50-100 anos, e os vírus em Europa misturaram completamente durante os últimos 100-200 anos. '

Alexander Lukashev, co-autor do estudo e director do instituto da parasitologia médica e da medicina tropical, universidade de Sechenov

“Isto permite que nós considerem a encefalite tiquetaque-carregada como uma doença altamente dinâmica, mesmo como uma doença emergente em muitas regiões, e pensem sobre um factor antropogénico (a propagação de tiquetaques contaminados em conseqüência do transporte de animais domésticos e selvagens) como um dos mecanismos principais atrás da expansão do vírus.”

Além, os cientistas propor um algoritmo que simulasse a compilação das amostras como usado em uns estudos mais adiantados. Com sua ajuda, os autores do artigo mostraram que as diferenças nos resultados de estudos previamente publicados estão explicadas bem pela selecção das seqüências incluídas no estudo.

Source:
Journal reference:

Deviatkin, A. A., et al. (2020) Tick-Borne Encephalitis Virus: An Emerging Ancient Zoonosis? Viruses. doi.org/10.3390/v12020247.