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Los investigadores analizan datos sobre la estructura del ARN del virus señal-soportado de la encefalitis

Los investigadores de la universidad de Sechenov así como colegas de varios institutos rusos analizaban datos sobre la estructura del ARN del virus señal-soportado de la encefalitis.

Mucho más grande que en estudios anteriores, el volumen de los datos del nuevo estudio permitió que estimaran la edad de los subtipos del virus y que rastrearan su extensión en Eurasia. Los resultados del estudio fueron publicados en los virus del gorrón.

la encefalitis Señal-soportada es común en Europa Central y Europa Oriental y una banda ancha en Siberia meridional y el Extremo Oriente.

Esta enfermedad es peligroso debido a la capacidad del virus de penetrar el cerebro y la médula espinal, causando desordenes de motor, debilitaciones y, en casos graves, parálisis cognoscitiva y muerte. Cada año en Rusia, infectan a 1,500-2,000 personas, con la muerte neurológica de las complicaciones y de las personas 20-100 del cerca de 30% que se convierte.

El patógeno pertenece al género Flavivirus (también incluye el virus de Zika y el virus que causa fiebre de dengue) y se transmite principal a través de mordeduras de la señal. Hay tres subtipos del virus: De Extremo Oriente, siberiano y europeo.

Cada uno de ellos es predominante en la región después de lo cual se nombra, aunque esta división sea muy basta - por ejemplo, los casos de la infección con el subtipo siberiano fueron observados en los Estados bálticos y el Sajalín, y con el europeo - en Corea del Sur y las montañas de Altai.

Estos últimos años, la extensión del virus se ha desplegado a las áreas septentrionales (península de cola, región de Arkhangelsk) y a las regiones montañosas (en Europa Central e Italia). En 2019, los primeros casos de la infección fueron registrados en el Reino Unido y los Países Bajos.

Para responder puntualmente a la aparición del virus en nuevos territorios, es necesario entender qué influencias su extensión y evolución. Los estudios existentes ofrecen resultados diversos, a veces contradictorios, pero los nuevos datos cerco estos últimos años pueden clarificar la situación.

Los autores del artículo utilizaron GenBank - una base de datos que salva más de 200 millones de series de nucleótido del ARN y de la DNA de la diversa especie.

Los datos son suministrados por los científicos de los países diferentes, y su volumen está creciendo constante, en común con el número de series que describen el ARN del virus señal-soportado de la encefalitis - en diez años el número ha aumentado cinco veces.

Usando algoritmos de la computador, los investigadores compararon el ARN de los virus encontrados en diversos años en el territorio de varios países.

Conociendo la “distancia” (la proporción de nucleótidos divergentes) entre las muestras y la fecha de su recibo, uno puede estimar la época de la divergencia de la especie o de la división de una especie en subtipos.

Este método se basa en la suposición que la serie de nucleótidos en una única especie cambia a un régimen aproximadamente constante, y se llama el reloj molecular. Usando este método, los científicos estimaban la edad del antepasado común más reciente para cada uno de los subtipos.

El resultado (cerca de 700 y 900 años para los subtipos siberianos y de Extremo Oriente, respectivamente) es constante con estudios anteriores, mientras que la edad del subtipo europeo (cerca de 1.600 años) era estimada por primera vez después de que el virus fuera observado en los Países Bajos.

Los investigadores también intentaron descubrir cómo los virus genético similares del mismo subtipo terminaron hacia arriba en los países diferentes en una distancia de millares de kilómetros de uno a. Hay varias explicaciones posibles.

Primero, los virus (o las señales infectadas con ellos) pueden viajar las distancias largas con los animales, tales como aves migratorias o palos. En segundo lugar, la actividad humana puede contribuir a la extensión del virus: transporte del ganado o de la introducción de animales convenientes para cazar en nuevos territorios.

El resultado más importante del trabajo era que la mayor parte de las acciones que se extendían del virus ocurrieron en los tres o cuatro siglos pasados, y en muchos casos hemos observado la transferencia del virus para los millares de kilómetros en los 50-100 años pasados, y los virus en Europa se han mezclado totalmente durante los 100-200 años pasados. '

Alexander Lukashev, co-autor del estudio y director del instituto de la parasitología médica y del remedio tropical, universidad de Sechenov

“Esto permite que consideremos encefalitis señal-soportada como enfermedad altamente dinámica, incluso durante una enfermedad emergente en muchas regiones, y pensar en un factor antropogénico (la extensión de señales infectadas como resultado del transporte de animales nacionales y salvajes) como uno de los mecanismos principales detrás de la extensión del virus.”

Además, los científicos han propuesto un algoritmo que simula la compilación de muestras como se utiliza en estudios anteriores. Con su ayuda, los autores del artículo mostraron que las diferencias en resultados de estudios previamente publicados son explicadas bien por la selección de las series incluidas en el estudio.

Source:
Journal reference:

Deviatkin, A. A., et al. (2020) Tick-Borne Encephalitis Virus: An Emerging Ancient Zoonosis? Viruses. doi.org/10.3390/v12020247.