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Los nuevos datos pueden ayudar a entender la evolución de las deformaciones austríacas SARS-CoV-2

216 series del genoma SARS-CoV-2 ahora se han terminado y liberado en el marco de la “dinámica mutacional de SARS-CoV-2 en Austria” proyecte de CeMM, el centro de investigación para el remedio molecular de la academia de ciencias austríaca, en la colaboración cercana con la universidad médica de Viena, la universidad médica de Innsbruck y la dependencia austríaca para la salud y la seguridad alimentaria (EDADES).

Estos datos representan otra piedra miliaria en el proyecto y ayudarán a entender el paisaje y la evolución mutacionales de las deformaciones austríacas SARS-CoV-2.

Así como esta baja, los investigadores de CeMM han publicado un Web site dedicado que ofrece la información de fondo así como el acceso interactivo a los datos para los científicos y los laypeople igualmente.

Los genomas del virus se pueden explorar recíprocamente e intuitivo vía las herramientas avanzadas de la visualización ofrecidas por CeMM y el proyecto abierto Nextstrain de la fuente.

La extensión del virus pandémico SARS-CoV-2 en la población humana se resuelve con esfuerzos científicos colaborativos sin precedentes en todo el mundo de desenredar su virológico, inmunológico y enfermedad-causando propiedades.

Las series del genoma de los virus SARS-CoV-2 que circulan por todo el mundo se están publicando y se están haciendo abiertamente disponibles a la comunidad científica internacional.

Una mejor comprensión de la evolución viral será instrumental comprender la dinámica mutacional subyacente y soportar el revelado del tratamiento antivirus efectivo y de estrategias vaccíneas para parar el pandémico COVID-19.

En Austria, los investigadores de CeMM con los socios de la colaboración de la universidad médica de Viena eran pioneros en la secuencia de los primeros genomas obtenidos de muestras paciente-derivadas austriaco. Dentro del ámbito de la “dinámica mutacional de SARS-CoV-2 en Austria” proyecte, las primeras muestras fueron puestas a disposición la comunidad de investigación pública e internacional ya a principios de abril de 2020.

Esta iniciativa altamente colaborativa, llevada por los investigadores principales Andreas Bergthaler de CeMM y el bock de Cristóbal, tiene como objetivo el aclarar de 1.000 genomas SARS-CoV-2 en los pacientes austríacos que usan la siguiente-generación punta que ordena técnicas y análisis de cómputo sofisticados.

El proyecto incluye una red nacional ancha de la colaboración con los socios de la universidad médica de Viena (Judith Aberle, Stephan Aberle, Elisabeth Puchhammer-Stöckl), la universidad médica de Innsbruck (Wegene Borena, Dorotea von Laer; Manfred Nairz, Günter Weiss) y la dependencia austríaca para la salud y seguridad alimentaria (Daniela Schmid, Peter Hufnagl) así como varios hospitales y laboratorios diagnósticos.

El edificio en sus primeras 21 series del genoma publicadas el 3 de abril de 2020, esta segunda baja con 216 nuevos genomas SARS-CoV-2 de enfrente de Austria ofrece un retrato más detallado sobre los virus de circulación y la fase temprana del pandémico COVID-19.

Las diferencias genéticas de los genomas indican que el centro común de virus de circulación en la fase temprana del pandémico era ya altamente diverso, con algunos virus llevando a una transmisión más grande se agrupan que otras. Importantemente, Austria se ha beneficiado del contacto cuidadoso que trazaba por la dependencia austríaca para la salud y la seguridad alimentaria, que definieron más de 250 atados de los casos COVID-19.

Nuestro análisis integrante de la nueva información del genoma SARS-CoV-2 con datos epidemiológicos ofrece nuevos discernimientos valiosos en cómo el virus se ha estado extendiendo a través del país. Los datos de la serie del virus proporcionan el apoyo independiente para muchas de las conclusión epidemiológicas resultando del trazado del contacto.”

Co-coordinador e investigador principal, CEMM de Andreas Bergthaler, del proyecto

“Al mismo tiempo, observamos heterogeneidad dentro de atados y obtuvimos las pruebas de los virus múltiples que circulaban al mismo tiempo,” dice Andreas Bergthaler, el co-coordinador del proyecto y al investigador principal de CeMM (véase el ejemplo 1).

El análisis molecular de la serie reveló por término medio 6,9 mutaciones por el genoma viral, cuyo más de 4 dieron lugar a aminoácidos cambiados. Una atención especial de los descansos mundiales del interés en mutaciones en la proteína viral de S o del pico, que adorna la superficie del virion y presta el coronavirus su epónimo corona-como aspecto.

Esta proteína viral de S es esencial para atar para el receptor celular ACE2 así como el objetivo principal supuesto para los anticuerpos de neutralización.

Como tal, las mutaciones en esta región serán importantes para el revelado de pruebas serológicas y de la protección anticuerpo-mediada por las vacunas. Dentro de todos los genomas austríacos SARS-CoV-2, determinamos un número total de 12 residuos transformados en 1.273 la proteína larga del aminoácido S.

Una mutación determinada en la proteína de S, D614G, representa un punto que se ramifica temprano que sea dominante en los atados de la infección y las partes europeos de Norteamérica (véase los ejemplos 2 y 3).

Esta mutación también se encuentra en muchas de las muestras austríacas. Las consecuencias funcionales potenciales de la mutación de D614G están siendo investigadas actualmente por varios laboratorios internacionales.

Los análisis virales profundizados en curso de la mutación de CeMM con personas interdisciplinarias de los campos de la genómica, del modelado biomathematical, de la biología de la evolución y de la virología rendirán nuevos discernimientos en cómo la proteína de S y otras proteínas virales se desarrollan así como cómo estas mutaciones se transmiten entre los individuos.

La baja de hoy marca otra piedra miliaria crucial mientras que CeMM intensifica sus esfuerzos de comunicar ciencia y de alcanzar fuera al público en general.

De acuerdo con las herramientas del proyecto abierto Nextstrain.org de la fuente, los investigadores de CeMM liberaron una versión de Nextstrain Austria que permite que los utilizadores comparen y que visualicen todos los genomas austríacos ordenados del virus con más de 8.000 genomas del virus de todas partes del mundo.

El blog de Nextstrain Austria ofrecerá historias actualizadas y dato-impulsadas sucintas a los discernimientos interesantes de la parte sobre lo que nos informan los genomas del virus sobre el pandémico SARS-CoV-2. Estas narrativas explorarán los datos reales del genoma generados por CeMM y sus socios, y permiten que los utilizadores exploren el contenido recíprocamente con un diseño intuitivo.

Conducen a los utilizadores a través de diversos tableros de instrumentos donde encuentran gráficos interactivos con un texto explicativo corto en diversos temas relacionados con el virus SARS-CoV-2.

La herramienta de la visualización es disponible en inglés y alemana y se puede alcanzar en https://cemm.at/sars-cov-2/. El blog será contínuo actualizado y dará discernimientos de primera mano en la investigación intensa en curso sobre el virus SARS-CoV-2.

Las personas de proyecto continuarán sus esfuerzos a los genomas virales SARS-CoV-2 de la serie 1.000, que ofrecerán un retrato detallado de mutaciones y de transmisiones virales emergentes del virus.

Esto ofrecerá otros discernimientos científicos valiosos a los epidemiólogos, a los profesionales de la atención sanitaria y a los expertos de la salud pública para fijar las rutas de transmisión del virus así como de su potencial de derribar inmunorespuestas vacuna-inducidas y de detectar resistencia contra las drogas antivirus.