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Étude : Infection de parasite attentivement jointe au renivellement du microbiome gastro-intestinal

Les infections de parasite sont une présence continuelle pour beaucoup de gens qui vivent dans les régions tropicales, en particulier dans moins d'endroits industrialisés. Ces souvent états chroniques sont au mieux désagréables ; plus sérieusement, les enfants avec les maladies de parasite qui entraînent la diarrhée peuvent mourir de la malnutrition ou de la déshydratation.

Dans la biologie de génome, une étude aboutie par des scientifiques d'Université de Pennsylvanie a vérifié les tiges entre l'infection de parasite et le microbiome d'intestin. Suivre des méthodes génétiques pour caractériser le microbiome gastro-intestinal de 575 gens canerounais éthniquement divers représentant des populations de neuf villages avec des différences signicatives dans le mode de vie, les chercheurs ont découvert que la présence des parasites a été fortement associée à la composition générale du microbiome.

Nous avons constaté que nous pourrions regarder quelqu'un microbiome et l'employer pour prévoir si quelqu'un a eu une infection gastro-intestinale de parasite. Si ou non c'était des parasites changeant le microbiome ou quelque chose dans le microbiota résident d'une personne qui les a rendus plus sensibles aux infections, nous ne pouvons pas dire, mais l'association était intense. »

Meagan Rubel, qui a complété son degré de doctorat chez Penn et est maintenant un postdoc à l'Université de Californie, San Diego

Rubel a abouti l'étude en collaboration avec Sarah Tishkoff de Penn, un Penn intègre le professeur de la connaissance dans l'École de Médecine de Perelman et l'école des arts et des sciences, et le débroussailleur de Frederic, un microbiologiste à la Faculté de Médecine. En plus du microbiome et des parasites, la recherche a également examiné des bornes de fonction immunitaire, de digestion de laiterie, et d'infection d'agent pathogène, un ensemble de données riche.

L'enquête a nécessité six mois des travaux sur le terrain, du rassemblement fécal et des prises de sang des pastoralists de Mbororo Fulani, des bergers de bétail avec un haut de régime en viande et de la laiterie ; Les chasseurs-cueilleur de forêt tropicale de Baka et de Bagyeli, qui pratiquent une quantité limitée d'agriculture mais foragent également pour la viande et les nourritures centrale centrale ; et agropastoralists Bantou-parlants, que cultivez les collectes et élevez le bétail. En tant que groupe de comparaison, l'étude a compris des caractéristiques de deux groupes de personnes vivant dans les zones urbaines des Etats-Unis, avec un régime plus lourd en graisses animales, des protéines, et a transformé des nourritures.

Dans le domaine, les chercheurs ont déterminé la malaria et un certain nombre d'autres agents pathogènes qui infectent le sang et le système gastro-intestinal.

Des 575 personnes examinées au Cameroun, les chercheurs ont trouvé que presque 40% étaient infectés avec plus d'un parasite avant de recevoir une demande de règlement antiparasitaire, avec des chasseurs-cueilleur, en moyenne, pour être très probablement Co-infectés avec les parasites multiples. En particulier, l'équipe a constaté que quatre parasites saleté-transmis d'intestin ont tendu Co-à se produire à un régime beaucoup plus haut que chance : Lumbricoides d'ascaride, Necator américanus, trichiura de Trichuris, et stercoralis de Strongyloides, ou FOURMIS.

Les « parasites d'intestin sont une préoccupation globale de santé publique, » dit Rubel. « Et vous tendez à voir plusieurs de ces parasites ensemble dans de moyen-mauvais réglages où les gens peuvent ne pas avoir accès aux soins cliniques, à l'eau courante, et au savon, tellement là est plus d'opportunité pour qu'ils soient transmis. »

De retour dans le laboratoire chez Penn, les chercheurs ont utilisé les outils de ordonnancement génomiques pour prendre un instantané des microbiomes de l'intestin des participants. La composition du microbiome, ils ont trouvé, pourraient exactement prévoir le pays d'une personne (les États-Unis ou le Cameroun) et le mode de vie (urbain, pastoralist, agropastoralist, ou chasseur-cueilleur). Mais après ces deux variables, la présence des parasites de FOURMIS pourrait être prévue avec la grande précision par la structure de microbiome que n'importe quelle autre variable l'équipe de recherche a étudié. Pris ensemble, le microbiome a pu prévoir la présence de ces parasites de quatre intestins avec l'exactitude approximativement de 80%.

L'infection avec ces parasites a également mené aux transactions boursières à un prix plus élevé dans l'activation de système immunitaire, allumant particulièrement les voies qui introduisent des réactions inflammatoires. L'infection de parasite a été également associée à une probabilité plus grande de avoir des bactéries de la commande Bacteroidales, qui sont connues pour jouer un rôle en influençant la fonction système de digestion et de système immunitaire.

À une deuxième partie de l'étude, l'équipe dirigée par Penn a évalué la relation entre le microbiome d'intestin et la consommation de lait dans la population de pastoralist de Fulani. Premiers travaux à côté de Tishkoff et collègues illuminés comment les mutations génétiques activant la digestion de lactose ont surgi dans des communautés de pastoralist en Afrique, sélecté par l'évolution à cause des avantages nutritionnels importants de la laiterie de utilisation. En regardant les microbiomes du Fulani, ils ont également tendu à avoir une abondance de gènes bactériens capables de décomposer la galactose, une composante de lactose, et des graisses, comparées à d'autres groupes. « Cet enrichissement des gènes pourrait vous aider à extraire plus de nutrition de la nourriture que vous mangez, » Rubel dit.

Les chercheurs croient leurs découvertes, la grande-jamais étude sur la tige entre la composition de microbiome d'intestin et l'infection de parasite de l'Afrique Subsaharienne, peut ouvrir des possibilités neuves pour les travaux futurs. « Les genres de bornes de microbiome que nous avons trouvées pourraient être utiles pour prévoir le type d'agents pathogènes vous avez, ou pour jeter la lumière sur l'effet entre le microbiome et le système immunitaire, » dit Rubel.

Éventuellement, il ajoute, plus de recherche pourrait même illuminer des stratégies pour moduler à bon escient le microbiome pour réduire le risque d'une infection de parasite ou pour réduire à un minimum le tort qu'elle entraîne au fuselage.

Source:
Journal reference:

Rubel, M.A., et al. (2020) Lifestyle and the presence of helminths is associated with gut microbiome composition in Cameroonians. Genome Biology. doi.org/10.1186/s13059-020-02020-4.