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Le profil de PIM peut aider à recenser des protéines exprimées par des virus transmis par des moustiques d'aegypti d'aedes

La durée du moustique d'aegypti d'aedes s'échelonne de deux à quatre semaines selon les conditions environnementales, pendant lesquelles la femelle pond environ mille oeufs dans des récipients remplis d'eau près des environnements humains, parce qu'il a besoin de sang humain afin de reproduire et compléter sa durée de vie utile. Les moustiques mâles manquent d'un système sang-alimentant, ainsi seulement les femelles sont en contact avec des êtres humains, agissant en tant que vecteurs des virus de Mayaro, de dengue, de Chikunguya, de fièvre jaune, et de Zika, ainsi que d'autres agents pathogènes. Jusqu'à présent, il n'y a aucune totalement méthode efficace pour éviter ce contact et le dégagement de infection de cette substance.

Afin de déterminer les similitudes et les différences dans la prédisposition intrinsèque de trouble des protéines exprimées par chacun de ces arbovirus et obtenir une « empreinte digital » qui les recense, un ensemble de programmes bioinformatic développés par cette équipe de recherche a été appliqué pour rechercher le profil de méthode d'index® (PIM)®de polarité et les plans intrinsèques de prédisposition de trouble des protéines extraites de la base de données d'UniProt. Ces programmes ont été conçus dans la supposition que les séquences des acides aminés contiennent l'information définissant la capacité d'une protéine donnée de se plier dans la seule structure en trois dimensions ou de rester intrinsèquement désordonnées et déterminant également son fonctionnement prédominant.

Les profils® de PIM et les plans intrinsèques de prédisposition de trouble étaient avec ceux produits pour d'autres groupes de protéine, tels que des bactéries, des champignons et des virus de la base de données d'UniProt, des peptides Cellule-Pénétrants de la base de données de CPP, et deux groupes de protéines intrinsèquement désordonnées, complètement et partiellement désordonné. Cette analyse comparative a caractérisé le groupe d'arbovirus et l'a différencié des autres groupes de protéines en produisant des « empreintes digital » spécifiques qui ont recensé chacun elles.

Les auteurs ont trouvé 1736 protéines du 559.228" » les protéines observées dans la base de données d'UniProt qui a eu un profil assimilé® de PIM aux 29 protéines mutées exprimées par les cinq groupes d'arbovirus. Les découvertes proposent que la caractérisation® de profil de PIM pourrait être utile pour l'identification des protéines exprimées par les virus arthropode-portés transmis par des moustiques d'aegypti d'aedes.

Source:
Journal reference:

Polanco, C., et al. (2020) Bioinformatics-based Identification of Proteins Expressed by Arthropod- borne Viruses Transmitted by Aedes Aegypti Mosquito. Current Proteomics. doi.org/10.2174/1570164617999200422123618.